宮頸癌遺傳基因變異與放療敏感性及預(yù)后的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-28 15:41
宮頸癌在全球女性惡性腫瘤中的發(fā)病率排名第四,是女性癌癥相關(guān)死亡的第二大主要原因。盡管近年來(lái),各國(guó)逐漸完善了宮頸癌癌前病變系統(tǒng)性的篩查以及人們進(jìn)行HPV疫苗的接種,但往往診斷時(shí)大多數(shù)已是中晚期。同步放化療是局部晚期宮頸癌的標(biāo)準(zhǔn)治療方案,部分宮頸癌患者表現(xiàn)出對(duì)輻射的抵抗,從而導(dǎo)致不良的預(yù)后,因此,如何提高宮頸癌放療療效,降低宮頸癌細(xì)胞放射抵抗性成為了如今研究的關(guān)鍵切入點(diǎn)。本研究將通過(guò)全外顯子組測(cè)序?qū)m頸癌放療敏感及預(yù)后相關(guān)基因進(jìn)行分析研究。研究方法:(1)測(cè)序分析:篩選并收集2014年至2016年在四川省腫瘤醫(yī)院進(jìn)行根治性放化療的宮頸鱗癌病例信息,經(jīng)過(guò)根治性放化療后3年內(nèi)未復(fù)發(fā)的病例歸為未復(fù)發(fā)組,即放射敏感組,反之,根治性放化療后3年內(nèi)局部復(fù)發(fā)的病例歸為復(fù)發(fā)組,即非放射敏感組。然后通過(guò)其年齡,分期以及治療前腫瘤大小進(jìn)行一對(duì)一匹配。從中挑選匹配后的32例病例進(jìn)行全外顯子測(cè)序,根據(jù)測(cè)序結(jié)果對(duì)其進(jìn)行一系列生物信息學(xué)分析及與預(yù)后相關(guān)聯(lián)的分析,篩選與放射敏感性及預(yù)后相關(guān)的變異基因。(2)驗(yàn)證分析:根據(jù)測(cè)序及分析所得的結(jié)果利用獨(dú)立樣本對(duì)測(cè)序的結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證分析。通過(guò)免疫組化分析,Sanger測(cè)序分析以及...
【文章來(lái)源】:電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
組織DNASNV與十大信號(hào)通路關(guān)聯(lián)統(tǒng)計(jì)圖
電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2-332例組織DNA中TRIM64基因突變結(jié)果示意圖圖2-4組織DNA中組間SNV差異基因結(jié)果2.3.3基因拷貝數(shù)變異結(jié)果(CNV)為了清楚顯示每個(gè)樣品中差異基因的表達(dá),使用R-pheat圖對(duì)復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組DNA中差異基因進(jìn)行了聚類(lèi)分析,結(jié)果顯示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58個(gè)基因在復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組間有顯著差異(秩和檢驗(yàn),p<0.05)(見(jiàn)圖2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在復(fù)發(fā)組發(fā)生拷貝數(shù)增加,且與未復(fù)發(fā)組有顯著差異(Fisher檢驗(yàn),p<0.05)(見(jiàn)圖2-6和圖2-7)。圖2-5差異基因表達(dá)熱圖
電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2-332例組織DNA中TRIM64基因突變結(jié)果示意圖圖2-4組織DNA中組間SNV差異基因結(jié)果2.3.3基因拷貝數(shù)變異結(jié)果(CNV)為了清楚顯示每個(gè)樣品中差異基因的表達(dá),使用R-pheat圖對(duì)復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組DNA中差異基因進(jìn)行了聚類(lèi)分析,結(jié)果顯示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58個(gè)基因在復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組間有顯著差異(秩和檢驗(yàn),p<0.05)(見(jiàn)圖2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在復(fù)發(fā)組發(fā)生拷貝數(shù)增加,且與未復(fù)發(fā)組有顯著差異(Fisher檢驗(yàn),p<0.05)(見(jiàn)圖2-6和圖2-7)。圖2-5差異基因表達(dá)熱圖
本文編號(hào):3105816
【文章來(lái)源】:電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
組織DNASNV與十大信號(hào)通路關(guān)聯(lián)統(tǒng)計(jì)圖
電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2-332例組織DNA中TRIM64基因突變結(jié)果示意圖圖2-4組織DNA中組間SNV差異基因結(jié)果2.3.3基因拷貝數(shù)變異結(jié)果(CNV)為了清楚顯示每個(gè)樣品中差異基因的表達(dá),使用R-pheat圖對(duì)復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組DNA中差異基因進(jìn)行了聚類(lèi)分析,結(jié)果顯示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58個(gè)基因在復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組間有顯著差異(秩和檢驗(yàn),p<0.05)(見(jiàn)圖2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在復(fù)發(fā)組發(fā)生拷貝數(shù)增加,且與未復(fù)發(fā)組有顯著差異(Fisher檢驗(yàn),p<0.05)(見(jiàn)圖2-6和圖2-7)。圖2-5差異基因表達(dá)熱圖
電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2-332例組織DNA中TRIM64基因突變結(jié)果示意圖圖2-4組織DNA中組間SNV差異基因結(jié)果2.3.3基因拷貝數(shù)變異結(jié)果(CNV)為了清楚顯示每個(gè)樣品中差異基因的表達(dá),使用R-pheat圖對(duì)復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組DNA中差異基因進(jìn)行了聚類(lèi)分析,結(jié)果顯示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58個(gè)基因在復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組間有顯著差異(秩和檢驗(yàn),p<0.05)(見(jiàn)圖2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在復(fù)發(fā)組發(fā)生拷貝數(shù)增加,且與未復(fù)發(fā)組有顯著差異(Fisher檢驗(yàn),p<0.05)(見(jiàn)圖2-6和圖2-7)。圖2-5差異基因表達(dá)熱圖
本文編號(hào):3105816
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