泌尿生殖道感染沙眼衣原體PmpF基因多態(tài)性及分布特征
本文選題:沙眼衣原體 切入點(diǎn):泌尿生殖道 出處:《第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年07期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的探討泌尿生殖道感染沙眼衣原體PmpF基因的多態(tài)性及與臨床感染的關(guān)系。方法收集2013年1月到2014年12月于解放軍252醫(yī)院就診患者送檢的泌尿生殖道分泌物標(biāo)本,標(biāo)本處理后使用沙眼衣原體核酸檢測(cè)試劑盒篩選陽(yáng)性標(biāo)本,然后以巢式PCR擴(kuò)增PmpF基因,擴(kuò)增得到的PmpF基因選用4種內(nèi)切酶進(jìn)行酶切及RFLP分析并確定其基因型,根據(jù)PmpF-RFLP結(jié)果,選擇代表菌株測(cè)定PmpF基因序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,進(jìn)一步驗(yàn)證PmpF-RFLP結(jié)果,同時(shí)測(cè)定代表菌株的Omp1基因序列并與參考菌株進(jìn)行比較,從而確定代表菌株的血清型。通過(guò)χ~2檢驗(yàn)探討沙眼衣原體PmpF基因型與患者性別、年齡的關(guān)系以反映其臨床分布特征。結(jié)果 2年間從婦科、泌尿科和皮膚科3個(gè)科室獲得陽(yáng)性標(biāo)本178份,117份標(biāo)本擴(kuò)增得到PmpF基因,PmpF-RFLP將117份標(biāo)本分為3個(gè)Type型,占比分別為2.6%、36.8%、60.7%,挑選26株菌株進(jìn)行Omp1序列測(cè)定,結(jié)果顯示26株菌株屬于D、Da、E、F、G、H、J 7種血清型,統(tǒng)計(jì)學(xué)分析表明PmpF基因型與患者性別、年齡的Fisher精確檢驗(yàn)值分別為0.167、0.008。結(jié)論本地區(qū)引起泌尿生殖道感染的沙眼衣原體可以根據(jù)PmpF基因分成3個(gè)基因型,包括D、Da、E、F、G、H、J 7種血清型,血清型與PmpF基因型無(wú)對(duì)應(yīng)關(guān)系,PmpF基因型與患者年齡有關(guān),與性別無(wú)關(guān)。
[Abstract]:Objective to investigate the polymorphism of Chlamydia trachomatis PmpF gene in urogenital tract infection and its relationship with clinical infection. The positive samples were screened by chlamydia trachomatis nucleic acid detection kit, and the PmpF gene was amplified by nested PCR. The PmpF gene was digested by four endonuclease and RFLP analysis, and its genotype was determined according to the results of PmpF-RFLP. The PmpF gene sequence of the representative strain was selected for phylogenetic analysis to further verify the results of PmpF-RFLP, and the Omp1 gene sequence of the representative strain was determined and compared with the reference strain. The relationship between PmpF genotype of chlamydia trachomatis and sex and age of patients was studied to reflect the clinical distribution characteristics of chlamydia trachomatis. There were 178 positive specimens obtained from 3 departments of urology and dermatology. PmpF gene PmpF-RFLP was amplified from 117 samples. 117 samples were divided into 3 Type types, accounting for 2.6% and 36.8% respectively. 26 strains were selected for Omp1 sequencing. The results showed that the 26 strains belonged to 7 serotypes of Dendazone, and the statistical analysis showed that the genotype of PmpF was associated with the sex of the patients. The accurate test values of Fisher for age were 0.167 0. 008.Conclusion Chlamydia trachomatis caused by genitourinary tract infection in this area can be divided into three genotypes according to PmpF gene, including 7 serotypes of PmpF. There was no correlation between serotype and PmpF genotype.
【作者單位】: 河北北方學(xué)院病原生物學(xué)研究所;保定市第一中心醫(yī)院檢驗(yàn)科;解放軍252醫(yī)院檢驗(yàn)科;
【基金】:河北北方學(xué)院創(chuàng)新人才項(xiàng)目(CXRC1317)~~
【分類號(hào)】:R691.3
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,本文編號(hào):1638373
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