宮頸癌是全球女性癌癥死亡的主要原因之一,其發(fā)病率在女性中居第二位。高危型HPV （Human papilloma virus,人乳頭狀瘤病毒）是導致宮頸癌發(fā)生的主要危險因素。HPV的DNA可以在超過90%的宮頸鱗癌和超過50%的宮頸腺癌中檢測到。HPV是雙鏈環(huán)狀DNA病毒,高危型的HPV編碼的病毒蛋白E6和E7在癌癥發(fā)生發(fā)展的過程起重要作用,影響細胞周期進程和細胞凋亡的過程。盡管多價HPV預防性疫苗早已研發(fā)成功且目前已在中國大陸上市,但對于已經(jīng)感染或免疫力低下的人效果有限。高危型HPV的致病機制尚未完全闡明,因此深入理解HPV的致病機制仍然是有效防治宮頸癌及其相關癌癥的重要前提。為了探索高危型HPV的致病機制,本研究通過對TCGA （The Cancer Genome Atlas - Cancer Genome）公共數(shù)據(jù)庫中宮頸癌樣本的生物信息學分析,建立了宮頸癌高表達基因譜及相關基因啟動子DNA甲基化狀態(tài)分值表;通過液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜（LC-MS/MS）技術對E7表達的細胞與對照細胞細胞核蛋白組進行非標記定量分析,發(fā)現(xiàn)了E7穩(wěn)定表達的細胞與對照細胞相比差異表達的蛋白組;并對TCGA數(shù)據(jù)... 

【文章來源】：山東大學山東省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：142 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１－２．?ＴＣＧＡ數(shù)據(jù)及ＲＮＡ－ｓｅｑ數(shù)據(jù)共有上調(diào)蛋白的互作網(wǎng)絡及通路分析

?生存率低于ＵＨＲＦ１低表達組，表明ＵＨＲＦ１高表達的患者可能預后不良，提示??ＵＨＲＦ１的促癌作用（圖１－３Ｃ）。??圉??Ｃ??〇??Ｉ?；．??差?：．；??爸?丨丨?；：：?＇??＾?ｉ?ｍ?：，Ｌｔ?／ｊｆ?ｌ?．」」卜！?］）?４?ｉ；〇?ｊ?．?ｉ」／）?｝ｊ?）一」ａ』／：．??ｍ聚游您潑效客％徽您效銳夠效駿微微戮夠效微竣軟微??Ｂ?Ｃ??Ｃａｎｃｅｒ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ???Ｄｉｓｅａｓｅ?Ｆｒｅｅ?Ｓｕｒｖｉｖａｌ???２?＇ｌｙ．?——Ｌｏｗ?ＵＨＲＦ１／ＧＡＰＤＨ?ＴＰＭ??ＴＡ?——Ｈｉｇｈ?ＵＨＲＦ１／ＧＡＰＤＨ?ＴＰＭ??＇ｖ?Ｌｏｇｒａｎｋ?ｐ＝０．５５??ｃ〇?Ｖ｜，｜ｌｉｒｉｎ，ｉ?■，?｜?，?，?．?ＨＲ（ｈｉａｈ）＝ｌ．２??ｕ?°?ｐ（ＨＲ）＝０．５６??ｆ??Ｍ??ｌｌｌＨｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌ．．．．??ｇ！……丨??Ｍｏｎｔｈｓ??圖１－３．?ＵＨＲＦ１與宮頸癌的關聯(lián)分析。（Ａ）?ＵＨＲＦ１在成對腫瘤樣本與正常樣本中的表達。??每組點代表其在相應樣本的表達量。（Ｂ）?ＵＨＲＦ１與癌癥的相關性分析，其對于宮頸癌的??影響位居第五。（Ｃ）?ＵＨＲＦ１差異表達組的生存曲線。ＵＨＲＦ１高表達組的生存時間更短。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－３．?ＵＨＲＰ１?ａｎｄ?ｃｅｒｖｉｃａ

??圖１－４．?Ｅ７表達細胞差異表達核蛋白的基因本體（Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ，ＧＯ）和ＫＥＧＧ聚類分析。??（Ａ）差異表達核蛋白的生物過程富集分析。（Ｂ）差異表達核蛋白的ＫＥＧＧ細胞通路富集??分析。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－４．?Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ?ａｎｄ?ＫＥＧＧ?ｐａｔｈｗａｙ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｎｕｃｌｅａｒ?ｐｒｏｔｅｉｎ??ｉｎ?Ｅ７?ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ?ｃｅｌｌｓ．?（Ａ）?Ｂｉｏｌｏｇｙ?ｐｒｏｇｒｅｓｓ?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ??ｎｕｃｌｅａｒ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ．?（Ｂ）?ＫＥＧＧ?ｃｅｌｌ?ｐａｔｈｗａｙ?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｎｕｃｌｅａｒ??ｐｒｏｔｅｉｎｓ．??５．２差異表達蛋白的相互作用通路分析??通過ＳＴＲＩＮＧ在線數(shù)據(jù)庫分析顯著差異表達的核蛋白，從而構建蛋白互作網(wǎng)??絡及所在通路。研究顯示在蛋白互作網(wǎng)絡中，Ｅ７表達細胞上調(diào)的核蛋白集中在??病毒進程（如圖１－５?Ａ中紅色圓點所示），ｍＲＮＡ代謝過程（如圖１－５?Ａ中紫色??圓點所示），而其在方向化合物代謝和雜環(huán)代謝通路中也有較高富集。??Ｅ７表達細胞下調(diào)的核蛋白集中在細胞組分和蛋白復合體亞基通路中（如圖??１－５Ｂ中紫色圓點所示），而其在分子功能方面，多富集于ＲＫＡ綁定、細胞骨架??蛋白綁定、細胞組分募集等通路中。??４Ｂ??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Epigenetic disruption of cell signaling in nasopharyngeal carcinoma[J]. Li-Li Li1,2,3,Xing-Sheng Shu2,Zhao-Hui Wang1,2,Ya Cao3,and Qian Tao1,2 1Shenzhen Key Laboratory of Cancer Nanotechnology,Institute of Biomedical and Health Engineering,Shenzhen Institutes of Advanced Technology,Chinese Academy of Sciences-CUHK,Shenzhen,Guangdong 518055,P.R.China;2Cancer Epigenetics Laboratory,Sir YK Pao Center for Cancer,Department of Clinical Oncology,The Chinese University of Hong Kong,Hong Kong and CUHK Shenzhen Research Institute,Shenzhen,Guangdong 518057,P.R.China;3Cancer Research Institute,Xiangya School of Medicine,Central South University,Changsha,Hunan 410078,P.R.China..  癌癥. 2011(04)



本文編號：3629626