本文關(guān)鍵詞： 卵巢癌 HELQ基因 HELQ蛋白 三級(jí)結(jié)構(gòu) ATP依賴性解旋酶　出處：《山東醫(yī)藥》2017年35期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的預(yù)測(cè)卵巢癌抑癌基因HELQ編碼蛋白(HELQ蛋白)的結(jié)構(gòu)和功能。方法采用Ex PASy服務(wù)器中的工具分析HELQ蛋白的理化特征。分別采用PSORTⅡ和TMHMM預(yù)測(cè)HELQ蛋白的亞細(xì)胞定位和跨膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。采用Signal P 4.0預(yù)測(cè)HELQ蛋白的信號(hào)肽。采用Scan Prosite和SMART分析HELQ蛋白的功能結(jié)構(gòu)域以及結(jié)構(gòu)域分區(qū)。采用PSIPRED和I-TASSER預(yù)測(cè)HELQ蛋白的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)以及配體結(jié)合位點(diǎn)。采用STRING10.0預(yù)測(cè)HELQ蛋白與其他蛋白的交互作用。結(jié)果 HELQ蛋白主要定位在細(xì)胞核(47.8%)和細(xì)胞質(zhì)(39.1%)中,有4個(gè)保守結(jié)構(gòu)域DEXDc、HELICc、HHH_5和PRK02362,并包含解旋酶ATP結(jié)合區(qū)和解旋酶C端結(jié)合區(qū)兩個(gè)功能結(jié)構(gòu)域;成功建立了HELQ蛋白的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)模型,其中二級(jí)結(jié)構(gòu)中α螺旋、無規(guī)則卷曲及折疊結(jié)構(gòu)比例分別為54%、31%和6%。三維配體結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)HELQ蛋白包含一個(gè)酶活性中心位點(diǎn)His341,催化Ile333、Lys335、Tyr337、Gln340、Pro360、Thr361、Ser362、Gly363、Gly364、Lys365、Thr366、Leu367、Glu464和Ala711等結(jié)合位點(diǎn)與配體ATP結(jié)合。交聯(lián)蛋白質(zhì)分析發(fā)現(xiàn)HELQ蛋白可能與RAD51、POLA1、PLON、FANCD2、DHX8等蛋白存在交互作用。結(jié)論 HELQ蛋白可能具有ATP依賴性解旋酶的結(jié)構(gòu)和功能,參與DNA損傷的修復(fù)過程。
[Abstract]:Objective to predict the expression of ovarian cancer suppressor gene (HELQ) encoding protein HELQ. Structure and functions of the. The tools in PASy server are used to analyze the physical and chemical characteristics of HELQ protein. PSORT 鈪，

本文編號(hào)：1492351