本文選題：宮頸腫瘤 + 缺氧�。� 參考：《中華疾病控制雜志》2017年05期

【摘要】：目的在GEO(gene expression omnibus)和TCGA(the cancer genome atlas)數(shù)據(jù)庫中挖掘宮頸癌缺氧標志物并對其預后進行生存分析。方法利用GEO數(shù)據(jù)庫中宮頸癌表達譜(GSE75034)缺氧組織和非缺氧組織中的數(shù)據(jù)進行差異性分析,再運用基因功能分析(gene ontology,GO)與通路富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)篩選出相關的通路和相關功能的基因,結合TCGA數(shù)據(jù)庫中宮頸癌的數(shù)據(jù)對其預后運用KaplanMeier與Log-rank檢驗方法進行生存分析。結果顯示有337個基因表達存在差異,缺氧組織中上調的基因有184個,下調的有153個。GO分析顯示這些基因與免疫反應、炎癥反應、細胞增殖、血管形成等有關;KEGG分析顯示主要富集在TNF信號通路、PI3K-Akt信號通路、HIF-1信號通路等。生存分析顯示富集在HIF-1通路上的PAI-1、BCL-2、HK-2與宮頸癌病人預后相關,其中PAI-1、HK-2是預后的危險因素(均有P0.05),高表達組與患者生存期縮短相關,BCL-2是保護因素(X~2=6.508,P=0.011),高表達組與患者生存期延長相關。結論 PAI-1、BCL-2、HK-2可以作為宮頸癌缺氧生物標志物,與宮頸癌病人的預后相關,為后續(xù)的研究提供新思路。
[Abstract]:Objective to excavate the anoxic markers of cervical cancer in GEO (Gene Expression Omnibus) and TCGA (the Cancer Genome Atlas) database and to analyze the survival of the cervical cancer. Methods the data in the hypoxia and non anoxic tissues of the cervical cancer expression spectrum (GSE75034) in the GEO database were analyzed, and the gene functional analysis (gene) was used. Tology, GO) and pathway enrichment analysis (Kyoto Encyclopedia of genes and genomes, KEGG) screening genes related to pathways and related functions, combined with KaplanMeier and Log-rank test methods for survival analysis of cervical cancer in the TCGA database. The results showed that there were 337 differences in gene expression, in hypoxia tissue. There were 184 up-regulated genes, and 153.GO analyses showed that these genes were related to immune response, inflammatory response, cell proliferation, angiogenesis and so on; KEGG analysis showed that these genes were mainly enriched in TNF signaling pathway, PI3K-Akt signaling pathway, HIF-1 signaling pathway, etc. survival analysis showed that PAI-1, BCL-2, HK-2 and cervical cancer were enriched in the HIF-1 pathway. The prognosis is related, in which PAI-1 and HK-2 are the risk factors of prognosis (P0.05), the high expression group is related to the shortening of the patient's life, BCL-2 is the protective factor (X~2=6.508, P=0.011), and the high expression group is associated with the prolongation of the patient's life. Conclusion PAI-1, BCL-2, HK-2 can be used as a biomarker for the hypoxia of cervical cancer, and is related to the prognosis of cervical cancer patients. The follow-up research provides a new way of thinking.

【作者單位】： 廣西醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院流行病學教研室;
【基金】：國家自然科學基金(81241100)
【分類號】：R737.33

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本文編號：1883031