長鏈非編碼RNA MEG8(Rian)在胎盤發(fā)育中的功能及機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-20 17:49
【背景及目的】早期自然流產(chǎn)是妊娠常見不良結(jié)局之一,在臨床確診的妊娠中自然流產(chǎn)的發(fā)生率達(dá)15%左右,目前已知的造成自然流產(chǎn)的病因有很多,包括胚胎染色異常、感染、免疫缺陷等等;而其中仍然有約50%為以上是病因不明的自然流產(chǎn)。胎盤的正常發(fā)育是維持妊娠中胚胎存活和生長的必要條件之一,其生長和發(fā)育由一系列精密復(fù)雜的因素調(diào)控,當(dāng)胎盤的生長發(fā)育中任一環(huán)節(jié)發(fā)生異常時(shí)常會(huì)導(dǎo)致妊娠相關(guān)疾病的發(fā)生。其中,滋養(yǎng)層細(xì)胞作為胎盤的主要組成部分,在胎盤發(fā)育過程中扮演重要角色,它參與了胚胎著床、啟動(dòng)胎盤形成、調(diào)控血管分化、內(nèi)分泌以及免疫保護(hù)等過程,從而維持妊娠順利進(jìn)行。當(dāng)滋養(yǎng)層細(xì)胞的發(fā)育或功能異常,則會(huì)導(dǎo)致胎盤的發(fā)育或功能的缺陷,引起早期妊娠失敗等妊娠相關(guān)疾病的發(fā)生。因此,深入了解調(diào)控胎盤滋養(yǎng)層細(xì)胞的發(fā)育和功能的相關(guān)調(diào)節(jié)機(jī)制,闡明造成不明原因流產(chǎn)的因素以及可能參與不明原因流產(chǎn)發(fā)生的機(jī)制是非常有必要的,這將為解釋妊娠相關(guān)疾病的發(fā)生提供重要理論支持。自lncRNA被發(fā)現(xiàn)以來,越來越多的研究證實(shí)長鏈非編碼RNA通過不同的分子機(jī)制參與調(diào)控多種基本生物過程,例如X染色體激活,基因組印記,細(xì)胞分化與增殖,細(xì)胞遷移以及細(xì)胞凋亡等。...
【文章來源】:中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
lncRNA芯片結(jié)果
圖 5.差異表達(dá)基因 STC 分析Figure5. Series Tests of Cluster analysis of differentially expressed genes. Each boxcorresponds to a model expression profile. And the colored profiles have a statistically significannumber of genes assigned (ordered by significance). The same color represents the same trend of thegene expression in the cluster. The fold line represents the gene expression trend, display the geneexpression change over time. In the box, the upper left number was the Profile number, the lower lefwas the P- value of number of genes assigned versus expected.如圖所示,每個(gè) Profile 集合包含表達(dá)模式相同的多個(gè)基因簇。共有 16 個(gè) Profile模型用于描述這些差異表達(dá)基因的表達(dá)模式,圖中每個(gè)方塊表示一個(gè)基因集合,標(biāo)有顏色的方塊代表其差異具有顯著意義(P<0.05),相同顏色代表相似表達(dá)趨勢(shì)。其中l(wèi)ncRNAs 的 16 個(gè) Profile 中共有 6 個(gè)具有差異顯著性,包括下調(diào)表達(dá)基因集合簇 Profile2、3 和 7;上調(diào)表達(dá)基因集合簇 Profile 8、12 和 13。mRNAs 的 16 個(gè) Profile 中有 7個(gè)有差異顯著性,分別為下調(diào)表達(dá)基因集合簇 Profile 0、2、3 和 7;上調(diào)表達(dá)基因集合簇 Profile 8 和 13,以及一個(gè)表達(dá)先上升后下降的基因集合簇 Profile 9。
- 18 -圖 2. GO 富集分析Figure2. GO Analysis of different expression genes during placental development. Geneontology (GO) terms for differentially expressed mRNAs during the mouse placental developmentwere analysis by the DAVID Bioinformatics Resources. The top 10 GO terms for mRNAsdifferentially expressed between the groups are shown. (a). The top ten GO terms of biologicalprocess(BP), Cellular Component(CC) and Molecular Function(MF) for upregulated genes. (b).The top ten GO terms of biological process(BP), Cellular Component(CC) and MolecularFunction(MF) for downregulated genes.如圖所示,在上調(diào)差異表達(dá)的 mRNAs 中富集程度最高的前 5 個(gè)生物學(xué)功能(BP)分別是 oxidation-reduction process、acute-phase response、epoxygenase P450 pathway、metabolic process 和 lipid metabolic process;富集程度最高的前 5 個(gè)細(xì)胞組分(CC)條目
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]印記基因:發(fā)育中的重要調(diào)節(jié)因子[J]. 吳瑜,馮旭,高嵐,焦保衛(wèi). 遺傳. 2016(06)
[2]長鏈非編碼RNA HOTAIR調(diào)節(jié)PE滋養(yǎng)細(xì)胞功能的研究[J]. 鄒艷芬,孫麗洲. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(01)
本文編號(hào):2989493
【文章來源】:中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
lncRNA芯片結(jié)果
圖 5.差異表達(dá)基因 STC 分析Figure5. Series Tests of Cluster analysis of differentially expressed genes. Each boxcorresponds to a model expression profile. And the colored profiles have a statistically significannumber of genes assigned (ordered by significance). The same color represents the same trend of thegene expression in the cluster. The fold line represents the gene expression trend, display the geneexpression change over time. In the box, the upper left number was the Profile number, the lower lefwas the P- value of number of genes assigned versus expected.如圖所示,每個(gè) Profile 集合包含表達(dá)模式相同的多個(gè)基因簇。共有 16 個(gè) Profile模型用于描述這些差異表達(dá)基因的表達(dá)模式,圖中每個(gè)方塊表示一個(gè)基因集合,標(biāo)有顏色的方塊代表其差異具有顯著意義(P<0.05),相同顏色代表相似表達(dá)趨勢(shì)。其中l(wèi)ncRNAs 的 16 個(gè) Profile 中共有 6 個(gè)具有差異顯著性,包括下調(diào)表達(dá)基因集合簇 Profile2、3 和 7;上調(diào)表達(dá)基因集合簇 Profile 8、12 和 13。mRNAs 的 16 個(gè) Profile 中有 7個(gè)有差異顯著性,分別為下調(diào)表達(dá)基因集合簇 Profile 0、2、3 和 7;上調(diào)表達(dá)基因集合簇 Profile 8 和 13,以及一個(gè)表達(dá)先上升后下降的基因集合簇 Profile 9。
- 18 -圖 2. GO 富集分析Figure2. GO Analysis of different expression genes during placental development. Geneontology (GO) terms for differentially expressed mRNAs during the mouse placental developmentwere analysis by the DAVID Bioinformatics Resources. The top 10 GO terms for mRNAsdifferentially expressed between the groups are shown. (a). The top ten GO terms of biologicalprocess(BP), Cellular Component(CC) and Molecular Function(MF) for upregulated genes. (b).The top ten GO terms of biological process(BP), Cellular Component(CC) and MolecularFunction(MF) for downregulated genes.如圖所示,在上調(diào)差異表達(dá)的 mRNAs 中富集程度最高的前 5 個(gè)生物學(xué)功能(BP)分別是 oxidation-reduction process、acute-phase response、epoxygenase P450 pathway、metabolic process 和 lipid metabolic process;富集程度最高的前 5 個(gè)細(xì)胞組分(CC)條目
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]印記基因:發(fā)育中的重要調(diào)節(jié)因子[J]. 吳瑜,馮旭,高嵐,焦保衛(wèi). 遺傳. 2016(06)
[2]長鏈非編碼RNA HOTAIR調(diào)節(jié)PE滋養(yǎng)細(xì)胞功能的研究[J]. 鄒艷芬,孫麗洲. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(01)
本文編號(hào):2989493
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