癌癥信息學研究:前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫與卵巢癌診斷標志物
發(fā)布時間:2021-03-12 22:23
癌癥作為世界第二致死率的疾病,已經(jīng)越來受到人們的重視。在中國,癌癥已成為民眾死亡的主要原因。癌癥的早期診斷對于其治療具有重要意義。隨著現(xiàn)代醫(yī)療理念和技術的不斷發(fā)展,以預測性(Predictive)、預防性(Preventive)、個性化(Personalized)、參與性(Participatory)為核心的P4醫(yī)學理論被廣泛認知。我們針對P4醫(yī)學中的個性化和預測性醫(yī)學進行了深入研究。其一,我們構建了有關前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫“CNVPC”,設計了基于LAMP技術的B/S構架下的web在線的前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。該數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)來源于Pub Med的文獻檢索,我們會定期維護并更新數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫不僅具有自動統(tǒng)計功能,而且有檢索功能,用戶可以查詢需要的信息并下載。這里,個性化醫(yī)學著重體現(xiàn)在數(shù)據(jù)庫中對每條變異數(shù)據(jù)信息都有相對應的樣本信息、病人信息以及實驗平臺信息。其二,我們基于micro RNA-m RNA調(diào)控網(wǎng)絡識別卵巢癌診斷的micro RNA生物標志物。Micro RNA是一類具有調(diào)節(jié)基因表達功能的非編碼RNA,我們通過分析癌癥患者和正常人群的micro RNA表達數(shù)據(jù)找...
【文章來源】:蘇州大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 P4醫(yī)學理論
1.2 本文研究
1.3 本課題探究的目的和意義
第二章 個性化醫(yī)學分析——前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫的構建
2.1 前列腺癌的拷貝數(shù)目及其研究進展
2.1.1 前列腺癌的拷貝數(shù)目的簡介及其研究現(xiàn)狀
2.1.2 前列腺癌的拷貝數(shù)目變異的相關數(shù)據(jù)庫
2.2 前列腺癌的拷貝數(shù)據(jù)變異數(shù)據(jù)庫
2.2.1 引言
2.2.2 開發(fā)工具介紹
2.2.3 系統(tǒng)需求分析和設計
2.2.4 數(shù)據(jù)結構
2.2.5 詳細設計和用戶界面
2.3 數(shù)據(jù)收集和統(tǒng)計分析
2.3.1 數(shù)據(jù)來源和收集
2.3.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析
2.4 前列腺癌拷貝數(shù)目變異生物信息學分析
2.5 個性化醫(yī)學分析
第三章 預測性醫(yī)學分析——基于網(wǎng)絡分析識別卵巢癌診斷的MicroRNA標志物
3.1 引言
3.1.1 卵巢癌的簡介
3.1.2 MicroRNA和生物標記物的簡介及其研究意義
3.1.3 富集分析的介紹
3.1.4 流程框架
3.2 卵巢癌MicroRNA的數(shù)據(jù)分析
3.2.1 數(shù)據(jù)來源與數(shù)據(jù)收集
3.2.2 miRNA-mRNA相互作用網(wǎng)絡的構建
3.2.3 MicroRNA的統(tǒng)計方法
3.3 卵巢癌篩選結果分析
3.3.1 已發(fā)表的作為卵巢癌的Biomarker的MicroRNA分析
3.3.2 作為卵巢癌生物標記物的miRNA預測結果分析
3.3.3 聚類分析
3.3.4 結果預測性分析——ROC曲線分析
3.3.5 結果富集分析
第四章 總結和展望
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]microRNAs在卵巢癌的診斷和治療中的意義[J]. 申志華,馬秀梅,趙美榮. 疾病監(jiān)測與控制. 2015(03)
[2]miRNA與卵巢癌關系的研究進展[J]. 朱愛萍,張潔,吳小華,于曉惠. 臨床誤診誤治. 2015(02)
[3]miRNA在卵巢癌發(fā)病機制研究中的現(xiàn)狀與進展[J]. 崔開穎,楊舒盈,朱根海,王雁. 海南醫(yī)學. 2013(16)
[4]卵巢癌診斷和治療的現(xiàn)狀及進展[J]. 覃利菊. 中外醫(yī)學研究. 2013(19)
[5]網(wǎng)絡大數(shù)據(jù):現(xiàn)狀與展望[J]. 王元卓,靳小龍,程學旗. 計算機學報. 2013(06)
[6]系統(tǒng)生物學在癌癥預測、預防和個體化治療中的潛在應用價值[J]. 陳愷,杜琰,曹廣文. 解放軍預防醫(yī)學雜志. 2013(02)
[7]腫瘤標記物在卵巢癌診斷中的研究進展[J]. 陳立蘭,狄文. 國際婦產(chǎn)科學雜志. 2012(04)
[8]PEDF在腫瘤中的研究進展[J]. 向江東,周莉娜,席曉薇. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學. 2011(04)
[9]表達譜芯片數(shù)據(jù)的基因功能富集分析[J]. 劉明,王米渠,丁維俊,畢鋒. 生物醫(yī)學工程學雜志. 2010(05)
[10]卵巢癌早期篩查的爭議與展望[J]. 趙霞,鐘茜. 西部醫(yī)學. 2009(01)
碩士論文
[1]整合卵巢癌拷貝數(shù)變異和差異表達基因的生物信息學分析[D]. 鄧禎祥.南方醫(yī)科大學 2014
本文編號:3079084
【文章來源】:蘇州大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 P4醫(yī)學理論
1.2 本文研究
1.3 本課題探究的目的和意義
第二章 個性化醫(yī)學分析——前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫的構建
2.1 前列腺癌的拷貝數(shù)目及其研究進展
2.1.1 前列腺癌的拷貝數(shù)目的簡介及其研究現(xiàn)狀
2.1.2 前列腺癌的拷貝數(shù)目變異的相關數(shù)據(jù)庫
2.2 前列腺癌的拷貝數(shù)據(jù)變異數(shù)據(jù)庫
2.2.1 引言
2.2.2 開發(fā)工具介紹
2.2.3 系統(tǒng)需求分析和設計
2.2.4 數(shù)據(jù)結構
2.2.5 詳細設計和用戶界面
2.3 數(shù)據(jù)收集和統(tǒng)計分析
2.3.1 數(shù)據(jù)來源和收集
2.3.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析
2.4 前列腺癌拷貝數(shù)目變異生物信息學分析
2.5 個性化醫(yī)學分析
第三章 預測性醫(yī)學分析——基于網(wǎng)絡分析識別卵巢癌診斷的MicroRNA標志物
3.1 引言
3.1.1 卵巢癌的簡介
3.1.2 MicroRNA和生物標記物的簡介及其研究意義
3.1.3 富集分析的介紹
3.1.4 流程框架
3.2 卵巢癌MicroRNA的數(shù)據(jù)分析
3.2.1 數(shù)據(jù)來源與數(shù)據(jù)收集
3.2.2 miRNA-mRNA相互作用網(wǎng)絡的構建
3.2.3 MicroRNA的統(tǒng)計方法
3.3 卵巢癌篩選結果分析
3.3.1 已發(fā)表的作為卵巢癌的Biomarker的MicroRNA分析
3.3.2 作為卵巢癌生物標記物的miRNA預測結果分析
3.3.3 聚類分析
3.3.4 結果預測性分析——ROC曲線分析
3.3.5 結果富集分析
第四章 總結和展望
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]microRNAs在卵巢癌的診斷和治療中的意義[J]. 申志華,馬秀梅,趙美榮. 疾病監(jiān)測與控制. 2015(03)
[2]miRNA與卵巢癌關系的研究進展[J]. 朱愛萍,張潔,吳小華,于曉惠. 臨床誤診誤治. 2015(02)
[3]miRNA在卵巢癌發(fā)病機制研究中的現(xiàn)狀與進展[J]. 崔開穎,楊舒盈,朱根海,王雁. 海南醫(yī)學. 2013(16)
[4]卵巢癌診斷和治療的現(xiàn)狀及進展[J]. 覃利菊. 中外醫(yī)學研究. 2013(19)
[5]網(wǎng)絡大數(shù)據(jù):現(xiàn)狀與展望[J]. 王元卓,靳小龍,程學旗. 計算機學報. 2013(06)
[6]系統(tǒng)生物學在癌癥預測、預防和個體化治療中的潛在應用價值[J]. 陳愷,杜琰,曹廣文. 解放軍預防醫(yī)學雜志. 2013(02)
[7]腫瘤標記物在卵巢癌診斷中的研究進展[J]. 陳立蘭,狄文. 國際婦產(chǎn)科學雜志. 2012(04)
[8]PEDF在腫瘤中的研究進展[J]. 向江東,周莉娜,席曉薇. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學. 2011(04)
[9]表達譜芯片數(shù)據(jù)的基因功能富集分析[J]. 劉明,王米渠,丁維俊,畢鋒. 生物醫(yī)學工程學雜志. 2010(05)
[10]卵巢癌早期篩查的爭議與展望[J]. 趙霞,鐘茜. 西部醫(yī)學. 2009(01)
碩士論文
[1]整合卵巢癌拷貝數(shù)變異和差異表達基因的生物信息學分析[D]. 鄧禎祥.南方醫(yī)科大學 2014
本文編號:3079084
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