基于Illumina測序分析宮腔粘連患者子宮內(nèi)膜菌群多樣性
發(fā)布時間:2022-02-14 09:45
目的:從菌群總體角度分析比較不同嚴重程度宮腔粘連(IUA)患者與健康育齡期女性的子宮內(nèi)膜菌群的差異。方法:采集20例輕度IUA患者(IUA-L)、26例中重度IUA(IUA-M/H)及21例子宮內(nèi)膜正常女性(對照組)的子宮內(nèi)膜組織,對樣本進行細菌基因組DNA提取、16S rRNA V4區(qū)基因擴增及采用Illumina高通量測序,比較3組子宮內(nèi)膜菌群物種豐度結(jié)構(gòu)及多樣性。結(jié)果:在菌門水平,所有研究對象的子宮內(nèi)膜菌群主要由變形菌門、厚壁菌門、擬桿菌門、放線菌門組成,三個組中變形菌門高達67.16%。在菌屬水平,IUA組子宮內(nèi)膜克雷伯氏菌屬、希瓦氏菌屬、乳酸桿菌屬的相對豐度較對照組增加(31.44%、15.50%、8.77%,9.51%、15.32%、4.53%,7.11%、16.00%、6.95%)。IUA-L組和IUA-M/H組的Alpha多樣組明顯低于對照組(P=0.012,P=0.030);輕度IUA組與對照組的子宮內(nèi)膜菌群構(gòu)成在總體上可區(qū)分(P=0.022)。結(jié)論:IUA患者與子宮內(nèi)膜正常女性的子宮內(nèi)膜菌群構(gòu)成存在差異,主要改變優(yōu)勢菌群的組成比例,且分布欠均勻、群落結(jié)構(gòu)相似度較低。...
【文章來源】:現(xiàn)代婦產(chǎn)科進展. 2020,29(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
3組間子宮內(nèi)膜菌群Alpha多樣性比較
Beta多樣性是指不同樣本間的微生物群落構(gòu)成的相似度;赪eighted Unifrac距離,IUA-L組與對照組的子宮內(nèi)膜群菌在總體上可顯著區(qū)分(P=0.022),表明兩者的子宮內(nèi)膜群菌結(jié)構(gòu)的相似度相差最大,見圖2。3組比較,雖然兩兩比較組內(nèi)之間仍具有一些結(jié)構(gòu)相似的菌群,但同時也有分開的趨勢。2.4 菌群結(jié)構(gòu)比較
基于Illumina測序方法,所有樣本共檢測到61個門,1429個屬。在菌門水平,對照組、IUA-L組、IUA-M/H組患者子宮內(nèi)膜的菌群中最豐富的前四個門是變形桿菌門(Proteobacteria),分別占68.11%、73.30%和67.16%;其次是厚壁菌門(Firmicutes),所占比例分別是16.06%、12.79%和20.25%;擬桿菌門(Bacteroidetes),各占8.38%、6.59%和5.80%;放線菌門(Actinobacteria),分別占比5.73%、5.50%和4.73%。見圖3A。在菌屬水平,對照組以不動桿菌屬(Acinetobacter)為主,占22.68%,其次是克雷伯氏菌(Klebsiella),占8.77%,乳酸桿菌屬(Lactobacillus)占6.95%,希瓦氏菌(Shewanella)占4.53%和其他一些總體含量相對較低的菌屬。與對照組相比,IUA組子宮內(nèi)膜克雷伯氏菌屬、希瓦氏菌屬、乳酸桿菌屬的相對豐度增加(31.44%、15.50%、8.77%,9.51%、15.32%、4.53%,7.11%、16.00%、6.95%)。其中,IUA-L組克雷伯氏菌屬明顯增加(31.44%),不動桿菌屬明顯減少(12.74%),兩者都是IUA-L組的優(yōu)勢菌屬之一。見圖3B。A:門水平;B:屬水平
【參考文獻】:
期刊論文
[1]肺炎克雷伯氏菌毒力因子及其基因組學(xué)研究進展[J]. 趙位,喻東,程建國,李秋波,王印,楊澤曉,姚學(xué)萍,羅燕. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(06)
[2]肺炎克雷伯菌毒力因子相關(guān)研究[J]. 陳聰,史偉峰. 臨床醫(yī)藥文獻電子雜志. 2019(82)
[3]陰道菌群結(jié)構(gòu)分析在宮腔粘連患者中的臨床意義[J]. 植枝福,蔣曉莉,周卓琳,覃桂榮. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2018(09)
[4]宮腔粘連發(fā)病機制的研究進展[J]. 蔡慧華,何援利. 重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2017(04)
[5]肺炎克雷伯氏菌毒力因子的研究進展[J]. 康燕菲,田平芳,譚天偉. 微生物學(xué)報. 2015(10)
[6]機械和感染雙重損傷法建立新西蘭大白兔宮腔粘連模型[J]. 劉芳,何援利. 重慶醫(yī)學(xué). 2013(07)
本文編號:3624323
【文章來源】:現(xiàn)代婦產(chǎn)科進展. 2020,29(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
3組間子宮內(nèi)膜菌群Alpha多樣性比較
Beta多樣性是指不同樣本間的微生物群落構(gòu)成的相似度;赪eighted Unifrac距離,IUA-L組與對照組的子宮內(nèi)膜群菌在總體上可顯著區(qū)分(P=0.022),表明兩者的子宮內(nèi)膜群菌結(jié)構(gòu)的相似度相差最大,見圖2。3組比較,雖然兩兩比較組內(nèi)之間仍具有一些結(jié)構(gòu)相似的菌群,但同時也有分開的趨勢。2.4 菌群結(jié)構(gòu)比較
基于Illumina測序方法,所有樣本共檢測到61個門,1429個屬。在菌門水平,對照組、IUA-L組、IUA-M/H組患者子宮內(nèi)膜的菌群中最豐富的前四個門是變形桿菌門(Proteobacteria),分別占68.11%、73.30%和67.16%;其次是厚壁菌門(Firmicutes),所占比例分別是16.06%、12.79%和20.25%;擬桿菌門(Bacteroidetes),各占8.38%、6.59%和5.80%;放線菌門(Actinobacteria),分別占比5.73%、5.50%和4.73%。見圖3A。在菌屬水平,對照組以不動桿菌屬(Acinetobacter)為主,占22.68%,其次是克雷伯氏菌(Klebsiella),占8.77%,乳酸桿菌屬(Lactobacillus)占6.95%,希瓦氏菌(Shewanella)占4.53%和其他一些總體含量相對較低的菌屬。與對照組相比,IUA組子宮內(nèi)膜克雷伯氏菌屬、希瓦氏菌屬、乳酸桿菌屬的相對豐度增加(31.44%、15.50%、8.77%,9.51%、15.32%、4.53%,7.11%、16.00%、6.95%)。其中,IUA-L組克雷伯氏菌屬明顯增加(31.44%),不動桿菌屬明顯減少(12.74%),兩者都是IUA-L組的優(yōu)勢菌屬之一。見圖3B。A:門水平;B:屬水平
【參考文獻】:
期刊論文
[1]肺炎克雷伯氏菌毒力因子及其基因組學(xué)研究進展[J]. 趙位,喻東,程建國,李秋波,王印,楊澤曉,姚學(xué)萍,羅燕. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(06)
[2]肺炎克雷伯菌毒力因子相關(guān)研究[J]. 陳聰,史偉峰. 臨床醫(yī)藥文獻電子雜志. 2019(82)
[3]陰道菌群結(jié)構(gòu)分析在宮腔粘連患者中的臨床意義[J]. 植枝福,蔣曉莉,周卓琳,覃桂榮. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2018(09)
[4]宮腔粘連發(fā)病機制的研究進展[J]. 蔡慧華,何援利. 重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2017(04)
[5]肺炎克雷伯氏菌毒力因子的研究進展[J]. 康燕菲,田平芳,譚天偉. 微生物學(xué)報. 2015(10)
[6]機械和感染雙重損傷法建立新西蘭大白兔宮腔粘連模型[J]. 劉芳,何援利. 重慶醫(yī)學(xué). 2013(07)
本文編號:3624323
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