目的:統(tǒng)計PIK3CA突變在子宮內(nèi)膜樣腺癌(EEC)中的發(fā)生情況,研究PIK3CA突變與預后的關系,探索PIK3CA突變相關的分子機制,嘗試以PIK3CA突變及突變相關的基因構建子宮內(nèi)膜樣腺癌的預后預測模型,用生信方法和實驗方法驗證模型的效能,開發(fā)模型應用于臨床的工具,并且探索模型的分子機制。內(nèi)容:從TCGA獲取EEC患者相關信息,將患者分為PIK3CA突變組和野生組,比較兩組患者的總生存(OS)和無進展生存(PFS)。篩選突變相關的差異表達基因(DEGs),再用卡普蘭-邁耶(KM)生存分析和最小絕對值收斂和選擇算子(LASSO)回歸分析篩出預后相關的DEGs。將患者隨機分為訓練集和驗證集。在訓練集中建立COX回歸模型,將患者分為高危組和低危組,對其進行生存分析、繪制時間受試者工作特征(ROC)曲線并計算曲線下面積(AUC),再在驗證集驗證。將風險評分模型與其它分子分型工具進行比較。對模型進行單因素和多因素cox回歸分析,開發(fā)臨床應用工具并驗證。通過加權基因共表達網(wǎng)絡分析,探索模型相關的分子機制,進行免疫細胞浸潤分析,完成模型驗證的部分實驗。方法:所有的處理均通過R語言實現(xiàn)。數(shù)據(jù)的下載...

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
縮略語
前言
    研究現(xiàn)狀、成果
    研究目的、方法
對象和方法
    1.對象
    2.方法
        2.1 通過R語言篩選構建預后模型的基因
        2.2 通過R語言構建、驗證預后模型
        2.3 通過WGCNA和 GSVA探索模型的分子機制
        2.4 通過分子實驗驗證模型
    3 統(tǒng)計分析
結果
    1.PIK3CA突變影響EEC患者的預后
    2.PIK3CA突變影響EEC患者的基因表達
    3.篩選出6個影響預后的DEGs
    4.構建和驗證預后預測模型
    5.預后預測模型的臨床應用及評價
    6.預后預測模型與TCGA分子分型方法的比較
    7.預后預測模型的WGCNA分析
    8.預后預測模型的免疫浸潤分析
    9.預后預測模型的部分實驗驗證
討論
結論
參考文獻
綜述 PIK3CA突變在子宮內(nèi)膜癌中的研究進展
    綜述參考文獻
致謝
個人簡歷



本文編號：3789440