人異位子宮內(nèi)膜差異表達(dá)基因的檢測(cè)及其超級(jí)增強(qiáng)子的篩選
發(fā)布時(shí)間:2021-05-28 09:30
目的:采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(ribonucleic acid-sequencing,RNA-Seq)實(shí)驗(yàn)方法分別對(duì)人正常和卵巢異位子宮內(nèi)膜組織進(jìn)行檢測(cè),一方面確定卵巢異位子宮內(nèi)膜組織中明顯差異表達(dá)的基因及可能影響子宮內(nèi)膜異位癥發(fā)病的生物學(xué)過(guò)程及信號(hào)通路,另一方面篩選出顯著高表達(dá)的基因,作為受超級(jí)增強(qiáng)子(super-enhancers,SEs)調(diào)控的潛在基因。采用結(jié)合位點(diǎn)分析測(cè)序(chromatin Immunoprecipitation-Sequencing,ChIP-Seq)實(shí)驗(yàn)方法針對(duì)組蛋白乙酰化賴(lài)氨酸27(H3K27ac)細(xì)胞標(biāo)記對(duì)人卵巢異位子宮內(nèi)膜組織進(jìn)行檢測(cè),結(jié)合第一部分RNA-Seq的結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)聯(lián)合分析,鑒定卵巢異位子宮內(nèi)膜組織差異高表達(dá)致病基因位點(diǎn)附近潛在的SEs。方法:獲取3對(duì)臨床25-40歲之間育齡期卵巢子宮內(nèi)膜異位癥(巧克力囊腫)患者的囊壁組織,每個(gè)標(biāo)本取相同質(zhì)量混樣作為實(shí)驗(yàn)組,同時(shí)取3對(duì)育齡期女性正常子宮內(nèi)膜組織(術(shù)后病理排除子宮內(nèi)膜異位癥或子宮腺肌癥疾。┗鞓幼鳛閷(duì)照組,利用Trizol法提取組織總RNA,對(duì)RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA后建庫(kù),高通量測(cè)序并進(jìn)行生物信...
【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
前言
材料與方法
一、主要試劑
二、主要儀器
三、實(shí)驗(yàn)組織標(biāo)本
四、實(shí)驗(yàn)方法
五、數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)與分析
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
一、RNA-Seq實(shí)驗(yàn)結(jié)果
二、ChIP-Seq實(shí)驗(yàn)結(jié)果
討論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
碩士在讀期間已發(fā)表論文情況
致謝
本文編號(hào):3208001
【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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英文縮略詞表
前言
材料與方法
一、主要試劑
二、主要儀器
三、實(shí)驗(yàn)組織標(biāo)本
四、實(shí)驗(yàn)方法
五、數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)與分析
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
一、RNA-Seq實(shí)驗(yàn)結(jié)果
二、ChIP-Seq實(shí)驗(yàn)結(jié)果
討論
參考文獻(xiàn)
綜述
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