基于生物信息學(xué)分析化療影響乳腺癌和卵巢癌轉(zhuǎn)移的共同分子機(jī)制
發(fā)布時間:2021-02-08 23:31
乳腺癌和卵巢癌是婦女最常見的兩種惡性腫瘤,已成為嚴(yán)重危害女性健康、影響女性人群生活質(zhì)量的惡性疾病。雖然乳腺癌和卵巢癌的治療方法在不斷進(jìn)步,但仍未能有效逆轉(zhuǎn)其發(fā)病率逐年升高的趨勢,治療后出現(xiàn)的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移等惡性發(fā)展是導(dǎo)致乳腺癌和卵巢癌患者生存期短、預(yù)后不良的主要原因。乳腺癌和卵巢癌雖為兩種不同類型的惡性腫瘤,但它們具有遺傳背景相似、病理生理學(xué)過程相似、均為激素依賴性腫瘤等共同特征,這表明乳腺癌和卵巢癌之間是存在一定關(guān)系的;熥鳛槿橄侔┖吐殉舶┲委煹某R(guī)手段之一,在臨床上有著廣泛的應(yīng)用;熕幬锿ㄟ^其細(xì)胞毒性作用殺傷腫瘤細(xì)胞,通常用作乳腺癌和卵巢癌患者手術(shù)前后的輔助治療,或者作為保守治療方法應(yīng)用于不能接受手術(shù)的患者。但既往有研究表明,化療在殺傷腫瘤細(xì)胞的同時,還可能促進(jìn)其侵入血管,促使腫瘤轉(zhuǎn)移。然而目前的研究還未從系統(tǒng)的角度挖掘化療后促進(jìn)乳腺癌和卵巢癌轉(zhuǎn)移的共同標(biāo)志物。為了探索乳腺癌和卵巢癌患者化療后促進(jìn)轉(zhuǎn)移的共同潛在標(biāo)志物,本研究基于生物信息學(xué)的方法分析了乳腺癌和卵巢癌患者的相關(guān)基因表達(dá)譜,通過篩選化療后的差異基因、富集通路分析、構(gòu)建加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)、劃分模塊并篩選樞紐基因、文獻(xiàn)驗(yàn)證及...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮寫詞表
第一章 緒論
1.1 乳腺癌和卵巢癌兩大女性癌癥的流行病學(xué)及治療現(xiàn)狀
1.1.1 乳腺癌的流行病學(xué)及治療現(xiàn)狀
1.1.2 卵巢癌的流行病學(xué)及治療現(xiàn)狀
1.1.3 乳腺癌和卵巢癌的相關(guān)性
1.1.4 化療對腫瘤轉(zhuǎn)移的影響
1.2 生物信息學(xué)在癌癥研究中的應(yīng)用
1.2.1 生物信息學(xué)簡介
1.2.2 GEO數(shù)據(jù)庫
1.2.3 GO及 KEGG富集分析
1.2.4 WGCNA理論基礎(chǔ)
1.2.5 癌癥中的微陣列生物信息學(xué)
1.3 研究目的
第二章 研究材料與方法
2.1 研究材料
2.1.1 數(shù)據(jù)來源
2.1.2 分析工具
2.2 研究方法
2.2.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.2.2 差異表達(dá)分析
2.2.3 GO基因本體論分析及KEGG信號通路分析
2.2.4 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
2.2.5 樞紐基因的鑒定
2.2.6 共同基因的篩選
2.2.7 文獻(xiàn)驗(yàn)證和生存分析
第三章 研究結(jié)果
3.1 化療后乳腺癌相關(guān)基因的表達(dá)變化及樞紐基因的鑒定
3.1.1 差異表達(dá)分析
3.1.2 差異表達(dá)基因KEGG和 GO富集分析
3.1.3 差異表達(dá)基因的加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
3.1.4 Blue模塊基因GO和 KEGG富集分析
3.1.5 Blue模塊樞紐基因的鑒定
3.2 化療后卵巢癌相關(guān)基因的表達(dá)變化及樞紐基因的鑒定
3.2.1 差異表達(dá)分析
3.2.2 差異表達(dá)基因KEGG和 GO富集分析
3.2.3 差異表達(dá)基因的加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
3.2.4 Turpuoise模塊基因GO和 KEGG富集分析
3.2.5 Turpuoise模塊樞紐基因的鑒定
3.3 共同基因的篩選
3.4 轉(zhuǎn)移相關(guān)樞紐基因的鑒定和生存分析
3.5 化療導(dǎo)致基因差異表達(dá)的驗(yàn)證
第四章 討論
第五章 結(jié)論與創(chuàng)新性
參考文獻(xiàn)
作者簡介及在學(xué)期間所取得的科研成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2015年中國惡性腫瘤流行情況分析[J]. 鄭榮壽,孫可欣,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),陳茹,顧秀瑛,魏文強(qiáng),赫捷. 中華腫瘤雜志. 2019 (01)
[2]新輔助化療對晚期卵巢癌治療應(yīng)用價值的評估及多因素分析[J]. 邊策,綦小蓉,姚奎,趙際童,李黎,趙霞. 實(shí)用婦產(chǎn)科雜志. 2016(04)
本文編號:3024671
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮寫詞表
第一章 緒論
1.1 乳腺癌和卵巢癌兩大女性癌癥的流行病學(xué)及治療現(xiàn)狀
1.1.1 乳腺癌的流行病學(xué)及治療現(xiàn)狀
1.1.2 卵巢癌的流行病學(xué)及治療現(xiàn)狀
1.1.3 乳腺癌和卵巢癌的相關(guān)性
1.1.4 化療對腫瘤轉(zhuǎn)移的影響
1.2 生物信息學(xué)在癌癥研究中的應(yīng)用
1.2.1 生物信息學(xué)簡介
1.2.2 GEO數(shù)據(jù)庫
1.2.3 GO及 KEGG富集分析
1.2.4 WGCNA理論基礎(chǔ)
1.2.5 癌癥中的微陣列生物信息學(xué)
1.3 研究目的
第二章 研究材料與方法
2.1 研究材料
2.1.1 數(shù)據(jù)來源
2.1.2 分析工具
2.2 研究方法
2.2.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.2.2 差異表達(dá)分析
2.2.3 GO基因本體論分析及KEGG信號通路分析
2.2.4 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
2.2.5 樞紐基因的鑒定
2.2.6 共同基因的篩選
2.2.7 文獻(xiàn)驗(yàn)證和生存分析
第三章 研究結(jié)果
3.1 化療后乳腺癌相關(guān)基因的表達(dá)變化及樞紐基因的鑒定
3.1.1 差異表達(dá)分析
3.1.2 差異表達(dá)基因KEGG和 GO富集分析
3.1.3 差異表達(dá)基因的加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
3.1.4 Blue模塊基因GO和 KEGG富集分析
3.1.5 Blue模塊樞紐基因的鑒定
3.2 化療后卵巢癌相關(guān)基因的表達(dá)變化及樞紐基因的鑒定
3.2.1 差異表達(dá)分析
3.2.2 差異表達(dá)基因KEGG和 GO富集分析
3.2.3 差異表達(dá)基因的加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
3.2.4 Turpuoise模塊基因GO和 KEGG富集分析
3.2.5 Turpuoise模塊樞紐基因的鑒定
3.3 共同基因的篩選
3.4 轉(zhuǎn)移相關(guān)樞紐基因的鑒定和生存分析
3.5 化療導(dǎo)致基因差異表達(dá)的驗(yàn)證
第四章 討論
第五章 結(jié)論與創(chuàng)新性
參考文獻(xiàn)
作者簡介及在學(xué)期間所取得的科研成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2015年中國惡性腫瘤流行情況分析[J]. 鄭榮壽,孫可欣,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),陳茹,顧秀瑛,魏文強(qiáng),赫捷. 中華腫瘤雜志. 2019 (01)
[2]新輔助化療對晚期卵巢癌治療應(yīng)用價值的評估及多因素分析[J]. 邊策,綦小蓉,姚奎,趙際童,李黎,趙霞. 實(shí)用婦產(chǎn)科雜志. 2016(04)
本文編號:3024671
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