本文關(guān)鍵詞：基于oncomine和qPCR篩選高度鱗狀上皮內(nèi)病變相關(guān)基因，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的： 利用Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)篩選在宮頸鱗癌患者中高表達(dá)的基因,用實(shí)時(shí)熒光定量PCR (Real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction, qPCR)技術(shù)比較這些基因在高度鱗狀上皮內(nèi)病變(HSIL)患者中的表達(dá)情況,尋找表達(dá)異常的基因,探索與早期宮頸癌相關(guān)的基因。 方法： 利用Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘在宮頸鱗癌中高表達(dá)的基因,加權(quán)計(jì)算后,重新排序,篩選出表達(dá)差異顯著的基因；選擇本地區(qū)12例高度鱗狀上皮內(nèi)病變(HSIL)病人,均行宮頸錐切術(shù)治療,在已切下的宮頸組織中,分別選擇病變組織和正常的官頸組織,分別提取組織中的RNA,逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,采用qPCR技術(shù)檢測(cè),以公式：2△△ct＝2△Ct病變組織/2△ct正常組織(Ct值是指反應(yīng)時(shí)收集的實(shí)時(shí)熒光強(qiáng)度達(dá)到設(shè)定閾值時(shí)所經(jīng)歷的擴(kuò)增循環(huán)數(shù))計(jì)算各基因表達(dá)的差異倍數(shù),并用配對(duì)t檢驗(yàn),對(duì)比其在宮頸鱗癌病人中的表達(dá)。 結(jié)果： 在Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)中挖掘出8個(gè)(MMP1, SPP1, APOC1, MMP12, NEK2, ECT2, IDO1, HELLS)在宮頸鱗癌病人中高表達(dá)的基因；在HSIL病人中,通過(guò)qPCR技術(shù)檢測(cè)及數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析后,發(fā)現(xiàn)有7個(gè)在宮頸鱗癌中高表達(dá)的基因(MMP1,SPP1, APOC1, MMP12, ECT2, IDO1, HELLS),在HSIL病人中同樣呈高表達(dá),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),只有一個(gè)基因(NEK2)在本次實(shí)驗(yàn)的HSIL病人中表達(dá)無(wú)差異。 結(jié)論： 利用Oncomine的大樣本數(shù)據(jù),能迅速準(zhǔn)確地挖掘出與宮頸鱗癌相關(guān)的基因。在宮頸鱗癌和在HSIL中共同高表達(dá)的7個(gè)基因,可能參與HSIL轉(zhuǎn)化為宮頸鱗癌的過(guò)程,豐富了宮頸鱗癌的早期預(yù)警指標(biāo)體系,為宮頸癌的早發(fā)現(xiàn)、預(yù)防及有效治療提供科學(xué)依據(jù),在可能為今后的深入研究奠定基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】：Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù) qPCR 高度鱗狀上皮內(nèi)病變 宮頸鱗癌
【學(xué)位授予單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：R737.33
【目錄】：

• 致謝4-5
• 中文摘要5-7
• Abstract7-9
• 目錄9-10
• 1 緒論10-13
• 2 材料和方法13-20
• 2.1 實(shí)驗(yàn)器材與儀器13-16
• 2.2 實(shí)驗(yàn)方法16-19
• 2.3 數(shù)據(jù)分析19-20
• 3 結(jié)果20-43
• 3.1 oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)基因篩選20-33
• 3.2 各樣本RNA質(zhì)檢報(bào)告33-34
• 3.3 每一個(gè)病人不同組織中基因的表達(dá)差異結(jié)果34-38
• 3.4 每一個(gè)基因在不同病人不同組織中的表達(dá)差異結(jié)果38-43
• 4 討論43-46
• 5 總結(jié)46-47
• 參考文獻(xiàn)47-53
• 綜述53-59
• 參考文獻(xiàn)56-59
• 作者簡(jiǎn)歷及在讀期所取得的科研成果59

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

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  本文關(guān)鍵詞：基于oncomine和qPCR篩選高度鱗狀上皮內(nèi)病變相關(guān)基因，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：264379