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子癇前期相關(guān)lncRNA SH3PXD2A-AS1抑制滋養(yǎng)細(xì)胞遷移侵襲的機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2021-06-14 12:05
  研究背景子癇前期(preeclampsia,PE)作為妊娠期特有的疾病,以高血壓和蛋白尿?yàn)橹饕卣?全球發(fā)病率為4%-5%。其發(fā)病機(jī)制主要有胎盤(pán)淺著床、氧化應(yīng)激、血管內(nèi)皮損傷和免疫調(diào)節(jié)異常等,但子癇前期的確切病因仍未完全闡明。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long Noncoding RNA,lncRNA)是一類(lèi)長(zhǎng)度大于200個(gè)核苷酸,但不編碼蛋白質(zhì)的RNA。既往研究發(fā)現(xiàn),異常表達(dá)的lncRNA與子癇前期發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),推測(cè)lncRNA可能通過(guò)影響滋養(yǎng)細(xì)胞功能在子癇前期中發(fā)揮重要作用,為子癇前期提供前瞻性的診斷和治療。我們對(duì)9例重癥早發(fā)子癇前期胎盤(pán)和32例正常胎盤(pán)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)lncRNA SH3PXD2A-AS1在子癇前期胎盤(pán)中顯著高表達(dá)。過(guò)表達(dá)lncRNA SH3PXD2A-AS1后抑制滋養(yǎng)細(xì)胞遷移、侵襲和增殖,促進(jìn)細(xì)胞凋亡;敲除則相反。通過(guò)RNA pulldown和蛋白質(zhì)譜發(fā)現(xiàn)93個(gè)lncRNA SH3PXD2A-AS1特異結(jié)合的蛋白,包括12個(gè)轉(zhuǎn)錄因子。進(jìn)一步,通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄因子的靶基因,構(gòu)建TF-Targets調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及與胎盤(pán)測(cè)序差異表達(dá)基因交集分析,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子CCCTC位... 

【文章來(lái)源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】:140 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

子癇前期相關(guān)lncRNA SH3PXD2A-AS1抑制滋養(yǎng)細(xì)胞遷移侵襲的機(jī)制研究


圖1-3?LncRNA?SH3PXD2A-AS1在胎盤(pán)中表達(dá)量與孕婦血壓具有相關(guān)性??Figurel-3?The?correlation??

滋養(yǎng)細(xì)胞,細(xì)胞質(zhì)


0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,數(shù)據(jù)用均值士標(biāo)準(zhǔn)差(Mean?±?S.D)??表示。兩獨(dú)立樣本間比較使用t檢驗(yàn)或Mann-Whitney檢驗(yàn),*代表/?<〇.〇5,**??代表/K0.01,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。??3.3結(jié)果??3.3.1?Lnt側(cè)A?SH3PXD2A-AS1主要位于細(xì)胞核??我們通過(guò)核質(zhì)分離實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),人約92%的IncRNA?SH3PXD2A-AS1位于細(xì)??胞核,只有8%的IncRNA?SH3PXD2A-AS1位于細(xì)胞質(zhì),分別以U6和GAPDH??作為細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)的標(biāo)志物(圖3-1A)。此外,我們通過(guò)免疫原位雜交??(FISH)實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)IncRNA?SH3PXD2A-AS1大多數(shù)位于細(xì)胞核,18s代表細(xì)??胞質(zhì)的標(biāo)志物(圖3-1B)。以h結(jié)果提示,lncRNASH3PXD2A-ASl?能參1?j??細(xì)胞轉(zhuǎn)錄過(guò)程從而發(fā)揮作用。??A?B??n?j?u?Cy3?Hoechst?Merged??512〇?■?Cytoplasm?L?>?…:」:?.'?i?|i?■-;?s??mi??i2::l?11?S'EBBH9??GAPDH?U6?SH3PXD2A-AS1?的??Q:??圖3-l?LncRNA?SH3PXD2A-AS1在滋養(yǎng)細(xì)胞的定位分布??Figure3-l?The?localization?and?distribution?of?IncRNA?SH3PXD2A-AS1?in?HTR8/SVnco??A:核質(zhì)分離實(shí)驗(yàn)檢測(cè)丨ncRNA?SH3PXD2A-AS1的定位.GAPDH為細(xì)胞質(zhì)內(nèi)參,U6為細(xì)??胞核內(nèi)參:B:?FISH實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證丨ncRNA?SH3PXD2A-AS1分布,lncRNA-l8S為

靶基因,轉(zhuǎn)錄因子,胎盤(pán),測(cè)序


文???A?B??The?overlap?between?the?targets?of?SH3PXD2A-AS1?binding?TFs?and?DEGs?丨n?EOSPE??--:?UTP18?PWP1?CLIP1??^?HNRPM?DDX41?LM07?^???DDX54?_??S?f^?^?;;?(7^?v?-)?(M?■?,?-?;;?,7?.?^?;??■?Targets?transcript?factor??■?DEGs?in?EOSPE??圖3-3?LmrRNA?SH3丨》X丨)2A-AS1結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子-靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及與胎盤(pán)測(cè)序差異表達(dá)??基因交集??Figure3-3?The?SH3PXD2A-AS1?binding?transcript?factor(TF)?-Targets?regulatory?network??and?overlap?between?the?targets?and?differentially?expressed?genes?(DEGs)?in?EOSPE??A:?LncRNASH3PXD2A-AS丨結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子-靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò);B:?LncRNASH3PXD2A-??ASl結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子靶基因與胎盤(pán)測(cè)序差異表達(dá)基因交集;C:?CTCF靶基因與胎盤(pán)測(cè)序差??異表達(dá)基因交集。??3J.4?RIP?實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證?IncRNA?SH3PXD2A-AS1?與CTCF?結(jié)合??通過(guò)?RIP?富集和?qRT-PCR?檢測(cè),發(fā)現(xiàn)?IncRNA?SH3PXD2A-AS1?與?CTCF??結(jié)合(圖3-4A)。進(jìn)一步,我們?cè)谧甜B(yǎng)細(xì)胞HTR8/SVneo中過(guò)表達(dá)和敲除??In

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA HOTAIR調(diào)節(jié)PE滋養(yǎng)細(xì)胞功能的研究[J]. 鄒艷芬,孫麗洲.  四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(01)
[2]Small nucleolar RNAs (snoRNAs) as potential non-invasive biomarkers for early cancer detection[J]. Wen-Dan Chen,Xiao-Feng Zhu.  Chinese Journal of Cancer. 2013(02)



本文編號(hào):3229794

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