【摘要】：目的通過篩選及驗(yàn)證在子癇前期患者胎盤組織中差異表達(dá)的長鏈非編碼RNA(lncRNA),探討lncRNA與子癇前期的關(guān)系。方法收集18例子癇前期胎盤樣本和同期出生的20例正常妊娠產(chǎn)兒胎盤樣本,采用lncRNA芯片進(jìn)行研究,篩選出差異表達(dá)的lncRNA及基因,采用國際通用的基因本體(GO)功能注釋分析法和KEGG通路分析法,對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行功能注釋與分析,并進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)驗(yàn)證。結(jié)果檢測(cè)到顯著差異表達(dá)的lncRNA共有14個(gè),其中表達(dá)上調(diào)的有9個(gè),表達(dá)下調(diào)的有5個(gè);檢測(cè)到顯著差異表達(dá)基因212個(gè),表達(dá)上調(diào)的93個(gè),表達(dá)下調(diào)的119個(gè)。對(duì)212個(gè)差異表達(dá)的基因進(jìn)行GO功能注釋分析,顯示差異表達(dá)基因主要參與染色質(zhì)結(jié)合、γ-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶的活性和SMAD結(jié)合等信號(hào)途徑;KEGG通路分析結(jié)果顯示,差異表達(dá)的基因包括細(xì)胞周期相關(guān)、補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)相關(guān)、全身性紅斑狼瘡相關(guān)等與信號(hào)通路相關(guān)的作用基因。對(duì)顯著差異表達(dá)的3個(gè)lncRNA:linc-ASCL1-3、linc-KLF6-2和linc-ROBO1-3進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證,其結(jié)果與lncRNA芯片檢測(cè)結(jié)果相符。結(jié)論子癇前期的胎盤組織與正常胎盤組織相比,lncRNA表達(dá)譜發(fā)生了顯著變化,可能與子癇前期的發(fā)生有關(guān)。
[Abstract]:Objective To investigate the relationship between long-stranded non-coding RNA (lncRNA) and preeclampsia by screening and validating the differentially expressed long-stranded non-coding RNA (lncRNA) in placenta of preeclampsia patients. And the genes were analyzed and annotated by the international gene ontology (GO) functional annotation analysis and KEGG pathway analysis, and verified by real-time fluorescence quantitative PCR (qRT-PCR). There were 212 differentially expressed genes, 93 up-regulated genes and 119 down-regulated genes. GO functional annotation analysis of 212 differentially expressed genes showed that the differentially expressed genes were mainly involved in chromatin binding, the activity of gamma-glutamyltransferase and the binding of SMAD; KEGG pathway analysis showed that differentially expressed gene packages were mainly involved in chromatin binding, gamma-glutamyltransferase activity and SMAD binding. The results of qRT-PCR were consistent with the results of lncRNA chip detection. Conclusion Preeclampsia placenta tissues and positive placenta tissues were found to be significantly differentially expressed by three lncRNA: linc-ASCL1-3, linc-KLF6-2 and linc-ROBO1-3. Compared with normal placenta, the expression profile of lncRNA has changed significantly, which may be related to the occurrence of preeclampsia.
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州醫(yī)院產(chǎn)科;勝利石油管理局錦苑衛(wèi)生院;南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州醫(yī)院新生兒科;
【基金】：江蘇省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(BK20131151) 蘇州市臨床診療技術(shù)專項(xiàng)基金資助項(xiàng)目(LCZX201308) 蘇州市臨床醫(yī)學(xué)中心(SZZX201505) 蘇州市產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新專項(xiàng)基金資助項(xiàng)目(SYS2015104,SYS201568) 蘇州市科教興衛(wèi)資助項(xiàng)目(KJXW2015022)
【分類號(hào)】：R714.244

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本文編號(hào)：2180225