用基因芯片技術篩選人子宮內膜癌細胞株中紫杉醇耐藥相關基因
本文選題:基因芯片技術 + 子宮腫瘤; 參考:《山東醫(yī)藥》2015年19期
【摘要】:目的應用基因芯片技術篩選人子宮內膜癌細胞株中獲得性紫杉醇(TAX)耐藥相關基因。方法采用大劑量間歇誘導法,用TAX反復沖擊誘導培養(yǎng)人子宮內膜癌Ishikawa細胞株,建成Ishikawa/TAX耐藥株。應用Affymetrix Human Genome U133 Plus2.0表達譜芯片檢測Ishikawa/TAX與Ishikawa細胞株基因。通過Gene Ontology(GO)聚類分析對差異表達的基因予以分類。采用qRT-PCR對部分差異表達的基因進行驗證。結果與Ishikawa細胞相比,Ishikawa/TAX細胞中有110條基因表達有顯著性差異(ratio比值3),包括87個上調基因、23個下調基因,GO分類涉及細胞信號傳導和調控、細胞黏附分子、細胞代謝及轉錄調控等;其中上調最明顯的基因為S100A12,其次有CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下調基因有TNFAIP3、CD44、DKK1等。qRT-PCR檢測S100A12、CYP1B1在耐藥細胞中高表達,TNFAIP3、CD44在耐藥細胞中低表達,與基因芯片結果一致。結論采用基因芯片技術篩選出的人子宮內膜癌獲得性TAX耐藥相關基因的上調基因有S100A12、CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下調基因有TNFAIP3、CD44、DKK1。
[Abstract]:Objective to screen acquired paclitaxel (TAX) resistance related genes in human endometrial cancer cell lines by gene chip technique. Methods Human endometrial carcinoma Ishikawa cell line was induced by high dose intermittent induction and repeated shock of TAX. Ishikawa/TAX resistant strain was established. Ishikawa/TAX and Ishikawa cell lines were detected by Affymetrix Human Genome U133 Plus2.0 expression microarray. The differentially expressed genes were classified by Gene ontology cluster analysis. Some differentially expressed genes were verified by qRT-PCR. Results the expression of 110 genes in Ishikawa / tat cells was significantly different from that in Ishikawa cells, including 87 up-regulated genes and 23 down-regulated genes involved in cell signal transduction and regulation, cell adhesion molecules, cell metabolism and transcriptional regulation. The most obvious up-regulated gene was S100A12, followed by CYP1B1FUBP1CEACAM6, and down-regulated gene was TNFAIP3pCD4DKK1. QRT-PCR was used to detect the high expression of S100A12CYP1B1 in resistant cells, which was consistent with the results of gene chip. Conclusion the up-regulated genes associated with acquired TAX resistance in human endometrial carcinoma screened by gene chip technique are S100A12CYP CYP1B1 FUBP1 CEACAM6, and down-regulated genes are TNFAIP3CD4DK1.
【作者單位】: 首都醫(yī)科大學附屬北京世紀壇醫(yī)院;
【分類號】:R737.33
【共引文獻】
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,本文編號:1951748
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