本文選題：卵巢癌　切入點：多藥耐藥　出處：《中國腫瘤生物治療雜志》2015年02期

【摘要】：目的:基于microRNA(miRNA)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)預(yù)測卵巢癌多藥耐藥相關(guān)基因。方法:綜合運(yùn)用文本挖掘、網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和預(yù)測等生物信息學(xué)分析方法,挖掘卵巢癌化療耐藥相關(guān)miRNA和miRNA-靶基因數(shù)據(jù),并構(gòu)建miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),利用已知miRNA對卵巢癌多藥耐藥相關(guān)基因進(jìn)行預(yù)測。結(jié)果:文本挖掘出11個與卵巢癌化療耐藥相關(guān)的miRNA,包括miR-130a、miR-214、let-7i、miR-125b、miR-376c、miR-199a、miR-93、miR-141、miR-130b、miR-193b*和miR-200c。在miRNA靶基因預(yù)測數(shù)據(jù)軟件Target Scan中挖掘出47 077個miRNA-靶基因數(shù)據(jù),而Pic Tar挖掘出1 675個miRNA-靶基因數(shù)據(jù)。在miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中,神經(jīng)素1基因(neuropilins,NRP1)是最重要的Hub-基因。結(jié)論:利用已知miRNA構(gòu)建miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)而預(yù)測卵巢癌多藥耐藥相關(guān)基因是一種行之有效的方法。NRP1極有可能在卵巢癌化療耐藥形成中扮演著重要的角色,是卵巢癌潛在的藥物治療靶點。
[Abstract]:Objective: to predict multidrug resistance related genes in ovarian cancer based on microRNA-miRNA-based regulatory network.Methods: the bioinformatics analysis methods, such as text mining, network construction and prediction, were used to mine the miRNA and miRNA-target gene data related to chemoresistance of ovarian cancer, and to construct the miRNA regulatory network.Using known miRNA to predict multidrug resistance related genes in ovarian cancer.47 077 miRNA-target gene data were mined from miRNA target gene prediction software Target Scan, while 1,675 miRNA-target gene data were mined from Pic Tar.In the miRNA regulatory network, neurokinin-1 gene neuropilins1 (NRP1) is the most important Hub-gene.Conclusion: it is an effective method to construct miRNA regulatory network by using known miRNA to predict multidrug resistance-associated genes in ovarian cancer. NRP1 may play an important role in the formation of chemoresistance in ovarian cancer.It is a potential drug therapy target for ovarian cancer.
【作者單位】： 廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院婦瘤科;廣西醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)科學(xué)實驗中心生物信息學(xué)教研室;
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)資助項目(No.2012AA02A507) 廣西自然科學(xué)基金資助項目(桂財教2014-118號) 廣西科學(xué)研究與技術(shù)開發(fā)計劃課題資助項目(桂科攻14124004-1-24)~~
【分類號】：R737.31

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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8 楊q，

本文編號：1726186