IgA腎病患者尿miRNAs表達(dá)譜檢測(cè)及差異miRNAs分析
發(fā)布時(shí)間:2019-09-29 03:22
【摘要】:背景與目的:IgA腎病(IgA Nephropathy, IgAN)是終末期腎病的主要成因之一,早期的診斷和治療對(duì)防止或延緩IgAN病情進(jìn)展至關(guān)重要。已有研究表明,微小RNA (microRNAs, miRNAs)在IgAN的發(fā)病和進(jìn)展中扮演重要角色,IgAN患者尿沉渣中miR-146a、miR-155、miR-93等miRNAs的表達(dá)水平較健康對(duì)照組變化非常顯著,很有可能成為檢測(cè)IgAN的一類新型無創(chuàng)標(biāo)志物。然而目前國內(nèi)外尚無對(duì)IgAN患者尿沉渣中完整miRNAs表達(dá)譜的報(bào)道。因此,本研究旨在通過檢測(cè)尿沉渣miRNAs表達(dá)譜,尋找在IgAN中差異表達(dá)的miRNAs,評(píng)估其診斷性能及與臨床指標(biāo)的相關(guān)性,并通過生物信息學(xué)分析初步探討其在IgAN中可能的作用。方法:本研究設(shè)計(jì)了篩選隊(duì)列和驗(yàn)證隊(duì)列,納入解放軍總醫(yī)院腎臟病科2013年12月至2015年1月首次經(jīng)腎活檢證實(shí)的IgAN患者、膜性腎病(membranous nephropathy, MN)患者和微小病變腎病(minimal changes disease, MCD)患者,其中MN和MCD患者作為疾病對(duì)照組,同時(shí)設(shè)立健康對(duì)照組。采集晨尿標(biāo)本,通過離心法提取尿沉渣。(1)采用Affymetrix miRNA 4.0芯片檢測(cè)篩選隊(duì)列尿沉渣miRNAs的表達(dá)譜,通過芯片顯著性分析比較各組miRNAs的表達(dá)差異。采用實(shí)時(shí)定量PCR (real-time quantitative polymerase chain reaction, RT-qPCR)去重新檢測(cè)篩選隊(duì)列樣本。(2)采用RT-qPCR法檢測(cè)驗(yàn)證隊(duì)列尿沉渣差異miRNAs的表達(dá),繪制受試者作業(yè)特征曲線(receiver operating characteristic curve, ROC)評(píng)估差異miRNAs診斷IgAN的特異度和敏感度。(3)采用生物信息學(xué)軟件miRWalk對(duì)差異miRNAs進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),并應(yīng)用DAVID在線分析軟件對(duì)預(yù)測(cè)的靶基因進(jìn)行GO功能和KEGG通路富集分析。結(jié)果:篩選隊(duì)列納入了18例IgAN患者(其中Lee氏分級(jí)Ⅰ-Ⅱ級(jí)、Ⅲ級(jí)和Ⅳ-V級(jí)患者各6例)、4例MN患者、4例MCD患者和6例健康受試者;驗(yàn)證隊(duì)列納入了102例IgAN患者、41例MN患者、27例MCD患者和34例健康受試者。(1)在篩選隊(duì)列中,miRNA芯片結(jié)果顯示:IgAN組與健康對(duì)照(healthy control,HC)組、MN組和MCD組相比,分別有117種、78種和11種miRNAs的表達(dá)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05且差異倍數(shù)2或0.5),但差異miRNAs之間無交集。在IgAN Ⅰ-Ⅱ級(jí)組和IgAN Ⅲ級(jí)組,分別有4種niRNAs(miR-223-3p、miR-629-5p、 miR-3613-3p和miR-4668-5p)和6種niRNAs(miR-150-5p、miR-371b-5p、miR-572.miR-3613-3p、miR-4668-5p和miR-6750-5p)與各對(duì)照組相比的表達(dá)差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05且差異倍數(shù)2或0.5)。RT-qPCR結(jié)果初步驗(yàn)證了其中7種miRNAs的表達(dá)(miR-150-5p、miR-223-3p、miR-3613-3p、miR-371b-5p、miR-4668-5p、miR-572和miR-629-5p)。(2)在驗(yàn)證隊(duì)列中,RT-qPCR結(jié)果顯示:與HC組、MN組、MCD組相比,IgAN組miR-150-5p的表達(dá)水平顯著升高(P0.05),ROC曲線下面積可達(dá)0.817,敏感度和特異度分別為64.2%和84.8%;miR-3613-3p的表達(dá)水平則顯著降低(P0.01),ROC曲線下面積為0.8,敏感度和特異度分別為67.4%和92.8%。Spearman相關(guān)分析結(jié)果顯示miR-3613-3p的表達(dá)水平與24h尿蛋白定量和Lee氏分級(jí)呈正相關(guān),與腎小球?yàn)V過率呈負(fù)相關(guān),并且在牛津分型為S0的亞組中表達(dá)水平顯著低于S1亞組。(3)生物信息學(xué)分析的結(jié)果顯示:miR-150-5p預(yù)測(cè)的靶基因功能在細(xì)胞增殖、淋巴細(xì)胞的分化、活化和免疫反應(yīng)的調(diào)節(jié)等方面有顯著富集,KEGG信號(hào)通路主要富集在Wnt和MAPK通路。miR-3613-3p預(yù)測(cè)的靶基因主要參與調(diào)控糖代謝和轉(zhuǎn)運(yùn)、B細(xì)胞的活化等方面,并且在Wnt通路也具有顯著富集。結(jié)論:IgAN患者尿沉渣miRNAs表達(dá)譜出現(xiàn)了顯著變化,其中miR-150-5p和miR-3613-3p的表達(dá)水平具有一定特異性,對(duì)IgAN的診斷具有一定提示作用,并且miR-3613-3p的表達(dá)水平有助于評(píng)估患者的病情嚴(yán)重程度,有望成為監(jiān)測(cè)IgAN的無創(chuàng)指標(biāo)。生物信息學(xué)分析顯示miR-150-5p和miR-3613-3p有可能通過調(diào)節(jié)機(jī)體免疫反應(yīng)而參與IgAN的發(fā)病機(jī)制。
【圖文】:
逡逑如維恩圖所示(圖1-3-3),在IgAN組中,有6種miRNAs與MN和MCD組逡逑相比表達(dá)均有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(尸<0.05且FC〉2或<0.5),分別為:miR-378b、miR-逡逑124-3p、miR-3065-3p、miR-429、miR-335-5p邋和邋miR-215-5p;有邋7邋種邋miRNAs邋與邋MN逡逑和HC組相比表達(dá)均有差異(P<邋0.05且FC〉2或<0.5),分別為:miR-150-5p、逡逑miR-25-3p,邋miR-17-3p、miR-425-5p、miR-I30b-3p、miR-2M-3p邋和邋miR-26b-5p;但逡逑上述差異miRNAs之間無交集。逡逑IgAN邋vs邋MN邋IgAN邋vs邋MCD逡逑,
本文編號(hào):2543654
【圖文】:
逡逑如維恩圖所示(圖1-3-3),在IgAN組中,有6種miRNAs與MN和MCD組逡逑相比表達(dá)均有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(尸<0.05且FC〉2或<0.5),分別為:miR-378b、miR-逡逑124-3p、miR-3065-3p、miR-429、miR-335-5p邋和邋miR-215-5p;有邋7邋種邋miRNAs邋與邋MN逡逑和HC組相比表達(dá)均有差異(P<邋0.05且FC〉2或<0.5),分別為:miR-150-5p、逡逑miR-25-3p,邋miR-17-3p、miR-425-5p、miR-I30b-3p、miR-2M-3p邋和邋miR-26b-5p;但逡逑上述差異miRNAs之間無交集。逡逑IgAN邋vs邋MN邋IgAN邋vs邋MCD逡逑,
本文編號(hào):2543654
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/mjlw/2543654.html
最近更新
教材專著