本文關(guān)鍵詞：限制性標(biāo)記基因組掃描分析在前列腺腺癌基因組CpG島的異常甲基化　出處：《南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)》2016年01期 　論文類型：期刊論文

  更多相關(guān)文章： 限制性標(biāo)記基因組掃描 前列腺癌 良性前列腺增生 DNA甲基化 DPYS

【摘要】：目的用限制性標(biāo)記基因組掃描(RLGS)分析前列腺腺癌基因組Cp G島的異常甲基化,為前列腺腺癌相關(guān)基因的甲基化研究奠定基礎(chǔ)。方法采用激光捕獲顯微切割技術(shù)從20例前列腺腺癌和18例良性前列腺增生組織中捕獲均一同質(zhì)的腺體細(xì)胞,提取DNA,利用RLGS技術(shù)對這些樣本基因組Cp G島掃描,比較前列腺腺癌和良性前列腺增生的Cp G島甲基化差異,篩選出參與前列腺腺癌發(fā)生的Cp G島甲基化基因。將其上傳至DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行GO分析,并對篩選出甲基化最顯著的基因DPYS進(jìn)行焦磷酸測序。結(jié)果前列腺腺癌和良性前列腺增生分別有10245個(gè)和8658個(gè)Cp G島發(fā)生甲基化,甲基化發(fā)生率分別為37.2%和30.3%,其中超過60%為啟動(dòng)子區(qū)Cp G島。前列腺腺癌與良性前列腺增生存在差異甲基化的Cp G島有735個(gè),其中高甲基化458個(gè),去甲基化256個(gè)。篩選出DPYS、P16、APC、GSTP1、TMEM122、RARB、ARHGAP20等7個(gè)前列腺腺癌甲基化最顯著的基因。生物信息學(xué)分析提示這些基因涉及多個(gè)分子功能和生物過程,其中DPYS參與了13個(gè)GO注釋的生物功能,50種疾病的發(fā)生發(fā)展和47個(gè)蛋白間的相互作用。對Cp G島7個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行焦磷酸測序,平均甲基化頻率為32.7%�？赡茉谇傲邢傧侔┌l(fā)生發(fā)展中存在重要的意義。結(jié)論 RLGS發(fā)現(xiàn)前列腺腺癌和良性前列腺增生之間存在大量Cp G島高甲基化和去甲基化改變。篩選出甲基化顯著的基因DPYS在前列腺腺癌發(fā)生和發(fā)展中起重要作用,機(jī)制有待進(jìn)一步研究。
[Abstract]:Restriction labeling (RLGS) in the target genome scan analysis of prostate cancer genome Cp G island methylation and lay the foundation for the study on methylation of prostate cancer related genes. DNA extraction method using uniform homogeneous capture laser capture microdissection from 20 cases of prostate cancer and 18 cases of benign prostatic hyperplasia tissues for these samples, glandular cells, genomic Cp G island by RLGS scanning technology, Cp G island methylation difference between adenocarcinoma and benign prostatic hyperplasia of prostate, screened in Cp G island methylation based prostate cancer occurred. Due to upload it to DAVID database by GO analysis, and pyrosequencing of select the most significant methylation of DPYS gene. Results of prostate cancer and benign prostatic hyperplasia were methylated in 10245 and 8658 Cp G island methylation rates were 37.2% and 30.3%, the In more than 60% Cp in the promoter region G island. Prostate cancer and benign prostatic hyperplasia are different methylation of Cp G island has 735, including 458 high methylation, demethylation of 256 selected. DPYS, P16, APC, GSTP1, TMEM122, RARB, ARHGAP20 and other 7 prostate cancer the most significant gene methylation. Bioinformatics analysis revealed that these genes involved in multiple molecular functions and biological processes, including DPYS in 13 GO notes the biological function and interaction of the 50 kinds of diseases and 47 proteins. By pyrosequencing of Cp G island methylation average 7 loci. The frequency of 32.7%. may have important significance in the occurrence and development in prostate adenocarcinoma. Conclusion RLGS found the existence of a large number of Cp G island methylation and demethylation change between prostate cancer and benign prostatic hyperplasia were selected. DPYS gene was methylated in prostatic adenocarcinoma It plays an important role in the development and development, and the mechanism needs to be further studied.

【作者單位】： 廣東省人民醫(yī)院//廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院泌尿外科;廣東省人民醫(yī)院//廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院生殖醫(yī)學(xué)科;
【基金】：廣東省科技計(jì)劃(2011B031800092)
【分類號】：R737.25
【正文快照】： 限制性標(biāo)記基因組掃描(restriction landmarkgenomic scanning,RLGS)是一種有效的基因掃描技 術(shù),能鑒別DNA的放大效應(yīng)和異常的DNA甲基化[1-2]。前列腺癌新發(fā)病例已超越肺癌成為男性惡性腫瘤發(fā)病的第一位[3]。目前國內(nèi)外依然使用前列腺特異性抗原(PSA)和直腸指檢對前列腺癌進(jìn)

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本文編號：1411609