【摘要】：目的:應(yīng)用Solexa技術(shù)分析和篩選出腎臟特異性表達(dá)microRNA(miRNA),同時利用生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測特異表達(dá)miRNA的靶基因并對其功能進(jìn)行初步分析,探討特異表達(dá)miRNA在腎臟中的功能。方法:選取8周齡C57/B6雄性小鼠,取其全身11個組織器官,提取總RNA并從中分離小分子量RNA進(jìn)行Solexa測序,篩選出相較其他組織器官,在腎臟中表達(dá)最為特異的miRNA;然后,利用實時熒光定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(qRTPCR)技術(shù)對篩選出的腎臟特異性表達(dá)miRNA進(jìn)一步驗證;最后,通過生物信息學(xué)技術(shù)對其進(jìn)行靶基因預(yù)測,并對交集的基因集合分別進(jìn)行GO分析和KEGG通路分析。結(jié)果:Solexa測序結(jié)果顯示在正常小鼠中miR-196a和miR-196b在腎臟最特異性高表達(dá)。qRT-PCR驗證了miR-196a和miR-196b在小鼠11個組織器官中的表達(dá)分布情況,定量結(jié)果與測序結(jié)果相一致。TargetScan6.2和PicTar兩個軟件預(yù)測到交集靶基因74個。GO分析顯示miR-196a/b的預(yù)測靶基因集合顯著富集在血小板源生長因子結(jié)合活性、轉(zhuǎn)錄調(diào)控活性、細(xì)胞外基質(zhì)的結(jié)構(gòu)組成等分子功能上并參與調(diào)控代謝、發(fā)育等生物學(xué)過程(P0.01)。信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路顯著富集于促性腺激素釋放激素信號通路、細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用等多個信號通路和腦膠質(zhì)瘤、前列腺癌等疾病通路中(P0.05)。結(jié)論:miR-196a/b在腎臟中特異性高表達(dá),靶基因功能廣泛,與細(xì)胞代謝、生長發(fā)育等密切相關(guān)。
[Abstract]:......
【作者單位】： 南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬金陵醫(yī)院(南京軍區(qū)南京總醫(yī)院)腎臟科國家腎臟疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心全軍腎臟病研究所;南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院醫(yī)藥生物技術(shù)國家重點實驗室江蘇小核糖核酸工程研究中心;
【基金】：國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(973計劃)(2012CB517603)
【分類號】：R692

【共引文獻(xiàn)】

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10 楊q，

本文編號：2473614