新生兒輪狀病毒感染及其基因特征分析
發(fā)布時間:2017-10-04 02:09
本文關(guān)鍵詞:新生兒輪狀病毒感染及其基因特征分析
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【摘要】:目的:哨點分析2009-2010年本地新生兒輪狀病毒(RV)感染情況及流行基因特征,為分析新生兒RV流行與進化,有效防治新生兒RV感染提供參考依據(jù)。方法:對2009年1月至2010年12月在新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院新生兒科收集的住院新生兒大便標本2026份,用酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)法檢測RV,查閱病歷收集其一般情況和臨床資料,應(yīng)用SPSS17.0進行臨床相關(guān)分析。提取陽性樣本RV核酸,用半巢式多重RT-PCR方法進行G型(VP7)和P型(VP4)基因分型,對主要流行基因型進行基因測序。將測序結(jié)果與GenBank中所公布的核苷酸序列進行比對,分析新生兒RV流行基因型變化及基因序列變異情況,分析其演化趨勢。結(jié)果:監(jiān)測期間新生兒輪狀病毒的總檢出率為14.22%,其中2009年為17.78%(176/990),2010年為10.81%(112/1036);院內(nèi)感染占60.07%(173/288)。腹瀉新生兒的RV檢出率為48.68%(74/152),顯著高于非腹瀉新生兒(11.42%,214/1874)(χ2=160.106,P0.001)。對2009年103份(36份腹瀉、67份非腹瀉)陽性樣本及2010年81份(35份腹瀉、46份非腹瀉)陽性樣本進行G/P基因型分型,結(jié)果顯示:2009年:腹瀉新生兒G型以G9為主要流行株,占61.11%(22/36),其次為G3型(19.45%,7/36)和G1型(2.78%,1/36),G混合型感染占8.33%(3/36),G未能分型占8.33%(3/36);P型以P[6]為主要流行株,占83.33%(30/36),其次為P[8](2.78%,1/36),P混合型感染占5.56%(2/36),P未能分型占8.33%(3/36);非腹瀉新生兒,G9同樣為主要流行株,占76.12%(51/67),其次為G1型(7.46%,5/67)和G3型(2.99%,2/67),G混合型感染占7.46%(5/67),G未能分型占5.97%(4/67);P型中P[6]占主導(dǎo),達85.07%(57/67),另檢出2例P[8]型(2.99%),5例混合感染(7.46%)未能分型3例(4.48%)。2010年:腹瀉新生兒仍以G9型為主要流行株,占74.28%(26/35),以下依次為G3型(11.43%,4/35)和G1型(2.86%,1/35),G混合型占11.43%(4/35);P型仍以P[6]為主要流行株,占80%(28/35),其次為P[8](5.71%,2/35),P混合型感染占14.29%(5/35);非腹瀉新生兒,G9型也是主要流行株,占82.61%(38/46),其次為G1型(4.35%,2/46)和G3型(2.17%,1/46),G混合型占8.7%(4/46)、G未分型1例(2.17%);P型也以P[6]為主導(dǎo),達80.44%(37/46),另檢出3例P[8](6.52%),P混合型感染6例(13.04%)。2009-2010年,無論腹瀉還是非腹瀉新生兒感染的最主要G/P組合型均為G9P[6]型。序列分析表明2009年與2010年流行的G9和P[6]株基因序列均分列2個進化簇,存在差異;多種G9P[6]株同時存在于每年的腹瀉和非腹瀉新生兒中;2010年流行株可能由2009年流行株通過突變重配進化而來。結(jié)論:RV是新生兒腹瀉及院內(nèi)胃腸道感染的主要病毒病原。2009年至2010年新生兒RV主要流行基因型為G9P[6]型。不同株G9P[6]同時流行于新生兒且在不斷變異進化。加強監(jiān)測,制定合理的防控策略,有效預(yù)防新生兒RV感染意義重大。
【關(guān)鍵詞】:輪狀病毒 新生兒 感染 基因型 序列
【學位授予單位】:新疆醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R722.13
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本文編號:968002
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