基于生物信息學(xué)分析STAT3、Grim19在卵巢癌中的表達(dá)及臨床意義
發(fā)布時間:2022-01-01 04:47
目的研究STAT3、Grim19在卵巢癌中的表達(dá)情況、潛在功能、預(yù)后評估及臨床意義。方法利用NCBI、UCSC、UniProt數(shù)據(jù)庫檢索STAT3、Grim19基本信息。使用PubMed數(shù)據(jù)庫檢索與STAT3、Grim19相關(guān)文獻(xiàn)。利用GEPIA在線工具分析STAT3、Grim19蛋白之間的相關(guān)性。下載腫瘤基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中包含STAT3、Grim19表達(dá)水平的卵巢漿液性囊腺癌臨床病例資料并作生存分析。利用在線工具LinkedOmics篩選STAT3、Grim19相關(guān)基因。利用Omicshare在線軟件對相關(guān)基因進(jìn)行GO功能注釋富集分析與KEGG通路富集分析。收集廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院2013年1月~2017年12月經(jīng)手術(shù)治療的115例上皮性卵巢癌標(biāo)本,采用免疫組化法(IHC)檢測STAT3、Grim19表達(dá)水平,并分析二者與預(yù)后評估的關(guān)系。結(jié)果 STAT3、Grim19表達(dá)水平具有組織學(xué)特異性,STAT3在多種惡性腫瘤中表達(dá)上調(diào),Grim19在多種惡性腫瘤中表達(dá)下調(diào),且二者呈負(fù)相關(guān)。TCGA臨床數(shù)據(jù)顯示,STAT3高表達(dá)組中位生存時間與低表達(dá)組無明顯差異(P>0....
【文章來源】:華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2020,49(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
STAT3、Grim19表達(dá)的相關(guān)性分析
在294例表達(dá)STAT3的基因芯片臨床數(shù)據(jù)集中,2785個基因與STAT3具有相關(guān)性,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。與STAT3呈正、負(fù)相關(guān)的基因中相關(guān)系數(shù)較高的50個基因依次為DNAAF2、SLC34A2、FAM134C、UNQ6490、TOM1等,其中與STAT3相關(guān)性系數(shù)最高(rs=-0.42,P<0.05)的基因?yàn)檠b配因子2(the dynein axonemal assembly factor 2,DNAAF2),又名C14orf104,是一種蛋白激酶,參與軸突動力蛋白裝配,在纖毛和鞭毛運(yùn)動中起核心作用。在594例表達(dá)Grim19的基因芯片數(shù)據(jù)集中,4960個基因與Grim19具有相關(guān)性,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。與Grim19呈正、負(fù)相關(guān)的基因中相關(guān)系數(shù)較高的50個基因依次為NDUFB7、MRPL34、C19orf14、MGC3194、P117等,其中與Grim19相關(guān)性系數(shù)最高(rs=0.75,P<0.01)的基因?yàn)镹ADH脫氫酶1β復(fù)合體亞基7(NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B7,NDUFB7),NDUFB7是線粒體復(fù)合體Ⅰ的輔助亞基,在線粒體氧化呼吸鏈電子傳遞中起重要作用(圖3)。圖3 STAT3、Grim19的相關(guān)基因火山圖
STAT3、Grim19的相關(guān)基因火山圖
本文編號:3561651
【文章來源】:華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2020,49(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
STAT3、Grim19表達(dá)的相關(guān)性分析
在294例表達(dá)STAT3的基因芯片臨床數(shù)據(jù)集中,2785個基因與STAT3具有相關(guān)性,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。與STAT3呈正、負(fù)相關(guān)的基因中相關(guān)系數(shù)較高的50個基因依次為DNAAF2、SLC34A2、FAM134C、UNQ6490、TOM1等,其中與STAT3相關(guān)性系數(shù)最高(rs=-0.42,P<0.05)的基因?yàn)檠b配因子2(the dynein axonemal assembly factor 2,DNAAF2),又名C14orf104,是一種蛋白激酶,參與軸突動力蛋白裝配,在纖毛和鞭毛運(yùn)動中起核心作用。在594例表達(dá)Grim19的基因芯片數(shù)據(jù)集中,4960個基因與Grim19具有相關(guān)性,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。與Grim19呈正、負(fù)相關(guān)的基因中相關(guān)系數(shù)較高的50個基因依次為NDUFB7、MRPL34、C19orf14、MGC3194、P117等,其中與Grim19相關(guān)性系數(shù)最高(rs=0.75,P<0.01)的基因?yàn)镹ADH脫氫酶1β復(fù)合體亞基7(NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B7,NDUFB7),NDUFB7是線粒體復(fù)合體Ⅰ的輔助亞基,在線粒體氧化呼吸鏈電子傳遞中起重要作用(圖3)。圖3 STAT3、Grim19的相關(guān)基因火山圖
STAT3、Grim19的相關(guān)基因火山圖
本文編號:3561651
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