本文選題：HPV型 + E蛋白�。� 參考：《中國病原生物學(xué)雜志》2015年03期

【摘要】：目的對(duì)高危型人乳頭瘤病毒(Human papillomavirus)16型E6蛋白的B細(xì)胞線性表位進(jìn)行預(yù)測。方法以HPV16型E6蛋白(P03126)的全長氨基酸序列為基礎(chǔ),采用EXPASY網(wǎng)站上的生物信息學(xué)軟件和DNAstar軟件包中的Protean軟件分析E6蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),跨膜趨勢(shì)及其親水性,表面可及性,抗原性,極性和柔韌性等特性。綜合以上參數(shù)預(yù)測HPV16型E6蛋白的B細(xì)胞線性表位,并進(jìn)一步進(jìn)行同源性匹配分析。結(jié)果綜合多個(gè)參數(shù)分析顯示B細(xì)胞線性表位可能位于E6蛋白N端2-7、9-19、30-36、45-49、105-109、119-125和148-158區(qū)段及其附近,進(jìn)一步同源性匹配分析支持其中區(qū)段2-7、9-19、119-125及148-158為可能的B細(xì)胞線性表位,其中區(qū)段148-158(RSSRTRRETQL)為HPV16型E6蛋白所特有的序列,而區(qū)段2-7(HQKRTA)、9-19(FQDPQERPRKL)與HPV9型E6蛋白具有同源性,區(qū)段119-125(PEEKQRH)與HPV31型E6蛋白具有同源性。結(jié)論綜合分析預(yù)測HPV16型E6蛋白的B細(xì)胞線性表位可能位于E6蛋白N端2-7、9-19、119-125及148-158區(qū)段,為HPV16型E6蛋白的進(jìn)一步研究奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to predict B cell linear epitopes of high risk human papillomavirus human papillomavirus)16 E6 protein.Methods based on the full-length amino acid sequence of HPV16 E6 protein P03126, the secondary structure, transmembrane trend, hydrophilicity, surface accessibility and antigenicity of E6 protein were analyzed by using bioinformatics software on EXPASY website and Protean software in DNAstar software package.Polarity and flexibility.The B cell linear epitopes of HPV16 type E6 protein were predicted by the above parameters, and the homology matching analysis was carried out.Results multiple parameter analysis showed that the B cell linear epitopes might be located at and around the N-terminal of E6 protein, and further homology matching analysis suggested that the B cell linear epitopes of regions 2-7n9-19119-125 and 148-158 might be located in and around the N-terminal of E6 protein, and that the B cell linear epitopes might be located in the N-terminal of E6 protein, and further homology matching analysis showed that the B cell linear epitopes were located in regions 2-79-19119-125 and 148-158, respectively.Sequence 148-158RSSRTRRETQL) is a unique sequence of HPV16 type E6 protein, while region 2-7 HQKRTAKL (9-19 FQDQERPRKL) is homologous to HPV9 type E6 protein, and region 119-125 (PEEKQRH) is homologous to HPV31 type E6 protein.Conclusion the B cell linear epitopes of HPV16 type E6 protein may be located at the N-terminal of E6 protein 2-79-19119-125 and 148-158, which lays a foundation for the further study of HPV16 type E6 protein.
【作者單位】： 溫州醫(yī)科大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院;溫州醫(yī)科大學(xué)分子病毒與免疫研究所微生物學(xué)與免疫學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81172463)
【分類號(hào)】：R737.33

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1736147