本文關鍵詞：輕癥或重癥手足口病患兒HEV71分離鑒定及其VP1基因型分析

  更多相關文章： 手足口病 人腸道病毒71型 VP1基因 基因分型 微小RNA病毒衣殼蛋白樣功能結(jié)構域 藥物結(jié)合位點 突變

【摘要】：背景：人腸道病毒71型(human enterovirus 71,HEV71)為腸道病毒A組單股正鏈RNA病毒,是手足口病(hand-foot-and-mouth disease, HFMD)主要病原體。HEV71殼粒由VP1-VP4四種病毒蛋白組成,其中VP1具有細胞受體結(jié)合位點、中和抗體表位及抗病毒藥物結(jié)合位點,故VP1在病毒感染、抗病毒免疫應答及藥物治療效果等方面有重要作用。若VP1功能相關重要位點發(fā)生突變,可使HEV71毒力和耐藥性發(fā)生改變,從而對HFMD患者病情嚴重程度產(chǎn)生較大影響。HEV71的VP1序列中有一個微小RNA病毒衣殼蛋白樣(picornavirus capsid protein domain-like, rhv_like)功能結(jié)構域(domain),該結(jié)構域含有9個藥物結(jié)合位點。根據(jù)VP1序列差異,HEV71可分為A、B0～5和C1～5基因型,不同地區(qū)流行的主要HEV71-VP1基因型可有差異。因此,了解不同地區(qū)優(yōu)勢流行的HEV71 VP1基因型及其rhv_like結(jié)構域中藥物結(jié)合位點突變對于HFMD防控及治療均有較大意義。目的：從不同病情HFMD患兒中分離鑒定HEV71并分析其VP1基因型及rhv_like結(jié)構域中藥物結(jié)合位點突變情況。方法：從2014年浙江省紹興地區(qū)4例輕癥和4例重癥HFMD患兒標本中分離HEV71并用RT-PCR進行鑒定。采用RT-PCR擴增病毒分離株全長VPl基因并測序。采用專業(yè)生物信息學軟件,對HEV71分離株進行VP1基因分型、確定VP1基因rhv like結(jié)構域中藥物結(jié)合位點突變情況并構建HEV71分離株系統(tǒng)進化樹。結(jié)果：HEV和HEV71 RT-PCR檢測結(jié)果顯示,8例HFMD患兒標本中分離的病毒均為HEV71。與GenBank中HEV71參考標準株VP1基因各基因型序列比較,8例HFMD患兒標本中分離的HEV71株VP1基因核苷酸及氨基酸序列均與C4a基因型相似性最高,分別為97.2%～98.8%和99.3%～99.7%。2株分離自2例重癥HFMD患兒HEV71株VP1基因hv_like結(jié)構域中第179位藥物結(jié)合位點出現(xiàn)V179L突變。與國內(nèi)外不同地區(qū)HEV71分離株VP1基因比較,5株HEV71分離株與安徽和湖南分離株親緣關系較近,3株HEV71分離株與上海和山東分離株親緣關系較近。結(jié)論：本地區(qū)不同病情HFMD患兒分離的HEV71均為VP1-C4a基因型,重癥患兒HEV71分離株VP1基因rhv_like結(jié)構域中第179位藥物結(jié)合位點突變可能與病情嚴重程度有關。
【關鍵詞】：手足口病 人腸道病毒71型 VP1基因 基因分型 微小RNA病毒衣殼蛋白樣功能結(jié)構域 藥物結(jié)合位點 突變
【學位授予單位】：浙江大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R725.1
【目錄】：

• 致謝4-5
• 中文摘要5-7
• Abstract7-12
• 1 引言12-15
• 1.1 背景12-13
• 1.2 研究目的與意義13-15
• 2 HEV和HEV71的RT-PCR檢測15-19
• 2.1 材料15-16
• 2.2 方法16-17
• 2.3 結(jié)果17-19
• 3 HEV71的分離與鑒定19-23
• 3.1 材料19-20
• 3.2 方法20-21
• 3.3 結(jié)果21-23
• 4 HEV71-VP1基因的擴增及序列測定23-30
• 4.1 材料23
• 4.2 方法23-24
• 4.3 結(jié)果24-30
• 5 HEV71-VP1基因型分析和突變分析30-37
• 5.1 材料30
• 5.2 方法30
• 5.3 結(jié)果30-37
• 6 討論37-39
• 參考文獻39-43
• 綜述43-64
• 參考文獻55-64
• 作者簡歷及在學期間所取得的科研成果64

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 翁育偉;嚴延生;;腸道病毒71型研究進展[J];中國人獸共患病學報;2014年01期

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本文編號：847436