目的:利用生物信息學方法探索抗HER2藥物曲妥珠單抗和帕妥珠單抗聯(lián)合治療卵巢癌的潛在治療靶點。方法:從GEO數(shù)據(jù)庫中提取基因芯片數(shù)據(jù)GSE31432。使用GEO2R工具在對照組、兩種單藥治療組和聯(lián)合治療組中找出差異表達基因。隨后進行GO功能和KEGG途徑富集分析,以鑒定差異表達基因的途徑和功能。對這些基因進行PPI分析,并通過Cytoscape軟件進行可視化,再使用GEPIA和Kaplan-Meier分析工具評估卵巢癌患者關鍵基因的差異表達和預后價值。隨后在卵巢癌細胞系中驗證KIF23基因的表達,敲除KIF23基因觀察細胞系的增殖改變以及對動物成瘤的影響。再驗證聯(lián)合用藥組中KIF23基因的表達差異,并且過表達KIF23基因后觀察聯(lián)合用藥組卵巢癌細胞系增殖的改變。結果:總共確定了342個下調的差異表達基因,其中KIF23基因被確定為卵巢癌聯(lián)合化療機制中的潛在關鍵基因。KIF23基因在卵巢癌細胞系中的表達高于正常細胞系,且敲除KIF23基因后,卵巢癌細胞的增殖降低。與對照組、單藥治療組相比,聯(lián)合治療組KIF23基因的mRNA表達顯著降低。聯(lián)合治療組顯著抑制卵巢癌的增殖,而KIF23基因過表... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 細胞培養(yǎng)
    1.2 篩選數(shù)據(jù)庫信息
    1.3 GEO2R進行數(shù)據(jù)分析
    1.4 差異表達基因的GO功能和KEGG途徑分析
    1.5 PPI網(wǎng)絡分析和關鍵基因識別
    1.6 RNA提取和定量實時PCR(qRT-PCR)
    1.7 Western blot法檢測
    1.8 增殖實驗
    1.9 動物體內成瘤實驗
    1.10 統(tǒng)計分析
2 結 果
    2.1 篩選差異表達基因
    2.2 下調差異表達基因的功能富集分析
    2.3 PPI網(wǎng)絡分析與關鍵基因識別
    2.4 KIF23基因的表達和預后分析
    2.5 KIF23基因促進卵巢癌細胞系增殖
    2.6 曲妥珠單抗和帕妥珠單抗通過調節(jié)KIF23影響卵巢癌細胞增殖
3 討 論



本文編號：3671750