目的·運(yùn)用蛋白芯片技術(shù)篩選多囊卵巢綜合征（polycystic ovary syndrome,PCOS）患者卵泡液的差異蛋白,為進(jìn)一步的PCOS研究提供理論依據(jù)。方法·采用AAH-BLG-507芯片檢測6例正常體質(zhì)量指數(shù)PCOS患者和6例年齡、體質(zhì)量指數(shù)匹配的非PCOS患者的卵泡液,篩選差異蛋白。采用功能注釋分析、KEGG通路分析和蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析方法對差異蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果·與非PCOS患者相比,PCOS組患者卵泡液中表達(dá)上調(diào)蛋白25個,表達(dá)下調(diào)蛋白49個。根據(jù)分子功能分類,差異蛋白主要具有細(xì)胞因子活性和趨化因子活性。KEGG通路分析提示差異蛋白富集于細(xì)胞因子間受體相互作用和趨化因子信號通路。蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析得到的核心蛋白主要為趨化因子及其受體。結(jié)論·運(yùn)用蛋白芯片技術(shù)能夠建立PCOS卵泡液差異表達(dá)蛋白譜,細(xì)胞因子間受體相互作用和趨化因子信號通路可能與PCOS的發(fā)病機(jī)制有關(guān)。 

【文章來源】：上海交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2020,40(08)北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁

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卵泡液中差異蛋白的分類

對74個差異表達(dá)蛋白進(jìn)行KEGG通路分析,結(jié)果顯示,富集到的蛋白數(shù)最多的3條通路為細(xì)胞因子間受體相互作用通路(P=5.48×10-37)、趨化因子信號通路(P=1.27×10-12)和JAK-STAT信號通路(P=2.79×10-7)。圖2展示了分別富集到36個蛋白(48.65%)和17個蛋白(22.97%)的細(xì)胞因子間受體相互作用通路和趨化因子信號通路。2.4 差異蛋白的PPI網(wǎng)絡(luò)分析

運(yùn)用STRING軟件進(jìn)行差異蛋白的PPI網(wǎng)絡(luò)分析,并將結(jié)果在Cytoscape軟件中進(jìn)行可視化(圖3)。使用cytoHubba插件對蛋白節(jié)點的度值進(jìn)行排序,度值前10的核心蛋白從高到低分別為CCR7、CXCR3、CCR1、CXCR2、CXCR1、IL10、KNG1、IL4、CXCL11、CX3CL1(圖4),其中CCR7、CCR1、CXCR2、CXCR1、IL10、KNG1、IL4、CXCL11在PCOS患者卵泡液中表達(dá)下調(diào),CXCR3和CX3CL1表達(dá)上調(diào)(圖3)。圖4 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中的核心蛋白


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