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MiR-203通過抑制VEGFA介導胎盤發(fā)育的機制研究

發(fā)布時間:2021-12-12 07:10
  第一部分生物信息學方法比較正常及先兆子癇胎盤組織樣本的基因表達譜血管發(fā)生和廣泛的血管生成對于胎盤發(fā)育至關重要。先兆子癇(pre-eclampsia,PE)的發(fā)生是胎盤血管異常發(fā)育的結果之一。在本部分研究中,旨在通過比較正常發(fā)育情況下胎盤的基因表達譜及PE發(fā)生條件下的胎盤基因表達譜,從中找到在兩者中具有共性的特征基因。從Gene Expression Omnibus數(shù)據(jù)庫中下載不同孕齡的正常人胎盤(GSE9984)和先兆子癇人胎盤微陣列數(shù)據(jù)(GSE6573)的基因表達譜。差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs)分析由GE02R進行;蚪M富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)使用GSEA v3.0軟件進行。TargetScanHuman數(shù)據(jù)庫、miRTarBase數(shù)據(jù)庫及mirRDB數(shù)據(jù)庫用于分析可靠的miR-203作用靶基因。MiR-203與靶標基因的互作網(wǎng)絡可視化由Cytoscape構建。比較兩組基因表達譜后得到共同基因10個,包括LNPEP、AKNA、SLC9A7、VEGFA、FUT9、STRBP... 

【文章來源】:武漢大學湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:79 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

MiR-203通過抑制VEGFA介導胎盤發(fā)育的機制研究


圖1.1?A..?GSE6573和GSE9984數(shù)據(jù)集價值分布的箱形圖;B:?GSE6573和GSE9984中DEGs6令重??疊元素;C:?GSE6573和GSE9984共同DEGs的熱圖??

韋恩圖,互作,數(shù)據(jù)庫,重疊基因


111沁1'〇1^八5祀向數(shù)據(jù)庫。睬桑18〇&111?郟保保保保蓿保、111?保倍。Τ觶常擔都埃保保必?海?1?保常?鈧輾直鷦げ猓崳?出miR-203的|E標基因為953,311?及711?個(表1.1)。運用Draw?Venn?Diagram分別??對TargetScanHuman、miRTarBase及mirRDB中的兀素進行比較,篩選三個數(shù)據(jù)??庫均有重疊的特殊基因其38個(圖1.2A&表1.2)。最后在Cytoscape中構建miR-203??與38個重疊靶向基因的互作圖(圖1.2B)。??表1.1通過TargetScanHuman、miRTarBase和mirRDB數(shù)據(jù)庫預測miR-203的把向基因??名稱?基因數(shù)目?可識別基因數(shù)目??Targets?canHum?an?954?953??miRTarBase?311?311??mirRDB?711?711??總計基因數(shù)?1587???表1.2數(shù)據(jù)庫預測miR-203的靶向基因的重疊基因???名稱?總數(shù)?重疊基因名稱??NUFIP2?RAP1A?ZEB1?ZNF148?S0CS6?LCOR?IL24?DUSP5??TargetScanHuman?KIF2ANFYARAPGEF1?ABCE1?SLC39A9?BCL7AAT?

分析圖,機制研究,血管生成,胎盤


?MiR-203通過抑制VEGFA介導胎盤發(fā)育的機制研究???HALLMARK_PI3K_AKT_MT0R_SIGNALING?98?-0.21709??HALLMARK_UV_RESPONSE_UP?150?-0.26633??HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION?192?-0.37691??HALLMARK_APOPTOSIS?159?-0.29793??HALLMARK_NOTCH_SIGNALING?29?-0.26075???HALLMARK_ALLQGRAFT_REJECTION?191?-0.3461??ES:?enrichment?scores.??A?B??

【參考文獻】:
期刊論文
[1]胎盤發(fā)育過程中的表觀遺傳學改變及其相關疾病[J]. 劉福林,周瑾,張蔚,汪暉.  遺傳. 2017(04)
[2]孕中期血絨毛膜促性腺激素水平異常改變與不良妊娠結局的關系[J]. 劉國成,謝文娟,張秀蘭,俞秀美,姚煥春.  中華圍產(chǎn)醫(yī)學雜志. 2002(01)



本文編號:3536233

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