目的:利用生物信息學(xué)方法探索抗HER2藥物曲妥珠單抗和帕妥珠單抗聯(lián)合治療卵巢癌的潛在治療靶點(diǎn)。方法:從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中提取基因芯片數(shù)據(jù)GSE31432。使用GEO2R工具在對(duì)照組、兩種單藥治療組和聯(lián)合治療組中找出差異表達(dá)基因。隨后進(jìn)行GO功能和KEGG途徑富集分析,以鑒定差異表達(dá)基因的途徑和功能。對(duì)這些基因進(jìn)行PPI分析,并通過(guò)Cytoscape軟件進(jìn)行可視化,再使用GEPIA和Kaplan-Meier分析工具評(píng)估卵巢癌患者關(guān)鍵基因的差異表達(dá)和預(yù)后價(jià)值。隨后在卵巢癌細(xì)胞系中驗(yàn)證KIF23基因的表達(dá),敲除KIF23基因觀察細(xì)胞系的增殖改變以及對(duì)動(dòng)物成瘤的影響。再驗(yàn)證聯(lián)合用藥組中KIF23基因的表達(dá)差異,并且過(guò)表達(dá)KIF23基因后觀察聯(lián)合用藥組卵巢癌細(xì)胞系增殖的改變。結(jié)果:總共確定了342個(gè)下調(diào)的差異表達(dá)基因,其中KIF23基因被確定為卵巢癌聯(lián)合化療機(jī)制中的潛在關(guān)鍵基因。KIF23基因在卵巢癌細(xì)胞系中的表達(dá)高于正常細(xì)胞系,且敲除KIF23基因后,卵巢癌細(xì)胞的增殖降低。與對(duì)照組、單藥治療組相比,聯(lián)合治療組KIF23基因的mRNA表達(dá)顯著降低。聯(lián)合治療組顯著抑制卵巢癌的增殖,而KIF23基因過(guò)表... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 細(xì)胞培養(yǎng)
    1.2 篩選數(shù)據(jù)庫(kù)信息
    1.3 GEO2R進(jìn)行數(shù)據(jù)分析
    1.4 差異表達(dá)基因的GO功能和KEGG途徑分析
    1.5 PPI網(wǎng)絡(luò)分析和關(guān)鍵基因識(shí)別
    1.6 RNA提取和定量實(shí)時(shí)PCR(qRT-PCR)
    1.7 Western blot法檢測(cè)
    1.8 增殖實(shí)驗(yàn)
    1.9 動(dòng)物體內(nèi)成瘤實(shí)驗(yàn)
    1.10 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié) 果
    2.1 篩選差異表達(dá)基因
    2.2 下調(diào)差異表達(dá)基因的功能富集分析
    2.3 PPI網(wǎng)絡(luò)分析與關(guān)鍵基因識(shí)別
    2.4 KIF23基因的表達(dá)和預(yù)后分析
    2.5 KIF23基因促進(jìn)卵巢癌細(xì)胞系增殖
    2.6 曲妥珠單抗和帕妥珠單抗通過(guò)調(diào)節(jié)KIF23影響卵巢癌細(xì)胞增殖
3 討 論



本文編號(hào)：3671750