【摘要】：作為一種特殊的個(gè)體突變，融合基因是由兩個(gè)相鄰基因的全部或一部分序列相互融合，通過(guò)基因間剪接從而形成的一種新的轉(zhuǎn)錄物。越來(lái)越多的研究表明，融合基因與多種腫瘤的形成和發(fā)展密切相關(guān)，，但是與子宮內(nèi)膜癌的相關(guān)性研究還尚未報(bào)道。本研究采用Ilumina HiSequence2000測(cè)序平臺(tái)對(duì)9對(duì)子宮內(nèi)膜癌和癌旁組織進(jìn)行100bp雙末端轉(zhuǎn)錄本測(cè)序檢測(cè)差異表達(dá)的融合基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn)位于子宮內(nèi)膜癌易感區(qū)域1q42.2內(nèi)的融合轉(zhuǎn)錄本TSNAX-DISC1在子宮內(nèi)膜癌和癌旁組織中存在顯著的表達(dá)差異，該融合轉(zhuǎn)錄本在多數(shù)癌組織中的表達(dá)水平顯著上調(diào)。利用逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)（reverse transcription PCR，RT-PCR）的方法，我們發(fā)現(xiàn)融合轉(zhuǎn)錄本TSNAX-DISC1并非通過(guò)染色體重排的方式形成，而是由相鄰基因TSNAX和DISC1的基因間剪接導(dǎo)致的。進(jìn)一步的數(shù)據(jù)分析顯示，CCCTC-結(jié)合因子（CTCF）在TSNAX和DISC1基因間的絕緣子元件上的結(jié)合強(qiáng)度與該融合轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)水平呈負(fù)相關(guān)。位于TSNAX和DISC1基因間的長(zhǎng)鏈非編碼RNAlincRNA-NR_034037，通過(guò)干擾絕緣子與CTCF的相互作用調(diào)控融合轉(zhuǎn)錄本TSNAX-DISC1的形成以及TSNAX/DISC1的表達(dá)水平。另外，熒光素酶報(bào)告基因以及染色質(zhì)免疫共沉淀（ChIP）實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，異常表達(dá)的TSNAX可顯著抑制TRAX、Translin和SF-1三者形成的蛋白復(fù)合體在類(lèi)固醇激素合成急性調(diào)控蛋白（StAR）基因啟動(dòng)子上的募集，調(diào)節(jié)StAR基因的轉(zhuǎn)錄活性。這些研究結(jié)果表明，lincRNA-NR_034037可能通過(guò)調(diào)控融合轉(zhuǎn)錄本TSNAX-DISC1的形成，參與子宮內(nèi)膜癌的病理過(guò)程。
[Abstract]:As a special individual mutation, fusion gene is a new transcription material, which is formed by the fusion of all or part of the sequence of two adjacent genes by splicing between genes. More and more studies have shown that the fusion gene is closely related to the formation and development of multiple tumors, but the correlation with endometrial carcinoma has not been reported. In this study, Ilumina HiSequence2000 sequencing platform was used to detect the differentially expressed fusion genes in 9 pairs of endometrial carcinoma and adjacent tissues by 100bp double terminal transcripts sequencing. The results showed that there was a significant difference in the expression of fusion transcript TSNAX-DISC1 in endometrial carcinoma and paracancerous tissues, and the expression level of the fusion transcript was up-regulated in most cancer tissues. By reverse transcriptase polymerase chain reaction (reverse transcription PCR,RT-PCR), we found that the fusion transcripts TSNAX-DISC1 were not formed by chromosome rearrangement, but by splicing between adjacent genes TSNAX and DISC1. Further data analysis showed that the binding intensity of CCCTC- binding factor (CTCF) on insulator elements between TSNAX and DISC1 genes was negatively correlated with the expression level of the fusion transcript. The long strand non-coding RNAlincRNA-NR_034037, located between TSNAX and DISC1 genes regulates the formation of TSNAX-DISC1 and the expression of TSNAX/DISC1 by interfering with the interaction between insulators and CTCF. In addition, luciferase reporter gene and chromatin immunoprecipitation (ChIP) results showed that, The abnormal expression of TSNAX could significantly inhibit the recruitment of protein complexes formed by TRAX,Translin and SF-1 on the promoter of steroid hormone synthesis acute regulatory protein (StAR) gene and regulate the transcriptional activity of StAR gene. These results suggest that lincRNA-NR034037 may be involved in the pathological process of endometrial carcinoma by regulating the formation of fusion transcripts TSNAX-DISC1.
【學(xué)位授予單位】：蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類(lèi)號(hào)】：R737.33

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2218150