目的通過(guò)基因組學(xué)分析建立膀胱癌免疫分型,并進(jìn)一步探索其臨床應(yīng)用價(jià)值。方法從癌癥基因組圖譜研究網(wǎng)絡(luò)（TCGA）數(shù)據(jù)庫(kù)下載409例膀胱癌患者的基因表達(dá)譜及生存信息,通過(guò)單樣本基因集富集分析（ssGSEA）對(duì)患者進(jìn)行分組;采用ESTIMATE及CIBERSORT分別評(píng)估各樣本中免疫微環(huán)境的組成及免疫細(xì)胞的分布;通過(guò)R軟件進(jìn)行富集分析;采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線并對(duì)組間差異進(jìn)行l(wèi)og-rank檢驗(yàn)。結(jié)果將患者分為高、中、低免疫組,三組間預(yù)后具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異;高免疫組所包含的免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞數(shù)量最多,大部分人類白細(xì)胞抗原（HLA）基因及PD-L1的表達(dá)最高;且該組中CD8⁺T細(xì)胞含量最高,M0巨噬細(xì)胞和未活化的記憶性CD4⁺T細(xì)胞最低,基因主要富集在免疫相關(guān)功能及通路上。結(jié)論膀胱癌免疫分型能夠判斷患者的預(yù)后,高免疫組患者的預(yù)后最好,并且具有較高的免疫原性及抗腫瘤免疫活性。 

【文章來(lái)源】：實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志. 2020,36(11)北大核心

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【部分圖文】：

膀胱癌各免疫分型的生存曲線

腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程與宿主的免疫系統(tǒng)密切相關(guān)，免疫系統(tǒng)具有識(shí)別和消滅腫瘤細(xì)胞的功能，但是腫瘤細(xì)胞能夠通過(guò)免疫逃逸和免疫抑制躲避免疫系統(tǒng)的監(jiān)控，目前免疫治療主要包括克服腫瘤的免疫耐受以及激活效應(yīng)細(xì)胞的殺傷作用。既往研究[15-18]發(fā)現(xiàn)，在三陰乳腺癌、結(jié)腸癌、頭頸部鱗癌等多種腫瘤中通過(guò)對(duì)免疫特征進(jìn)行評(píng)估而制定的免疫分型有助于指導(dǎo)治療及改善患者的臨床預(yù)后。本研究通過(guò)分析TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)獲得的基因表達(dá)數(shù)據(jù)，對(duì)膀胱癌患者進(jìn)行免疫分型，并進(jìn)一步分析了各型的免疫特征與預(yù)后之間的關(guān)系。ICIs的療效有賴于腫瘤的免疫原性，目前預(yù)測(cè)PD-1抗體療效的標(biāo)志物主要包括：腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞（tumor-infiltrating lymphocytes,TIL）、腫瘤細(xì)胞PD-L1表達(dá)水平、腫瘤突變負(fù)荷、錯(cuò)配修復(fù)缺陷/微衛(wèi)星高度不穩(wěn)定等[19]。腫瘤微環(huán)境是指腫瘤在其發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中所處的內(nèi)環(huán)境，由腫瘤細(xì)胞本身、間質(zhì)細(xì)胞、微血管、微淋巴管、組織液、眾多細(xì)胞因子及少量浸潤(rùn)細(xì)胞等共同構(gòu)成，腫瘤微環(huán)境在PD-L1的調(diào)節(jié)中起著重要作用，其構(gòu)成與ICIs療效密切相關(guān)[20]。本研究通過(guò)ESTIMATE分析腫瘤微環(huán)境發(fā)現(xiàn)高免疫組包含的免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞數(shù)量最多，并且大部分HLA基因高表達(dá)，與其他兩組相比具有更強(qiáng)的免疫原性，同時(shí)單基因分析發(fā)現(xiàn)高免疫組的PD-L1表達(dá)明顯高于其他兩組，提示高免疫組更適合于免疫治療。

ICIs的療效有賴于腫瘤的免疫原性，目前預(yù)測(cè)PD-1抗體療效的標(biāo)志物主要包括：腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞（tumor-infiltrating lymphocytes,TIL）、腫瘤細(xì)胞PD-L1表達(dá)水平、腫瘤突變負(fù)荷、錯(cuò)配修復(fù)缺陷/微衛(wèi)星高度不穩(wěn)定等[19]。腫瘤微環(huán)境是指腫瘤在其發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中所處的內(nèi)環(huán)境，由腫瘤細(xì)胞本身、間質(zhì)細(xì)胞、微血管、微淋巴管、組織液、眾多細(xì)胞因子及少量浸潤(rùn)細(xì)胞等共同構(gòu)成，腫瘤微環(huán)境在PD-L1的調(diào)節(jié)中起著重要作用，其構(gòu)成與ICIs療效密切相關(guān)[20]。本研究通過(guò)ESTIMATE分析腫瘤微環(huán)境發(fā)現(xiàn)高免疫組包含的免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞數(shù)量最多，并且大部分HLA基因高表達(dá)，與其他兩組相比具有更強(qiáng)的免疫原性，同時(shí)單基因分析發(fā)現(xiàn)高免疫組的PD-L1表達(dá)明顯高于其他兩組，提示高免疫組更適合于免疫治療。圖3 各免疫分型中HLA及PD-L1、CTLA-4的基因表達(dá)水平及組間差異


本文編號(hào)：3377296