去泛素化酶OTUD5與CacyBP的相互作用及OTUD5在宮頸癌中的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2023-05-18 19:19
目的研究發(fā)現(xiàn),OTUD5(OTU deubiquitinase 5)作為OTU亞家族中的重要成員之一,在DNA損傷修復(fù)和免疫學(xué)領(lǐng)域扮演著重要角色。目前來說OTUD5的研究相對較少,并且其是否能夠被調(diào)控仍未知。鈣周期素結(jié)合蛋白(Calcyclin binding protein,CacyBP)在小鼠艾氏腹水細(xì)胞瘤中以S100A6蛋白的靶分子形式發(fā)現(xiàn)。研究發(fā)現(xiàn)CacyBP影響多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展,此外已有報(bào)道表明在人膠質(zhì)瘤細(xì)胞中過表達(dá)CacyBP下調(diào)p53的蛋白水平。目前,OTUD5在腫瘤中的功能尚不清楚,通過生物信息學(xué)分析OTUD5在宮頸癌中的表達(dá)給相關(guān)研究提供借鑒。去泛素化酶OTUD5是否與CacyBP相互作用和對宮頸癌的調(diào)控尚不清楚。方法利用Western blot實(shí)驗(yàn)檢測OTUD5或CacyBP過表達(dá)后外源底物蛋白的變化。采用RNA干擾技術(shù)敲低OTUD5或CacyBP后檢測內(nèi)源底物蛋白的變化。采用實(shí)時定量PCR(qRT-PCR)檢測OTUD5或CacyBP過表達(dá)對底物mRNA水平的影響。利用半衰期實(shí)驗(yàn)檢測CacyBP過表達(dá)后底物蛋白OTUD5的降解速率,探討CacyBP對OTUD5穩(wěn)...
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
引言
材料與方法
1.實(shí)驗(yàn)材料
1.1 細(xì)胞
1.2 實(shí)時定量PCR引物序列
1.3 主要試劑
2.實(shí)驗(yàn)方法
2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2 細(xì)菌培養(yǎng)
2.3 蛋白的提取
2.4 體內(nèi)泛素化實(shí)驗(yàn)
2.5 半衰期實(shí)驗(yàn)
2.6 免疫共沉淀
2.7 RNA抽提
2.8 反轉(zhuǎn)錄PCR
2.9 GEPIA
2.10 Oncomine分析
2.11 UALCAN分析
2.12 Linked Omics分析
2.13 Gene MANIA分析
2.14 cBio Portal分析
2.15 GO分析和KEGG分析
2.16 Kaplan-Meier繪圖
結(jié)果
1.去泛素化酶OTUD5與CacyBP的相互作用
1.1 CacyBP調(diào)節(jié)OTUD5 的蛋白穩(wěn)定性并促進(jìn)其泛素化
1.2 CacyBP應(yīng)答DNA損傷
1.3 OTUD5 調(diào)控CacyBP的泛素化水平并促進(jìn)其入核
2.去泛素化酶 OTUD5 在宮頸癌組織中的表達(dá)及其生物信息學(xué)功能分析
2.1 OTUD5在CESC中異常低水平表達(dá),預(yù)后不良
2.2 OTUD5表達(dá)與宮頸癌臨床病理特征的關(guān)系
2.3 CESC中 OTUD5 共表達(dá)基因的富集分析
2.4 在CESC中 ,潛在的調(diào)節(jié)OTUD5 m RNA水平的mi RNA和轉(zhuǎn)錄因子
2.5 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)和與OTUD5 相互作用的蛋白質(zhì)的富集分析
結(jié)論
討論
參考文獻(xiàn)
綜述
綜述參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
縮略詞表
致謝
本文編號:3818833
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
引言
材料與方法
1.實(shí)驗(yàn)材料
1.1 細(xì)胞
1.2 實(shí)時定量PCR引物序列
1.3 主要試劑
2.實(shí)驗(yàn)方法
2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2 細(xì)菌培養(yǎng)
2.3 蛋白的提取
2.4 體內(nèi)泛素化實(shí)驗(yàn)
2.5 半衰期實(shí)驗(yàn)
2.6 免疫共沉淀
2.7 RNA抽提
2.8 反轉(zhuǎn)錄PCR
2.9 GEPIA
2.10 Oncomine分析
2.11 UALCAN分析
2.12 Linked Omics分析
2.13 Gene MANIA分析
2.14 cBio Portal分析
2.15 GO分析和KEGG分析
2.16 Kaplan-Meier繪圖
結(jié)果
1.去泛素化酶OTUD5與CacyBP的相互作用
1.1 CacyBP調(diào)節(jié)OTUD5 的蛋白穩(wěn)定性并促進(jìn)其泛素化
1.2 CacyBP應(yīng)答DNA損傷
1.3 OTUD5 調(diào)控CacyBP的泛素化水平并促進(jìn)其入核
2.去泛素化酶 OTUD5 在宮頸癌組織中的表達(dá)及其生物信息學(xué)功能分析
2.1 OTUD5在CESC中異常低水平表達(dá),預(yù)后不良
2.2 OTUD5表達(dá)與宮頸癌臨床病理特征的關(guān)系
2.3 CESC中 OTUD5 共表達(dá)基因的富集分析
2.4 在CESC中 ,潛在的調(diào)節(jié)OTUD5 m RNA水平的mi RNA和轉(zhuǎn)錄因子
2.5 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)和與OTUD5 相互作用的蛋白質(zhì)的富集分析
結(jié)論
討論
參考文獻(xiàn)
綜述
綜述參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
縮略詞表
致謝
本文編號:3818833
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/fuchankeerkelunwen/3818833.html
最近更新
教材專著