目的研究發(fā)現(xiàn),OTUD5(OTU deubiquitinase 5)作為OTU亞家族中的重要成員之一,在DNA損傷修復和免疫學領(lǐng)域扮演著重要角色。目前來說OTUD5的研究相對較少,并且其是否能夠被調(diào)控仍未知。鈣周期素結(jié)合蛋白(Calcyclin binding protein,CacyBP)在小鼠艾氏腹水細胞瘤中以S100A6蛋白的靶分子形式發(fā)現(xiàn)。研究發(fā)現(xiàn)CacyBP影響多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展,此外已有報道表明在人膠質(zhì)瘤細胞中過表達CacyBP下調(diào)p53的蛋白水平。目前,OTUD5在腫瘤中的功能尚不清楚,通過生物信息學分析OTUD5在宮頸癌中的表達給相關(guān)研究提供借鑒。去泛素化酶OTUD5是否與CacyBP相互作用和對宮頸癌的調(diào)控尚不清楚。方法利用Western blot實驗檢測OTUD5或CacyBP過表達后外源底物蛋白的變化。采用RNA干擾技術(shù)敲低OTUD5或CacyBP后檢測內(nèi)源底物蛋白的變化。采用實時定量PCR(qRT-PCR)檢測OTUD5或CacyBP過表達對底物mRNA水平的影響。利用半衰期實驗檢測CacyBP過表達后底物蛋白OTUD5的降解速率,探討CacyBP對OTUD5穩(wěn)...

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
引言
材料與方法
    1.實驗材料
        1.1 細胞
        1.2 實時定量PCR引物序列
        1.3 主要試劑
    2.實驗方法
        2.1 細胞培養(yǎng)
        2.2 細菌培養(yǎng)
        2.3 蛋白的提取
        2.4 體內(nèi)泛素化實驗
        2.5 半衰期實驗
        2.6 免疫共沉淀
        2.7 RNA抽提
        2.8 反轉(zhuǎn)錄PCR
        2.9 GEPIA
        2.10 Oncomine分析
        2.11 UALCAN分析
        2.12 Linked Omics分析
        2.13 Gene MANIA分析
        2.14 cBio Portal分析
        2.15 GO分析和KEGG分析
        2.16 Kaplan-Meier繪圖
結(jié)果
    1.去泛素化酶OTUD5與CacyBP的相互作用
        1.1 CacyBP調(diào)節(jié)OTUD5 的蛋白穩(wěn)定性并促進其泛素化
        1.2 CacyBP應答DNA損傷
        1.3 OTUD5 調(diào)控CacyBP的泛素化水平并促進其入核
    2.去泛素化酶 OTUD5 在宮頸癌組織中的表達及其生物信息學功能分析
        2.1 OTUD5在CESC中異常低水平表達,預后不良
        2.2 OTUD5表達與宮頸癌臨床病理特征的關(guān)系
        2.3 CESC中 OTUD5 共表達基因的富集分析
        2.4 在CESC中 ,潛在的調(diào)節(jié)OTUD5 m RNA水平的mi RNA和轉(zhuǎn)錄因子
        2.5 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(PPI)和與OTUD5 相互作用的蛋白質(zhì)的富集分析
結(jié)論
討論
參考文獻
綜述
    綜述參考文獻
攻讀學位期間的研究成果
縮略詞表
致謝



本文編號：3818833