本文關(guān)鍵詞： 卵巢癌 HELQ基因 HELQ蛋白 三級結(jié)構(gòu) ATP依賴性解旋酶　出處：《山東醫(yī)藥》2017年35期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的預測卵巢癌抑癌基因HELQ編碼蛋白(HELQ蛋白)的結(jié)構(gòu)和功能。方法采用Ex PASy服務器中的工具分析HELQ蛋白的理化特征。分別采用PSORTⅡ和TMHMM預測HELQ蛋白的亞細胞定位和跨膜拓撲結(jié)構(gòu)。采用Signal P 4.0預測HELQ蛋白的信號肽。采用Scan Prosite和SMART分析HELQ蛋白的功能結(jié)構(gòu)域以及結(jié)構(gòu)域分區(qū)。采用PSIPRED和I-TASSER預測HELQ蛋白的二級和三級結(jié)構(gòu)以及配體結(jié)合位點。采用STRING10.0預測HELQ蛋白與其他蛋白的交互作用。結(jié)果 HELQ蛋白主要定位在細胞核(47.8%)和細胞質(zhì)(39.1%)中,有4個保守結(jié)構(gòu)域DEXDc、HELICc、HHH_5和PRK02362,并包含解旋酶ATP結(jié)合區(qū)和解旋酶C端結(jié)合區(qū)兩個功能結(jié)構(gòu)域;成功建立了HELQ蛋白的二級和三級結(jié)構(gòu)模型,其中二級結(jié)構(gòu)中α螺旋、無規(guī)則卷曲及折疊結(jié)構(gòu)比例分別為54%、31%和6%。三維配體結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)HELQ蛋白包含一個酶活性中心位點His341,催化Ile333、Lys335、Tyr337、Gln340、Pro360、Thr361、Ser362、Gly363、Gly364、Lys365、Thr366、Leu367、Glu464和Ala711等結(jié)合位點與配體ATP結(jié)合。交聯(lián)蛋白質(zhì)分析發(fā)現(xiàn)HELQ蛋白可能與RAD51、POLA1、PLON、FANCD2、DHX8等蛋白存在交互作用。結(jié)論 HELQ蛋白可能具有ATP依賴性解旋酶的結(jié)構(gòu)和功能,參與DNA損傷的修復過程。
[Abstract]:Objective to predict the expression of ovarian cancer suppressor gene (HELQ) encoding protein HELQ. Structure and functions of the. The tools in PASy server are used to analyze the physical and chemical characteristics of HELQ protein. PSORT 鈪，

本文編號：1492351