前列腺癌是一種發(fā)生在男性生殖系統(tǒng)中的十分常見的惡性腫瘤，它的遺傳機制尚未明確。最近幾十年，大量文獻報道了前列腺癌的分子遺傳變異信息，包括突變、缺失、插入、重復(fù)、擴增、甲基化和多態(tài)性等，對于揭示前列腺癌的生物學(xué)機制具有重要的意義。然而，獲取這些數(shù)據(jù)卻是一個非常耗時的過程，目前還沒有一個專注于搜集前列腺癌相關(guān)變異信息的數(shù)據(jù)庫平臺，因此這類數(shù)據(jù)庫的建立就顯得尤為迫切。為了使研究人員能夠便捷的獲取前列腺癌相關(guān)的變異數(shù)據(jù)，我們閱讀了大量文獻，搜集并整理了這些數(shù)據(jù)，最終創(chuàng)建了一個可在線訪問的數(shù)據(jù)庫PCaMDB（http://www.ibio-cn.org/PCAmutbase/home.php/）。該數(shù)據(jù)庫基于目前公認的遺傳變異數(shù)據(jù)平臺LOVD系統(tǒng)，按照基因型到表型的模式，集合了文獻中報道的前列腺癌病人信息和變異信息。這些數(shù)據(jù)可供用戶在線查詢及本地下載，同時用戶還可以提交自己研究發(fā)現(xiàn)的新的變異信息。此外，我們還創(chuàng)建了一個SNP數(shù)據(jù)庫，用于搜集前列腺癌相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)。為了探究這些變異數(shù)據(jù)和前列腺癌之間的聯(lián)系，我們選擇了其中五個變異數(shù)據(jù)較多的蛋白，從蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和保守性的角度對這些突變位點進... 

【文章來源】：蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

本課題工作流程安排

OMIM#176807中和前列腺癌相關(guān)的基因位點

目前已經(jīng)使用LOVD建立的數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址及基因和變異信息統(tǒng)計

【參考文獻】：
博士論文
[1]廣東、重慶、山東、南昌散發(fā)性乳腺癌易感基因多態(tài)性篩選及驗證的研究[D]. 勞海苗.南方醫(yī)科大學(xué) 2012
[2]PEITC抗前列腺癌作用機制的分析研究[D]. 殷平.天津醫(yī)科大學(xué) 2010

碩士論文
[1]前列腺癌演變過程中的等位基因失衡[D]. 張海峰.山西醫(yī)科大學(xué) 2010



本文編號：3439772