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人卵巢癌OVCAR3細(xì)胞FOXM1相關(guān)差異miRNA表達(dá)譜分析鑒定

發(fā)布時(shí)間:2018-06-14 01:07

  本文選題:FOXM + MiRNA; 參考:《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2015年09期


【摘要】:為探究人卵巢癌OVCAR3細(xì)胞FOXM1基因敲減前后miRNA表達(dá)差異,并建立FOXM1相關(guān)miRNA差異表達(dá)譜,我們應(yīng)用感染復(fù)數(shù)為20的靶向FOXM1 shRNA慢病毒顆粒及陰性對(duì)照慢病毒感染人卵巢癌OVCAR3細(xì)胞96 h,此后提取并鑒定細(xì)胞總RNA,純化分離miRNA,應(yīng)用高通量miRNA芯片技術(shù)分析2組miRNA的表達(dá)差異,并對(duì)5倍以上差異表達(dá)的miRNA進(jìn)行RT-PCR驗(yàn)證。通過實(shí)驗(yàn)我們共發(fā)現(xiàn)34個(gè)miRNA發(fā)生表達(dá)變化,其中上調(diào)超過5倍的miRNA 4個(gè):miR-327、miR-505、miR-1297、miR-122;下調(diào)超過5倍3個(gè):miR-21、miR-409-3p、miR-200a,其中miR-122、miR-1297、miR-21、miR-200a等4個(gè)miRNA經(jīng)RT-PCR驗(yàn)證為真實(shí)差異表達(dá)。這表明我們成功建立人卵巢癌OVCAR3細(xì)胞FOXM1相關(guān)miRNA差異表達(dá)譜,所篩選出的差異表達(dá)miRNA可能與FOXM1具有密切調(diào)控關(guān)系。
[Abstract]:To investigate the difference of miRNA expression before and after FOXM1 gene knockout in human ovarian cancer OVCAR3 cells, and to establish the differential expression profile of FOXM1 related miRNA. Human ovarian cancer OVCAR3 cells were infected with 20 target FOXM1 shRNA lentivirus particles and negative control lentivirus for 96 h. After that, the total RNAs were extracted and identified, the miRNAs were purified and isolated, and the difference of miRNA expression between the two groups was analyzed by high-throughput miRNA chip technique. The miRNA differentially expressed more than 5 times was confirmed by RT-PCR. A total of 34 miRNA expression changes were found in the experiment, of which 4: miR-327nmiR-505miR-505miR-1297 miR-122 were up-regulated, and 3 miR-21miR-409-3pmmiR-200adown-regulated. Four miRNAs including miR-122mmiR-1297miR-21 miR-200a were confirmed as true differentially expressed by RT-PCR. These results suggest that we have successfully established the differentially expressed miRNA profiles of FOXM1-associated miRNA in human ovarian cancer OVCAR3 cells, and the differentially expressed miRNAs may be closely related to FOXM1.
【作者單位】: 贛南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院婦產(chǎn)科;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81260385)資助
【分類號(hào)】:R737.31

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2016347

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