本文關(guān)鍵詞：宮頸癌中轉(zhuǎn)移相關(guān)基因MTA1高表達(dá)的臨床意義及其協(xié)同表達(dá)基因的生物信息學(xué)分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的分析轉(zhuǎn)移相關(guān)基因MTA1高表達(dá)與宮頸癌臨床轉(zhuǎn)移的相關(guān)性,并篩選MTA1協(xié)同表達(dá)基因網(wǎng)絡(luò)中的潛在干預(yù)靶點基因。方法應(yīng)用SPSS軟件分析TCGA-CESC數(shù)據(jù)集中MTA1與宮頸癌轉(zhuǎn)移和病理分級的相關(guān)性,應(yīng)用edge R軟件分析該數(shù)據(jù)集中MTA1高表達(dá)組與低表達(dá)組的全轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)基因,應(yīng)用DAVID平臺對這些差異表達(dá)基因進行聚類分析,應(yīng)用STRING在線平臺和Cytospace軟件對這些基因進行互作網(wǎng)絡(luò)分析,篩選關(guān)鍵的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點基因。結(jié)果TCGA-CESC宮頸癌數(shù)據(jù)庫中MTA1表達(dá)水平與腫瘤臨床轉(zhuǎn)移和病理分級呈顯著正相關(guān)(P0.01),在不同MTA1表達(dá)水平的宮頸癌轉(zhuǎn)錄組中存在顯著且較一致的差異表達(dá)基因集,這些基因主要聚集在癌癥通路、干細(xì)胞通路、細(xì)胞轉(zhuǎn)移、細(xì)胞分化等方面,與腫瘤的惡性生物學(xué)行為顯著相關(guān)�；蚝Y選顯示,宮頸癌中與MTA1協(xié)同表達(dá)的Agt、Acta1、Fpr2、Pmch和RGS18等基因是差異表達(dá)基因集中最重要的節(jié)點基因,這些基因聚集在GPCR相關(guān)通路。結(jié)論 MTA1高表達(dá)與宮頸癌轉(zhuǎn)移顯著相關(guān),且與腫瘤細(xì)胞的干細(xì)胞通路、趨化因子受體通路、細(xì)胞轉(zhuǎn)移、細(xì)胞分化等基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)活化相關(guān)。MTA1的協(xié)同表達(dá)基因網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點基因可能參與了宮頸癌的轉(zhuǎn)移調(diào)控,并最有可能成為宮頸癌治療的分子靶點。
【作者單位】： 唐山市開灤總醫(yī)院婦產(chǎn)科;中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院腫瘤醫(yī)院分子腫瘤學(xué)國家重點實驗室;首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京婦產(chǎn)醫(yī)院婦科微創(chuàng)中心;
【關(guān)鍵詞】： 轉(zhuǎn)移相關(guān)基因 宮頸腫瘤 計算機生物學(xué)
【基金】：國家自然科學(xué)基金(81572842,81372159) 北京市自然科學(xué)基金(7132071) 北京市衛(wèi)生系統(tǒng)高層次衛(wèi)生技術(shù)人才學(xué)科骨干項目(2015-3-090)~~
【分類號】：R737.33
【正文快照】： 宮頸癌的發(fā)病率在世界范圍內(nèi)居女性惡性腫n i h.go v/tc ga/tc ga Ca n c e r D e t a i l s.j s p?d i s ea s e Ty p e=瘤的第三位,僅次于乳腺癌和結(jié)直腸癌,每年約有C E S Cd i s e a s e Na m e=C e r v i c a l%2 0 s q u a m o u s%2 050萬新發(fā)病例及半數(shù)死亡病例[1-3]

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：466654