本文關(guān)鍵詞：卵巢癌相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA的生物信息學(xué)挖掘，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：探討卵巢癌中差異表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,從NCBI基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)GEO下載卵巢癌基因芯片數(shù)據(jù)GSE14407,用SAM軟件輸出差異表達(dá)的基因,對(duì)其進(jìn)行重注釋并篩選出其中的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,用Gene Cluster和Tree View軟件驗(yàn)證SAM軟件分析結(jié)果。針對(duì)該芯片數(shù)據(jù),篩出133個(gè)在卵巢癌中表達(dá)有差異的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,其中112個(gè)上調(diào),21個(gè)下調(diào),且這些長(zhǎng)鏈非編碼RNA的表達(dá)倍數(shù)均2或0.5,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(q值0.05)。用生物信息學(xué)方法挖掘普通基因芯片中卵巢癌相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA是十分有效的方法,可為卵巢癌相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA的探索提供新途徑。
【作者單位】： 中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)系;湖南省腫瘤醫(yī)院;
【關(guān)鍵詞】： 卵巢癌 長(zhǎng)鏈非編碼RNA 基因芯片 生物信息學(xué)
【基金】：中南大學(xué)研究生科研創(chuàng)新項(xiàng)目(2016zzts502)資助
【分類(lèi)號(hào)】：R737.31;R730.43
【正文快照】： Bioinformatics Mining of Relevant Long Non-Coding RNA in OvarianCancerHe Li1Deng Hongyu2Wang Xiaochun1*1 Department of Medical Laboratory,Xiangya School of Medicine,Central South University,Changsha,410013;2 Hunan Cancer Hospital,Changsha,410013*Correspo

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本文編號(hào)：445105