目的探索人乳頭狀瘤病毒（human papilloma virus,HPV）陽性和陰性頭頸部鱗狀細(xì)胞癌（head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC）的差異表達(dá)基因及關(guān)鍵通路,為HPV相關(guān)HNSCC的診斷和治療提供候選基因靶點(diǎn)。方法從美國國立生物技術(shù)信息中心（Gene Expression Omnibus,GEO）數(shù)據(jù)庫中檢索獲得序號(hào)為GSE3292的HPV相關(guān)HNSCC表達(dá)譜芯片研究系列（其中HPV 陽性癌組織8例、陰性28例,含口腔癌15例、口咽癌9例、喉癌9例、下咽癌3例）,通過Gene-Cloud of Biotechnology Information（GCBI）分析平臺(tái)篩選得到差異表達(dá)基因,運(yùn)用DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行基因本體分析和信號(hào)通路富集分析。通過STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)后,利用Cytoscape軟件篩選關(guān)鍵基因并進(jìn)一步行信號(hào)通路富集分析,最后使用UALCAN數(shù)據(jù)分析工具檢驗(yàn)關(guān)鍵基因在癌癥基因組圖譜（the cancer genome atlas,TCGA）數(shù)據(jù)庫中的表達(dá)差異性。結(jié)果從芯片檢測(cè)的25 000多個(gè)基因中... 

【文章來源】：中華口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2020年08期 北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁


本文編號(hào)：2933044