目的利用大數(shù)據(jù)生物信息挖掘算法探討妊娠期糖尿病（gestational diabetes mellitus,GDM）發(fā)病相關(guān)基因及其可能生物學(xué)功能在GDM發(fā)病機(jī)制中的作用。方法首先檢索基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫,篩選并下載GDM差異表達(dá)芯片數(shù)據(jù),采用R軟件Lima包對差異表達(dá)基因進(jìn)行篩選（Log2FC>1; P<0.05）;對篩選出的差異表達(dá)基因進(jìn)行功能富集分析。采用數(shù)據(jù)庫STRING構(gòu)建GDM發(fā)病機(jī)制蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),分析差異表達(dá)基因編碼蛋白間的相互作用關(guān)系。利用Cytohubb軟件進(jìn)一步篩選信號通路中關(guān)鍵基因（hub基因）;同時(shí)選取30例GDM患者和30名正常分娩孕婦為研究對象,采用免疫組化方法對關(guān)鍵基因編碼蛋白在GDM患者胎盤組織及正常妊娠產(chǎn)婦胎盤組織中的表達(dá)水平進(jìn)行檢測。結(jié)果 2個(gè)數(shù)據(jù)集GSE51546和GSE87295納入本次分析,2個(gè)數(shù)據(jù)集中共差異表達(dá)基因4個(gè)[TACSTD2,磷脂酰肌醇3-激酶（phosphatidylinositide 3-kinase,PI3K）,COLEC12和IGFBP6]。差異表達(dá)基因蛋白主要位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞接合器,主要分子功能為磷酸轉(zhuǎn)移酶... 

【文章來源】：轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2020,9(05)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

差異表達(dá)基因篩選

篩選出的4個(gè)差異表達(dá)基因的聚類熱圖

篩選出的4個(gè)差異表達(dá)基因編碼蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)(圖3)顯示，整個(gè)網(wǎng)絡(luò)中54個(gè)蛋白節(jié)點(diǎn)，共574個(gè)相互作用鏈接，平均連接度為21.3，聚集度為0.74。2.5 GDM蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)關(guān)鍵基因篩選

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]血清鎂與妊娠糖尿病胰島素抵抗的關(guān)系[J]. 李明,牛秀敏.  現(xiàn)代婦產(chǎn)科進(jìn)展. 2010(02)



本文編號：3586442