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早發(fā)性卵巢功能不全致病突變的篩選鑒定及染色體核型分析

發(fā)布時間:2021-12-10 11:41
  背景卵巢功能隨著年齡的增加而減退并是不可逆轉(zhuǎn)的。早發(fā)性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)是一種早期卵巢功能障礙。特點是原發(fā)或繼發(fā)閉經(jīng)伴隨血促性腺激素水平升高和雌激素水平降低并伴隨一系列低雌激素癥狀。POI是一種異質(zhì)性很高的疾病,在大部分的病例中病因尚不明確?赡芘c染色體異常、基因突變、免疫、代謝、感染、環(huán)境和心理等因素有關(guān)。其中遺傳因素被認(rèn)為是導(dǎo)致POI發(fā)生的重要原因之一。家系研究表明,POI具有較高的家族遺傳傾向,目前已有多個研究證實X染色體或常染色體的異常會導(dǎo)致POI的發(fā)生,并已發(fā)現(xiàn)了上百種POI的致病基因和致病突變。篩選候選基因/突變的方法有很多,包括全基因組關(guān)聯(lián)分析,純合子作圖等技術(shù)。全外顯子測序(whole exon sequencing,WES)是一種用于測序基因組中所有蛋白質(zhì)編碼基因的基因組技術(shù),該技術(shù)的目標(biāo)是確定改變蛋白質(zhì)序列的遺傳變異體。近二十年來廣泛用于致病基因的研究。本研究分為兩部分,第一部分用WES方法發(fā)現(xiàn)了一個未報道過的新的致病突變。第二部分回顧性分析了351例POI患者的染色體核型,從而證實染色體異常是導(dǎo)致... 

【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:67 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

早發(fā)性卵巢功能不全致病突變的篩選鑒定及染色體核型分析


POI家系圖

原始數(shù)據(jù),資料,號外,雜合


2 測序及篩選結(jié)果2.1 WES 測序后數(shù)據(jù)我們的數(shù)據(jù)的 Reads 的平均覆蓋度為 150X,>95%在 20X 及以上,數(shù)據(jù)質(zhì)量可靠。通過前述方法篩選候選基因/突變,我們檢測到 1,2,4 號 POI 患者的卵泡刺激素受體(follicle-stimulating hormone receptor,F(xiàn)SHR)存在一未報道過的復(fù)合雜合突變,分別為 10 號外顯子的錯義突變 c.T1412G 和 10 號外顯子的移碼突變 c.1090_1091del。這種復(fù)合雜合突變在正常的姐妹(同胞 5)中未檢測到。

模式圖,模式圖,外顯子,胞質(zhì)結(jié)構(gòu)


圖 1.2 篩選后的原始數(shù)據(jù)資料HR 結(jié)構(gòu)HR 含有 695 個氨基酸,在氨基尾部具結(jié)合胞外結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)的胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域的配體。FSHR 共含十個外顯子,前九個外顯子編基末端結(jié)構(gòu)域,第十號外顯子編碼跨膜和胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]High-performance single-chip exon capture allows accurate whole exome sequencing using the Illumina Genome Analyzer[J]. JIANG Tao 1,YANG Lei 2,3,JIANG Hui 1,TIAN Geng 1,2,3 & ZHANG XiuQing 1,2,3 1 Beijing Genomics Institute,Shenzhen 518000,China;2 Beijing Institute of Genomics,Chinese Academy of Sciences,Beijing 101300,China;3 Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100062,China.  Science China(Life Sciences). 2011(10)



本文編號:3532554

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