高級別漿液性卵巢癌組微生物失衡初步研究
本文選題:微生物 + 卵巢癌; 參考:《華中科技大學(xué)》2016年博士論文
【摘要】:目的:當(dāng)前,微生物與疾病,尤其是與腫瘤的發(fā)生發(fā)展越來越受到科研工作者的重視和研究。卵巢癌的起源目前仍沒有得到一致的結(jié)論,而且卵巢癌組織中的微生物組分目前幾乎沒有研究報道。本研究擬對高級別漿液性卵巢癌組織和正常輸卵管組織中微生物群落組成和多樣性進行研究。方法:收集來自武漢同濟醫(yī)院婦產(chǎn)科2013年10月到2015年10月71例新鮮高級別漿液性卵巢癌組織和66例新鮮正常輸卵管傘端組織標(biāo)本,利用16S rRNA高通量測序的方法對其中25例卵巢癌組織和25例正常輸卵管組織進行測序。另外,利用實時熒光定量PCR方法46例新鮮卵巢癌組織和41例新鮮正常輸卵管組織的部分差異微生物進行獨立樣本的驗證以及受試者工作特征曲線分析。最后,通過人抗細菌反應(yīng)的高通量PCR芯片檢測抗細菌反應(yīng)的相關(guān)基因和信號通路的表達情況。結(jié)果:(一)對新鮮組織樣本16S rRNA高通量測序顯示了人體卵巢癌組織和輸卵管組織中微生物的組成的變化:(二)基于可操作的分類學(xué)單元(OTUs)卵巢癌組織中微生物數(shù)量相對正常輸卵管組織微生物數(shù)量減少;(三)通過LEfSe聯(lián)合統(tǒng)計學(xué)分析,采用實時熒光定量PCR證實部分顯著差異微生物的豐富度和16S高通量測序結(jié)果相吻合。在門的水平上,變形菌門Proteobacteria的豐度在卵巢癌組織中相對正常輸卵管組織增加,而厚壁菌門Firmicutes的豐度在卵巢癌組織中相對正常輸卵管組織中下降,具有統(tǒng)計學(xué)意義,且與16S測序數(shù)據(jù)一致;在屬的水平上,不動桿菌屬Acinetobacter的豐度在卵巢癌組織中較高,具有統(tǒng)計學(xué)意義,乳球菌屬Lactococcus的豐度在卵巢癌組織中減少,與16S測序結(jié)果相符合;在種的水平上,魯菲不動桿菌種A cinetobacter_lwoffii的豐度在卵巢癌組織中增加,具有統(tǒng)計學(xué)意義且與16S測序結(jié)果一致,而Lactococcus_psicium在卵巢癌組織中明顯下降,具有明顯的統(tǒng)計學(xué)意義,與16S測序結(jié)果吻合;(四)基于人抗細菌反應(yīng)的PCR芯片顯示,相對于正常輸卵管組織中的微生物的基因表達,卵巢癌組織中人抗細菌反應(yīng)的基因表達大部分下調(diào)。結(jié)論:首次證實卵巢癌組織相對正常輸卵管組織中微生物數(shù)量降低,呈現(xiàn)失衡狀態(tài),我們假設(shè)微生物失衡可能影響卵巢癌的發(fā)生和發(fā)展,其可能的機制是造成局部炎癥反應(yīng),進而影響腫瘤局部免疫微環(huán)境。我們的研究提供了部分卵巢癌和正常輸卵管組織中微生物的一個數(shù)據(jù)集,為卵巢癌的發(fā)生,進展,早期診斷和治療提供了潛在的價值。
[Abstract]:Objective: at present, microorganism and disease, especially the occurrence and development of tumor, are paid more and more attention by researchers. The origin of ovarian cancer has not been unanimous, and the microbial components in ovarian cancer tissues have not been reported. This study was designed to study the composition and diversity of microbial communities in high grade serous ovarian cancer tissues and normal oviduct tissues. Methods: from October 2013 to October 2015, 71 samples of fresh high-grade serous ovarian cancer and 66 cases of fresh normal fallopian tubes were collected from gynecology and obstetrics department of Tongji Hospital, Wuhan. High throughput 16s rRNA sequencing was performed in 25 ovarian cancer tissues and 25 normal fallopian tube tissues. In addition, 46 fresh ovarian cancer tissues and 41 fresh normal fallopian tube tissues were tested by real-time fluorescence quantitative PCR method for the verification of partial differential microbes and the analysis of the operating characteristic curves. Finally, high throughput PCR microarray was used to detect the expression of genes and signaling pathways related to antimicrobial reactions. Results: (1) High throughput sequencing of 16s rRNA from fresh tissue samples showed changes in the composition of microbes in human ovarian cancer tissues and oviduct tissues. (2) the number of microbes in ovarian cancer tissues was based on an operable taxonomic unit. The amount of microorganism in the normal oviduct tissue is reduced (3) through LEfSe combined with statistical analysis, The results of 16s high throughput sequencing showed that the abundance of some significantly different microbes was consistent with the results of 16s high throughput sequencing by real-time fluorescence quantitative PCR. At the gate level, the abundance of Proteobacteria in ovarian cancer was higher than that in normal fallopian tube, while the abundance of Firmicutes was decreased in ovarian cancer, which was statistically significant. In accordance with 16s sequencing data, the abundance of Acinetobacter was higher in ovarian cancer tissues, and the abundance of Lactococcus Lactococcus decreased in ovarian cancer tissues, which was consistent with the results of 16s sequencing. At the seed level, the abundance of A cinetobacter_lwoffii of Acinetobacter rufii increased in ovarian cancer tissues, which was statistically significant and consistent with 16s sequencing results, while Lactococcus_psicium decreased significantly in ovarian cancer tissues. In accordance with 16s sequencing results (4) PCR microarray based on human anti-bacterial reaction showed that the gene expression of human anti-bacterial reaction was mostly down-regulated in ovarian cancer compared with that of microorganism in normal oviduct tissue. Conclusion: it is the first time to confirm that the number of microbes in ovarian cancer tissue is lower than that in normal oviduct tissue. We hypothesized that the microbial imbalance may affect the occurrence and development of ovarian cancer, and the possible mechanism is to cause local inflammatory reaction. And then affect the tumor local immune microenvironment. Our study provides a data set of microorganisms in some ovarian cancer and normal fallopian tube tissues, providing potential value for the occurrence, progression, early diagnosis and treatment of ovarian cancer.
【學(xué)位授予單位】:華中科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R737.31
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,本文編號:1854671
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