本文選題：盆腔器官脫垂(POP)　切入點：microRNA(miRNA)　出處：《福建醫(yī)科大學(xué)》2014年博士論文

【摘要】：目的擬通過病例-對照研究,探討位于microRNA(miRNA)編碼區(qū)和miRNA作用靶點的單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)與盆腔器官脫垂(Pelvic Organ Prolapse,POP)遺傳易感性的關(guān)系;根據(jù)POP遺傳易感性的分析結(jié)果,檢測陽性關(guān)聯(lián)位點不同基因型樣本陰道壁組織中信使RNA(Messenger Ribonucleic Acid,mRNA)和目的蛋白的表達,從轉(zhuǎn)錄水平及翻譯水平闡述陽性關(guān)聯(lián)位點與POP發(fā)生的關(guān)系及其生物學(xué)意義;并綜合分析遺傳因素與環(huán)境因素的交互作用對POP發(fā)病風(fēng)險的影響;旨在為POP的預(yù)防、診斷和治療提供理論依據(jù)。方法1、收集2012年3月至2013年3月就診于南京軍區(qū)福州總醫(yī)院婦產(chǎn)科的291例盆腔器官脫垂病例,并以年齡、居住地為匹配因素,納入同期300例健康對照者。采集每一研究對象的外周血2ml,對于POP行手術(shù)的病例同時采集其陰道壁組織。2、通過查閱文獻和生物信息學(xué)軟件分析篩選了位于mi R-146a(rs2910164)、miR-196a-2(rs11614913)、miR-149(rs2292832)、mi R-499(rs3746444)編碼區(qū)和位于COL1A1(rs1061947)、COL1A1(rs1061237)、MMP1(rs2071230)、MMP1(rs470215)、MMP1(rs5854)、MMP2(rs7201)、MMP9(rs9509)、MMP9(rs1056628)、LOXL1(rs3522)3’端非翻譯區(qū)(3’Untranslated Region,3’UTR)的miRNA結(jié)合靶點的基因多態(tài)性位點,采用MassARRAY時間飛行質(zhì)譜等技術(shù)檢測各個SNP位點的基因型。統(tǒng)計分析均使用SPSS17.0軟件,采用χ2檢驗分析各位點基因型是否符合Hardy-Weinberg平衡,及兩組的基因型分布頻率;采用logistic回歸分析評價pop遺傳易感性與各個多態(tài)性位點的關(guān)系;采用分層分析的方法分析體重指數(shù)、絕經(jīng)情況及陰道分娩情況與各個snps位點之間的交互作用對pop發(fā)病風(fēng)險的影響。3、采用realtime-pcr和westernblotting方法檢測col1a1及mmp1基因在不同基因型樣本的陰道壁組織中mrna和蛋白的表達。結(jié)果1.mirna編碼區(qū)的snps與盆腔器官脫垂發(fā)病風(fēng)險的分析結(jié)果:位于mir-196a-2的基因多態(tài)性位點(ccvstt)與pop的發(fā)病風(fēng)險增加顯著相關(guān)(or=2.00,95%ci:1.19-3.36,p=0.009);分層分析表明,該位點與絕經(jīng)者(ccvstt,or=2.13,95%ci:1.11-4.08,p=0.024和cc/ctvstt,or=1.60,95%ci:1.01-2.55,p=0.047)、有陰道分娩史者(ccvstt,or=2.26,95%ci:1.10-4.63,p=0.026)、體重指數(shù)(bodymassindex,bmi)≥23.5的人群中(ccvstt,or=2.48,95%ci:1.16-5.32,p=0.019和cc/ctvstt,or=2.00,95%ci:1.14-3.51,p=0.016)的pop發(fā)病風(fēng)險顯著增加。位于mir-146a多態(tài)性位點的(ccvstt)在未絕經(jīng)人群中pop發(fā)病風(fēng)險顯著降低(or=0.09,95%ci:0.01-0.81,p=0.031)。位于mir-499多態(tài)性位點的(cc/ctvstt)在bmi≥23.5人群中與pop發(fā)病風(fēng)險顯著相關(guān)(or=1.77,95%ci:1.03-3.04,p=0.038)。2.mirna作用靶點的snps與盆腔器官脫垂發(fā)病風(fēng)險的分析結(jié)果:位于col1a1基因的3’端非翻譯區(qū)的多態(tài)性位點rs1061237(ttvscc)的pop的發(fā)病易感性顯著降低(or=0.59,95%ci:0.37-0.95,p=0.031);分層分析發(fā)現(xiàn),該位點在無陰道分娩史人群與pop發(fā)病風(fēng)險降低顯著相關(guān)(ttvscc,or=0.38,95%ci:0.18-0.79,p=0.009和ct/ttvscc,or=0.48,95%ci:0.27-0.87,p=0.016)。位于mmp-1基因的3’utr區(qū)多態(tài)性位點rs470215(ag/ggvsaa)與pop發(fā)病風(fēng)險顯著增加相關(guān)(or=2.01,95%ci:1.16-3.51,p=0.013),但由于該位點在本研究中所測得的最小等位基因頻率(minimumallelefrequency,maf)0.05,為了提高統(tǒng)計效率,該位點未進行分層分析。位于mmp-1基因的3’utr區(qū)的多態(tài)性位點rs5854與pop的發(fā)病風(fēng)險增加顯著相關(guān)(ttvscc,or=2.76,95%ci:1.20-6.38,p=0.017和ct/ttvscc,or=1.87,95%ci:1.08-3.24,p=0.025);分層分析發(fā)現(xiàn),該位點在絕經(jīng)人群(ct/ttvscc,or=2.05,95%ci:1.08-3.87,p=0.028和ttvscc,or=3.37,95%ci:1.27-8.94,p=0.015)、有陰道分娩史人群(ct/ttvscc,or=2.21,95%ci:1.12-4.36,p=0.022和ttvscc,or=3.95,95%ci:1.43-10.79,p=0.007)、bmi≥23.5人群中(ct/ttvscc,or=2.44,95%ci:1.06-5.61,p=0.036和ttvscc,or=4.43,95%ci:1.21-16.18,p=0.024)的pop易感性顯著增加。位于mmp-1基因3’utr的多態(tài)性位點rs2071230(ga/ggvsaa)在未絕經(jīng)人群中的pop的易感性顯著降低(or=0.37,95%ci:0.19-0.72,p=0.003)。對位于同一染色體上的位點進行連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn),這些位點之間均不存在連鎖不平衡關(guān)系。3.rs1061237位點三種基因型的pop患者陰道壁組織中col1a1基因mrna表達水平三組差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(p0.05);而在蛋白表達水平,tt基因型的樣本中col1a1蛋白表達明顯高于ct基因型和cc基因型組。提示位點rs1061237可能是在轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮作用。4.rs5854位點三種基因型的pop患者陰道壁組織中mmp1基因的mrna表達水平三組差異無統(tǒng)計學(xué)意義(p0.05);而蛋白表達水平,tt基因型的樣本中mmp1蛋白表達最高,ct基因型次之,cc基因型樣本的表達量最低,差異有統(tǒng)計學(xué)意義。提示位點rs5854可能是在轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮作用。結(jié)論1.位于mir-196a-2編碼區(qū)的基因多態(tài)性位點與pop的遺傳易感性增加有關(guān);該位點與bmi、陰道分娩史、絕經(jīng)情況存在交互作用;位于mir-146a編碼區(qū)的多態(tài)性位點與絕經(jīng)情況存在交互作用;位于mir-499編碼區(qū)的多態(tài)性位點可以通過與bmi發(fā)生交互作用,影響pop發(fā)病風(fēng)險。2.位于col1a1基因的3’utr區(qū)多態(tài)性位點rs1061237與pop的發(fā)病易感性降低有關(guān),該位點與陰道分娩情況之間存在交互作用;位于mmp-1基因的3’utr區(qū)多態(tài)性位點rs470215與pop的發(fā)病易感性增加有關(guān);位于mmp-1基因的3’utr區(qū)的多態(tài)性位點rs5854與pop的發(fā)病風(fēng)險增加相關(guān),該位點與bmi、陰道分娩史、絕經(jīng)情況存在交互作用;位于mmp-1基因3’utr的多態(tài)性位點rs2071230可以通過與絕經(jīng)情況發(fā)生交互作用,影響pop的發(fā)病風(fēng)險。因此,rs1061237的TT基因型和rs5854的TT基因型有望成為預(yù)測POP遺傳易感性的重要指標(biāo)。3.COL1A1(rs1061237)多態(tài)性位點可能通過影響miR-3119與COL1A1基因3’UTR靶位點的結(jié)合能力,影響miR-3119對COL1A1的調(diào)控,導(dǎo)致COL1A1蛋白表達的增加,從而降低了POP的發(fā)病風(fēng)險。4.MMP1(rs5854)多態(tài)性位點可能通過影響該區(qū)域內(nèi)的miRNA與MMP1基因3’UTR靶位點的結(jié)合能力,影響miRNA對MMP1的調(diào)控,導(dǎo)致MMP1蛋白的表達增加,而參與POP的發(fā)病。
[Abstract]:Objective To study the relationship between single nucleotide polymorphism ( SNP ) and genetic susceptibility of pelvic organ prolapse ( POP ) , which was located in the non - translational region ( rs2910164 ) , MMP1 ( rs11614913 ) , MMP1 ( rs9509 ) , MMP1 ( rs5854 ) , MMP2 ( rs7201 ) , MMP1 ( rs9509 ) , MMP1 ( rs1056628 ) , MMP2 ( rs3522 ) 3 ' terminal untranslated region ( rs2292832 ) , MMP1 ( rs3746444 ) . The risk of pop was significantly associated with pop ( or = 2.00 , 95 % ci : 1.03 - 3.04 , p = 0.031 ) at the 3 ' - untranslated region of the col1a1 gene ( or = 2.48 , 95 % ci : 1.16 - 5.32 , p = 0.026 , 95 % ci : 1.18 - 0.79 , p = 0 . 009 and ct / ttvscc , or = 0.48 , 95 % ci : 0.27 - 0.87 , p = 0.031 ) .

【學(xué)位授予單位】：福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：R711.2

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 ;SHEsis,a powerful software platform for analyses of linkage disequilibrium,haplotype construction,and genetic association at polymorphism loci[J];Cell Research;2005年02期

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本文編號：1680477