子癇前期相關(guān)lncRNA SH3PXD2A-AS1抑制滋養(yǎng)細(xì)胞遷移侵襲的機(jī)制研究
發(fā)布時間:2021-06-14 12:05
研究背景子癇前期(preeclampsia,PE)作為妊娠期特有的疾病,以高血壓和蛋白尿為主要特征,全球發(fā)病率為4%-5%。其發(fā)病機(jī)制主要有胎盤淺著床、氧化應(yīng)激、血管內(nèi)皮損傷和免疫調(diào)節(jié)異常等,但子癇前期的確切病因仍未完全闡明。長鏈非編碼RNA(long Noncoding RNA,lncRNA)是一類長度大于200個核苷酸,但不編碼蛋白質(zhì)的RNA。既往研究發(fā)現(xiàn),異常表達(dá)的lncRNA與子癇前期發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),推測lncRNA可能通過影響滋養(yǎng)細(xì)胞功能在子癇前期中發(fā)揮重要作用,為子癇前期提供前瞻性的診斷和治療。我們對9例重癥早發(fā)子癇前期胎盤和32例正常胎盤進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,發(fā)現(xiàn)lncRNA SH3PXD2A-AS1在子癇前期胎盤中顯著高表達(dá)。過表達(dá)lncRNA SH3PXD2A-AS1后抑制滋養(yǎng)細(xì)胞遷移、侵襲和增殖,促進(jìn)細(xì)胞凋亡;敲除則相反。通過RNA pulldown和蛋白質(zhì)譜發(fā)現(xiàn)93個lncRNA SH3PXD2A-AS1特異結(jié)合的蛋白,包括12個轉(zhuǎn)錄因子。進(jìn)一步,通過數(shù)據(jù)庫預(yù)測轉(zhuǎn)錄因子的靶基因,構(gòu)建TF-Targets調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及與胎盤測序差異表達(dá)基因交集分析,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子CCCTC位...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:140 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-3?LncRNA?SH3PXD2A-AS1在胎盤中表達(dá)量與孕婦血壓具有相關(guān)性??Figurel-3?The?correlation??
0進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,數(shù)據(jù)用均值士標(biāo)準(zhǔn)差(Mean?±?S.D)??表示。兩獨(dú)立樣本間比較使用t檢驗或Mann-Whitney檢驗,*代表/?<〇.〇5,**??代表/K0.01,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。??3.3結(jié)果??3.3.1?Lnt側(cè)A?SH3PXD2A-AS1主要位于細(xì)胞核??我們通過核質(zhì)分離實驗發(fā)現(xiàn),人約92%的IncRNA?SH3PXD2A-AS1位于細(xì)??胞核,只有8%的IncRNA?SH3PXD2A-AS1位于細(xì)胞質(zhì),分別以U6和GAPDH??作為細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)的標(biāo)志物(圖3-1A)。此外,我們通過免疫原位雜交??(FISH)實驗,發(fā)現(xiàn)IncRNA?SH3PXD2A-AS1大多數(shù)位于細(xì)胞核,18s代表細(xì)??胞質(zhì)的標(biāo)志物(圖3-1B)。以h結(jié)果提示,lncRNASH3PXD2A-ASl?能參1?j??細(xì)胞轉(zhuǎn)錄過程從而發(fā)揮作用。??A?B??n?j?u?Cy3?Hoechst?Merged??512〇?■?Cytoplasm?L?>?…:」:?.'?i?|i?■-;?s??mi??i2::l?11?S'EBBH9??GAPDH?U6?SH3PXD2A-AS1?的??Q:??圖3-l?LncRNA?SH3PXD2A-AS1在滋養(yǎng)細(xì)胞的定位分布??Figure3-l?The?localization?and?distribution?of?IncRNA?SH3PXD2A-AS1?in?HTR8/SVnco??A:核質(zhì)分離實驗檢測丨ncRNA?SH3PXD2A-AS1的定位.GAPDH為細(xì)胞質(zhì)內(nèi)參,U6為細(xì)??胞核內(nèi)參:B:?FISH實驗驗證丨ncRNA?SH3PXD2A-AS1分布,lncRNA-l8S為
文???A?B??The?overlap?between?the?targets?of?SH3PXD2A-AS1?binding?TFs?and?DEGs?丨n?EOSPE??--:?UTP18?PWP1?CLIP1??^?HNRPM?DDX41?LM07?^???DDX54?_??S?f^?^?;;?(7^?v?-)?(M?■?,?-?;;?,7?.?^?;??■?Targets?transcript?factor??■?DEGs?in?EOSPE??圖3-3?LmrRNA?SH3丨》X丨)2A-AS1結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子-靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及與胎盤測序差異表達(dá)??基因交集??Figure3-3?The?SH3PXD2A-AS1?binding?transcript?factor(TF)?-Targets?regulatory?network??and?overlap?between?the?targets?and?differentially?expressed?genes?(DEGs)?in?EOSPE??A:?LncRNASH3PXD2A-AS丨結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子-靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò);B:?LncRNASH3PXD2A-??ASl結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子靶基因與胎盤測序差異表達(dá)基因交集;C:?CTCF靶基因與胎盤測序差??異表達(dá)基因交集。??3J.4?RIP?實驗驗證?IncRNA?SH3PXD2A-AS1?與CTCF?結(jié)合??通過?RIP?富集和?qRT-PCR?檢測,發(fā)現(xiàn)?IncRNA?SH3PXD2A-AS1?與?CTCF??結(jié)合(圖3-4A)。進(jìn)一步,我們在滋養(yǎng)細(xì)胞HTR8/SVneo中過表達(dá)和敲除??In
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長鏈非編碼RNA HOTAIR調(diào)節(jié)PE滋養(yǎng)細(xì)胞功能的研究[J]. 鄒艷芬,孫麗洲. 四川大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2015(01)
[2]Small nucleolar RNAs (snoRNAs) as potential non-invasive biomarkers for early cancer detection[J]. Wen-Dan Chen,Xiao-Feng Zhu. Chinese Journal of Cancer. 2013(02)
本文編號:3229794
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:140 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-3?LncRNA?SH3PXD2A-AS1在胎盤中表達(dá)量與孕婦血壓具有相關(guān)性??Figurel-3?The?correlation??
0進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,數(shù)據(jù)用均值士標(biāo)準(zhǔn)差(Mean?±?S.D)??表示。兩獨(dú)立樣本間比較使用t檢驗或Mann-Whitney檢驗,*代表/?<〇.〇5,**??代表/K0.01,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。??3.3結(jié)果??3.3.1?Lnt側(cè)A?SH3PXD2A-AS1主要位于細(xì)胞核??我們通過核質(zhì)分離實驗發(fā)現(xiàn),人約92%的IncRNA?SH3PXD2A-AS1位于細(xì)??胞核,只有8%的IncRNA?SH3PXD2A-AS1位于細(xì)胞質(zhì),分別以U6和GAPDH??作為細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)的標(biāo)志物(圖3-1A)。此外,我們通過免疫原位雜交??(FISH)實驗,發(fā)現(xiàn)IncRNA?SH3PXD2A-AS1大多數(shù)位于細(xì)胞核,18s代表細(xì)??胞質(zhì)的標(biāo)志物(圖3-1B)。以h結(jié)果提示,lncRNASH3PXD2A-ASl?能參1?j??細(xì)胞轉(zhuǎn)錄過程從而發(fā)揮作用。??A?B??n?j?u?Cy3?Hoechst?Merged??512〇?■?Cytoplasm?L?>?…:」:?.'?i?|i?■-;?s??mi??i2::l?11?S'EBBH9??GAPDH?U6?SH3PXD2A-AS1?的??Q:??圖3-l?LncRNA?SH3PXD2A-AS1在滋養(yǎng)細(xì)胞的定位分布??Figure3-l?The?localization?and?distribution?of?IncRNA?SH3PXD2A-AS1?in?HTR8/SVnco??A:核質(zhì)分離實驗檢測丨ncRNA?SH3PXD2A-AS1的定位.GAPDH為細(xì)胞質(zhì)內(nèi)參,U6為細(xì)??胞核內(nèi)參:B:?FISH實驗驗證丨ncRNA?SH3PXD2A-AS1分布,lncRNA-l8S為
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長鏈非編碼RNA HOTAIR調(diào)節(jié)PE滋養(yǎng)細(xì)胞功能的研究[J]. 鄒艷芬,孫麗洲. 四川大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2015(01)
[2]Small nucleolar RNAs (snoRNAs) as potential non-invasive biomarkers for early cancer detection[J]. Wen-Dan Chen,Xiao-Feng Zhu. Chinese Journal of Cancer. 2013(02)
本文編號:3229794
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