目的:1.通過全外顯子測序分析卵巢癌患者基因組突變情況,聯(lián)合HLA分型結(jié)果預(yù)測并篩選潛在的腫瘤新抗原。2.新抗原在體外進(jìn)行抗原性驗(yàn)證,篩選出能刺激機(jī)體產(chǎn)生免疫反應(yīng)的新抗原多肽,為新抗原在卵巢癌治療中的應(yīng)用提供可行的研究方法和實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。3.初步探索卵巢癌腫瘤類器官的培養(yǎng)體系,為后續(xù)篩選出的新抗原肽誘導(dǎo)CTL殺傷腫瘤實(shí)驗(yàn)提供個體化特異性模型。方法:1.卵巢癌組織、對應(yīng)全血的DNA進(jìn)行全外顯子測序,利用Polysolver軟件預(yù)測HLAⅠ分型,利用Mutect、Mutect2以及edico軟件檢測體細(xì)胞突變,ANNOVAR v2015Jun16軟件對SNV/InDel進(jìn)行注釋,聯(lián)合突變信息和HLA分型結(jié)果,運(yùn)用NetMHC4.0、NetMHCpan4.0、PSSMHCpan、PickPocket和SMM算法軟件進(jìn)行新抗原預(yù)測,以IC50<20nM作為閾值對結(jié)果進(jìn)行過濾,取在5個軟件中有≥3個的IC50值<20nM的突變抗原作為最終候選抗原肽。2.將預(yù)測的新抗原肽人工合成后刺激人外周血單個核細(xì)胞,通過ELISPOT檢測分泌IFN-γ的細(xì)胞數(shù)量間接檢測新抗原肽的體外康源特性。3.收取...

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【學(xué)位級別】：碩士

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圖1-1.P1-P5卵巢癌及癌旁組織內(nèi)突變情況

20圖1-1.P1-P5卵巢癌及癌旁組織內(nèi)突變情況utationsinP1-P5ovariancancerandpara-canceroustissues.T1representstheprimasentsthefallopiantube,andT....

圖1-2.9例卵巢癌樣本原發(fā)灶突變情況

圖1-2.9例卵巢癌樣本原發(fā)灶突變情況Figure1-2.Mutationsof9primaryovariancancers圖1-3.NetMHC4.0預(yù)測P5的新抗原肽結(jié)果之一Figure1-3.NetMHC4.0predictedoneof....

圖1-3.NetMHC4.0預(yù)測P5的新抗原肽結(jié)果之一Figure1-3.NetMHC4.0predictedoneofthenewantigensofP5

圖1-2.9例卵巢癌樣本原發(fā)灶突變情況Figure1-2.Mutationsof9primaryovariancancers

圖1-4.NetMHCpan4.0預(yù)測P5的新抗原肽結(jié)果之一Figure1-4.NetMHCpan4.0predictedoneofthenewantigensofP5

圖1-4.NetMHCpan4.0預(yù)測P5的新抗原肽結(jié)果之一Figure1-4.NetMHCpan4.0predictedoneofthenewantigensofP54.討論腫瘤免疫治療是目前腫瘤治療的研究熱門，已經(jīng)成為繼手術(shù)治療、化療和放療之后的第....

本文編號：3921342