第一部分生物信息學方法比較正常及先兆子癇胎盤組織樣本的基因表達譜血管發(fā)生和廣泛的血管生成對于胎盤發(fā)育至關重要。先兆子癇（pre-eclampsia,PE）的發(fā)生是胎盤血管異常發(fā)育的結果之一。在本部分研究中,旨在通過比較正常發(fā)育情況下胎盤的基因表達譜及PE發(fā)生條件下的胎盤基因表達譜,從中找到在兩者中具有共性的特征基因。從Gene Expression Omnibus數(shù)據(jù)庫中下載不同孕齡的正常人胎盤（GSE9984）和先兆子癇人胎盤微陣列數(shù)據(jù)（GSE6573）的基因表達譜。差異表達基因（differentially expressed genes,DEGs）分析由GE02R進行�；蚪M富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）使用GSEA v3.0軟件進行。TargetScanHuman數(shù)據(jù)庫、miRTarBase數(shù)據(jù)庫及mirRDB數(shù)據(jù)庫用于分析可靠的miR-203作用靶基因。MiR-203與靶標基因的互作網(wǎng)絡可視化由Cytoscape構建。比較兩組基因表達譜后得到共同基因10個,包括LNPEP、AKNA、SLC9A7、VEGFA、FUT9、STRBP... 

【文章來源】：武漢大學湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：79 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．１?Ａ．．?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４數(shù)據(jù)集價值分布的箱形圖；Ｂ：?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４中ＤＥＧｓ６令重??疊元素；Ｃ：?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４共同ＤＥＧｓ的熱圖??

１１１沁１＇〇１＾八５祀向數(shù)據(jù)庫�。睬桑１８〇＆１１１�?郟保保保保蓿保�、１１１�?保倍。Τ觶常擔都埃保保必?海�？１�?保常?鈧輾直鷦げ猓崳?出ｍｉＲ－２０３的｜Ｅ標基因為９５３，３１１?及７１１?個（表１．１）。運用Ｄｒａｗ?Ｖｅｎｎ?Ｄｉａｇｒａｍ分別??對ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ、ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ及ｍｉｒＲＤＢ中的兀素進行比較，篩選三個數(shù)據(jù)??庫均有重疊的特殊基因其３８個（圖１．２Ａ＆表１．２）。最后在Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ中構建ｍｉＲ－２０３??與３８個重疊靶向基因的互作圖（圖１．２Ｂ）。??表１．１通過ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ、ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ和ｍｉｒＲＤＢ數(shù)據(jù)庫預測ｍｉＲ－２０３的把向基因??名稱?基因數(shù)目?可識別基因數(shù)目??Ｔａｒｇｅｔｓ?ｃａｎＨｕｍ?ａｎ?９５４?９５３??ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ?３１１?３１１??ｍｉｒＲＤＢ?７１１?７１１??總計基因數(shù)?１５８７???表１．２數(shù)據(jù)庫預測ｍｉＲ－２０３的靶向基因的重疊基因???名稱?總數(shù)?重疊基因名稱??ＮＵＦＩＰ２?ＲＡＰ１Ａ?ＺＥＢ１?ＺＮＦ１４８?Ｓ０ＣＳ６?ＬＣＯＲ?ＩＬ２４?ＤＵＳＰ５??ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ?ＫＩＦ２ＡＮＦＹＡＲＡＰＧＥＦ１?ＡＢＣＥ１?ＳＬＣ３９Ａ９?ＢＣＬ７ＡＡＴ?

?ＭｉＲ－２０３通過抑制ＶＥＧＦＡ介導胎盤發(fā)育的機制研究???ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＰＩ３Ｋ＿ＡＫＴ＿ＭＴ０Ｒ＿ＳＩＧＮＡＬＩＮＧ?９８?－０．２１７０９??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＵＶ＿ＲＥＳＰＯＮＳＥ＿ＵＰ?１５０?－０．２６６３３??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＥＰＩＴＨＥＬＩＡＬ＿ＭＥＳＥＮＣＨＹＭＡＬ＿ＴＲＡＮＳＩＴＩＯＮ?１９２?－０．３７６９１??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＡＰＯＰＴＯＳＩＳ?１５９?－０．２９７９３??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＮＯＴＣＨ＿ＳＩＧＮＡＬＩＮＧ?２９?－０．２６０７５???ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＡＬＬＱＧＲＡＦＴ＿ＲＥＪＥＣＴＩＯＮ?１９１?－０．３４６１??ＥＳ：?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ｓｃｏｒｅｓ．??Ａ?Ｂ??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]胎盤發(fā)育過程中的表觀遺傳學改變及其相關疾病[J]. 劉福林,周瑾,張蔚,汪暉.  遺傳. 2017(04)
[2]孕中期血絨毛膜促性腺激素水平異常改變與不良妊娠結局的關系[J]. 劉國成,謝文娟,張秀蘭,俞秀美,姚煥春.  中華圍產(chǎn)醫(yī)學雜志. 2002(01)



本文編號：3536233