子宮內(nèi)膜異位癥患者陰道菌群特征性研究與功能預(yù)測
發(fā)布時(shí)間:2022-10-31 21:16
目的:探討內(nèi)異癥患者陰道內(nèi)特征性細(xì)菌群落,找出相關(guān)細(xì)菌種類,通過功能預(yù)測探索細(xì)菌與內(nèi)異癥患者交聯(lián)的相關(guān)功能通路。方法:納入受試者58例,每例患者分別于宮頸口和陰道后穹窿取樣,最終診斷根據(jù)其手術(shù)記錄和病理結(jié)果分類,其中內(nèi)異癥患者32例(55.17%),對(duì)照組患者26例(44.83%)。對(duì)采樣標(biāo)本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其中1例后穹窿標(biāo)本擴(kuò)增失敗,共115例樣本。使用一代Illumina測序?qū)τ诩?xì)菌16s核糖體RNA(16s-rRNA)的高變區(qū)V3V4片段測序,原始數(shù)據(jù)經(jīng)拼接、過濾后進(jìn)行可視化操作并且挖掘細(xì)菌組學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù),使用KEGG作為參考數(shù)據(jù)庫進(jìn)行功能預(yù)測。結(jié)果:內(nèi)異癥患者與對(duì)照組的α多樣性無顯著差異,PCoA距離矩陣分析也并未見顯著差異。內(nèi)異癥患者中,陰道奇異菌(Atopobium Vaginalis)和Howardella Ureilytica顯著增多,短雙歧桿菌(Bifidobaterium Breve)和陰道加德納菌(Gardnerella Vaginalis)顯著減少。功能預(yù)測方面,磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)、乳果糖與甘露糖代謝、氨基糖與核苷酸糖代謝這三種功能在內(nèi)異癥患者中顯著增加,而半胱氨酸與...
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 資料與方法
1.2 方法
1.2.1 標(biāo)本收集
1.2.2 16s核糖體RNA(16s ribosomal RNA)測序
1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié) 果
2.1 樣本收集
2.2 陰道微生物組學(xué)特征性研究
2.2.1 微生物組學(xué)α多樣性
2.2.2 β多樣性的差異
2.2.3 多維度距離矩陣的比較
2.2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方面
2.2.5 微生物的功能預(yù)測(Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States,PICRUSt)
3 討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]胃腸道微生物與子宮內(nèi)膜異位癥發(fā)生發(fā)展的關(guān)系及其臨床意義[J]. 徐曉璇,冷金花. 中華婦產(chǎn)科雜志. 2018 (07)
本文編號(hào):3699731
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 資料與方法
1.2 方法
1.2.1 標(biāo)本收集
1.2.2 16s核糖體RNA(16s ribosomal RNA)測序
1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié) 果
2.1 樣本收集
2.2 陰道微生物組學(xué)特征性研究
2.2.1 微生物組學(xué)α多樣性
2.2.2 β多樣性的差異
2.2.3 多維度距離矩陣的比較
2.2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方面
2.2.5 微生物的功能預(yù)測(Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States,PICRUSt)
3 討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]胃腸道微生物與子宮內(nèi)膜異位癥發(fā)生發(fā)展的關(guān)系及其臨床意義[J]. 徐曉璇,冷金花. 中華婦產(chǎn)科雜志. 2018 (07)
本文編號(hào):3699731
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