第一部分:預(yù)測LATS2是hsa-miR-373-3p的潛在的靶基因目的:在線登錄或者下載生物信息學預(yù)測軟件尋找hsa-miR-373-3p與LATS2基因是否存在靶向關(guān)系,探討LATS2是否為hsa-miR-373-3p的靶基因;查閱相關(guān)文獻,明確LATS2是否是hsa-miR-373-3p的功能靶點,hsa-miR-373-3p和LATS2之間是否存在靶向調(diào)控關(guān)系。方法:1、應(yīng)用miRbase獲取hsa-miR-373-3p的堿基序列;并使用Target Scan、miRDB、miRTarBase、miRWalk和microRNA.org等在線軟件尋找hsa-miR-373-3p與LATS2基因的靶向關(guān)系;2、在國內(nèi)外數(shù)據(jù)庫中查閱有關(guān)于hsa-miR-373-3p和LATS2的相關(guān)文獻,尋找是否有研究驗證hsa-miR-373-3p和LATS2之間存在靶向調(diào)控關(guān)系。結(jié)果:1、從TargetScan、miRDB、miRTarBase、miRWalk和microRNA.org四個生物信息學軟件均能在線預(yù)測找到LATS2是hsa-miR-373-3p的一個靶基因,2、國外關(guān)于食管鱗狀細胞... 

【文章來源】：廣西醫(yī)科大學廣西壯族自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：93 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

miRBase軟件所示hsa-miR-373-3p序列

使用生物信息學軟件 miRBase 在線查找 hsa-miR-373-3p 序列為:GAAGUGCUUCG -AUUUUGGGGUGU，如圖 2-1 所示。圖 2-1 miRBase 軟件所示 hsa-miR-373-3p 序列Fig 2-1 hsa-miR-373-3p sequence shown by miRBase software使用生物信息學軟件 Genbank 在線查找并獲得 LATS2 基因序列及詳細信息，LATS2 基因是位于 13 號染色體的 q12.11，如圖 2-2 和圖 2-3 所示。

圖 2-3 LATS2 基因詳細信息Fig2-3 The detailed information of LATS2 gene2.2 多種生物信息學軟件預(yù)測靶基因結(jié)果（1）在線登錄生物信息學軟件 Targetscan 預(yù)測顯示 LATS2 為hsa-miR-373-3p 的靶基因，詳細信息如圖 2-4 所示。圖 2-4 Target Scan 軟件預(yù)測的 hsa-miR-373-3p 和 LATS2 結(jié)合位點及序列Fig 2-4 The binding sites and sequences of hsa-miR-373-3p and LATS2 predicted by Target Scan software


本文編號：3468422