癌癥信息學(xué)研究:前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫(kù)與卵巢癌診斷標(biāo)志物
發(fā)布時(shí)間:2021-03-12 22:23
癌癥作為世界第二致死率的疾病,已經(jīng)越來(lái)受到人們的重視。在中國(guó),癌癥已成為民眾死亡的主要原因。癌癥的早期診斷對(duì)于其治療具有重要意義。隨著現(xiàn)代醫(yī)療理念和技術(shù)的不斷發(fā)展,以預(yù)測(cè)性(Predictive)、預(yù)防性(Preventive)、個(gè)性化(Personalized)、參與性(Participatory)為核心的P4醫(yī)學(xué)理論被廣泛認(rèn)知。我們針對(duì)P4醫(yī)學(xué)中的個(gè)性化和預(yù)測(cè)性醫(yī)學(xué)進(jìn)行了深入研究。其一,我們構(gòu)建了有關(guān)前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫(kù)“CNVPC”,設(shè)計(jì)了基于LAMP技術(shù)的B/S構(gòu)架下的web在線的前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)。該數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)來(lái)源于Pub Med的文獻(xiàn)檢索,我們會(huì)定期維護(hù)并更新數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)不僅具有自動(dòng)統(tǒng)計(jì)功能,而且有檢索功能,用戶可以查詢需要的信息并下載。這里,個(gè)性化醫(yī)學(xué)著重體現(xiàn)在數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)每條變異數(shù)據(jù)信息都有相對(duì)應(yīng)的樣本信息、病人信息以及實(shí)驗(yàn)平臺(tái)信息。其二,我們基于micro RNA-m RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)識(shí)別卵巢癌診斷的micro RNA生物標(biāo)志物。Micro RNA是一類具有調(diào)節(jié)基因表達(dá)功能的非編碼RNA,我們通過(guò)分析癌癥患者和正常人群的micro RNA表達(dá)數(shù)據(jù)找...
【文章來(lái)源】:蘇州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 P4醫(yī)學(xué)理論
1.2 本文研究
1.3 本課題探究的目的和意義
第二章 個(gè)性化醫(yī)學(xué)分析——前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建
2.1 前列腺癌的拷貝數(shù)目及其研究進(jìn)展
2.1.1 前列腺癌的拷貝數(shù)目的簡(jiǎn)介及其研究現(xiàn)狀
2.1.2 前列腺癌的拷貝數(shù)目變異的相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)
2.2 前列腺癌的拷貝數(shù)據(jù)變異數(shù)據(jù)庫(kù)
2.2.1 引言
2.2.2 開(kāi)發(fā)工具介紹
2.2.3 系統(tǒng)需求分析和設(shè)計(jì)
2.2.4 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
2.2.5 詳細(xì)設(shè)計(jì)和用戶界面
2.3 數(shù)據(jù)收集和統(tǒng)計(jì)分析
2.3.1 數(shù)據(jù)來(lái)源和收集
2.3.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和分析
2.4 前列腺癌拷貝數(shù)目變異生物信息學(xué)分析
2.5 個(gè)性化醫(yī)學(xué)分析
第三章 預(yù)測(cè)性醫(yī)學(xué)分析——基于網(wǎng)絡(luò)分析識(shí)別卵巢癌診斷的MicroRNA標(biāo)志物
3.1 引言
3.1.1 卵巢癌的簡(jiǎn)介
3.1.2 MicroRNA和生物標(biāo)記物的簡(jiǎn)介及其研究意義
3.1.3 富集分析的介紹
3.1.4 流程框架
3.2 卵巢癌MicroRNA的數(shù)據(jù)分析
3.2.1 數(shù)據(jù)來(lái)源與數(shù)據(jù)收集
3.2.2 miRNA-mRNA相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
3.2.3 MicroRNA的統(tǒng)計(jì)方法
3.3 卵巢癌篩選結(jié)果分析
3.3.1 已發(fā)表的作為卵巢癌的Biomarker的MicroRNA分析
3.3.2 作為卵巢癌生物標(biāo)記物的miRNA預(yù)測(cè)結(jié)果分析
3.3.3 聚類分析
3.3.4 結(jié)果預(yù)測(cè)性分析——ROC曲線分析
3.3.5 結(jié)果富集分析
第四章 總結(jié)和展望
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]microRNAs在卵巢癌的診斷和治療中的意義[J]. 申志華,馬秀梅,趙美榮. 疾病監(jiān)測(cè)與控制. 2015(03)
[2]miRNA與卵巢癌關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 朱愛(ài)萍,張潔,吳小華,于曉惠. 臨床誤診誤治. 2015(02)
[3]miRNA在卵巢癌發(fā)病機(jī)制研究中的現(xiàn)狀與進(jìn)展[J]. 崔開(kāi)穎,楊舒盈,朱根海,王雁. 海南醫(yī)學(xué). 2013(16)
[4]卵巢癌診斷和治療的現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 覃利菊. 中外醫(yī)學(xué)研究. 2013(19)
[5]網(wǎng)絡(luò)大數(shù)據(jù):現(xiàn)狀與展望[J]. 王元卓,靳小龍,程學(xué)旗. 計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2013(06)
[6]系統(tǒng)生物學(xué)在癌癥預(yù)測(cè)、預(yù)防和個(gè)體化治療中的潛在應(yīng)用價(jià)值[J]. 陳愷,杜琰,曹廣文. 解放軍預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2013(02)
[7]腫瘤標(biāo)記物在卵巢癌診斷中的研究進(jìn)展[J]. 陳立蘭,狄文. 國(guó)際婦產(chǎn)科學(xué)雜志. 2012(04)
[8]PEDF在腫瘤中的研究進(jìn)展[J]. 向江東,周莉娜,席曉薇. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2011(04)
[9]表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)的基因功能富集分析[J]. 劉明,王米渠,丁維俊,畢鋒. 生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志. 2010(05)
[10]卵巢癌早期篩查的爭(zhēng)議與展望[J]. 趙霞,鐘茜. 西部醫(yī)學(xué). 2009(01)
碩士論文
[1]整合卵巢癌拷貝數(shù)變異和差異表達(dá)基因的生物信息學(xué)分析[D]. 鄧禎祥.南方醫(yī)科大學(xué) 2014
本文編號(hào):3079084
【文章來(lái)源】:蘇州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 P4醫(yī)學(xué)理論
1.2 本文研究
1.3 本課題探究的目的和意義
第二章 個(gè)性化醫(yī)學(xué)分析——前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建
2.1 前列腺癌的拷貝數(shù)目及其研究進(jìn)展
2.1.1 前列腺癌的拷貝數(shù)目的簡(jiǎn)介及其研究現(xiàn)狀
2.1.2 前列腺癌的拷貝數(shù)目變異的相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)
2.2 前列腺癌的拷貝數(shù)據(jù)變異數(shù)據(jù)庫(kù)
2.2.1 引言
2.2.2 開(kāi)發(fā)工具介紹
2.2.3 系統(tǒng)需求分析和設(shè)計(jì)
2.2.4 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
2.2.5 詳細(xì)設(shè)計(jì)和用戶界面
2.3 數(shù)據(jù)收集和統(tǒng)計(jì)分析
2.3.1 數(shù)據(jù)來(lái)源和收集
2.3.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和分析
2.4 前列腺癌拷貝數(shù)目變異生物信息學(xué)分析
2.5 個(gè)性化醫(yī)學(xué)分析
第三章 預(yù)測(cè)性醫(yī)學(xué)分析——基于網(wǎng)絡(luò)分析識(shí)別卵巢癌診斷的MicroRNA標(biāo)志物
3.1 引言
3.1.1 卵巢癌的簡(jiǎn)介
3.1.2 MicroRNA和生物標(biāo)記物的簡(jiǎn)介及其研究意義
3.1.3 富集分析的介紹
3.1.4 流程框架
3.2 卵巢癌MicroRNA的數(shù)據(jù)分析
3.2.1 數(shù)據(jù)來(lái)源與數(shù)據(jù)收集
3.2.2 miRNA-mRNA相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
3.2.3 MicroRNA的統(tǒng)計(jì)方法
3.3 卵巢癌篩選結(jié)果分析
3.3.1 已發(fā)表的作為卵巢癌的Biomarker的MicroRNA分析
3.3.2 作為卵巢癌生物標(biāo)記物的miRNA預(yù)測(cè)結(jié)果分析
3.3.3 聚類分析
3.3.4 結(jié)果預(yù)測(cè)性分析——ROC曲線分析
3.3.5 結(jié)果富集分析
第四章 總結(jié)和展望
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]microRNAs在卵巢癌的診斷和治療中的意義[J]. 申志華,馬秀梅,趙美榮. 疾病監(jiān)測(cè)與控制. 2015(03)
[2]miRNA與卵巢癌關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 朱愛(ài)萍,張潔,吳小華,于曉惠. 臨床誤診誤治. 2015(02)
[3]miRNA在卵巢癌發(fā)病機(jī)制研究中的現(xiàn)狀與進(jìn)展[J]. 崔開(kāi)穎,楊舒盈,朱根海,王雁. 海南醫(yī)學(xué). 2013(16)
[4]卵巢癌診斷和治療的現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 覃利菊. 中外醫(yī)學(xué)研究. 2013(19)
[5]網(wǎng)絡(luò)大數(shù)據(jù):現(xiàn)狀與展望[J]. 王元卓,靳小龍,程學(xué)旗. 計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2013(06)
[6]系統(tǒng)生物學(xué)在癌癥預(yù)測(cè)、預(yù)防和個(gè)體化治療中的潛在應(yīng)用價(jià)值[J]. 陳愷,杜琰,曹廣文. 解放軍預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2013(02)
[7]腫瘤標(biāo)記物在卵巢癌診斷中的研究進(jìn)展[J]. 陳立蘭,狄文. 國(guó)際婦產(chǎn)科學(xué)雜志. 2012(04)
[8]PEDF在腫瘤中的研究進(jìn)展[J]. 向江東,周莉娜,席曉薇. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2011(04)
[9]表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)的基因功能富集分析[J]. 劉明,王米渠,丁維俊,畢鋒. 生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志. 2010(05)
[10]卵巢癌早期篩查的爭(zhēng)議與展望[J]. 趙霞,鐘茜. 西部醫(yī)學(xué). 2009(01)
碩士論文
[1]整合卵巢癌拷貝數(shù)變異和差異表達(dá)基因的生物信息學(xué)分析[D]. 鄧禎祥.南方醫(yī)科大學(xué) 2014
本文編號(hào):3079084
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