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高通量測(cè)序分析新生兒感染早產(chǎn)兒腸道菌群特點(diǎn)

發(fā)布時(shí)間:2022-07-09 16:30
  目的通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)分析新生兒感染早產(chǎn)兒的腸道菌群特點(diǎn)。方法選取2017年8月至2018年12月在哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院出生且符合入選標(biāo)準(zhǔn)的26例新生兒,按照是否感染分為新生兒感染組(12例)和未感染組(14例)。采集新生兒出生后24 h內(nèi)及第7天的糞便標(biāo)本共52份,進(jìn)行糞便菌群的16S核糖體DNA區(qū)域測(cè)序分析,記錄測(cè)序結(jié)果(有效序列總數(shù)、總堿基數(shù)、平均長(zhǎng)度)和單個(gè)樣品的菌群分類及相對(duì)豐度,并分析兩組早產(chǎn)兒腸道菌群特點(diǎn)。結(jié)果對(duì)成功提取DNA的25份樣本完成測(cè)序,進(jìn)入生物信息分析程序,共測(cè)得門水平6個(gè)、綱水平12個(gè)、目水平17個(gè)、科水平29個(gè)、屬水平40個(gè),其中新生兒感染組菌群分布范圍較小、變形桿菌豐度較高,而非感染組的菌群分布較為廣泛、多樣性和均一性較高。兩組早產(chǎn)兒出生后第7天的腸道微生物群落結(jié)構(gòu)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P <0. 05)。結(jié)論當(dāng)新生兒腸道內(nèi)定植大量變形桿菌時(shí)可增加條件致病菌群的相對(duì)豐度,降低有益菌群的相對(duì)豐度,造成腸道生理穩(wěn)態(tài)失調(diào),極易誘發(fā)新生兒感染。同時(shí),腸道內(nèi)定植菌群的多樣性增加,可以維持腸道菌群的動(dòng)態(tài)平衡,減少新生兒尤其是早產(chǎn)兒感染性疾病的發(fā)生。 

【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)

【文章目錄】:
1 資料與方法
    1.1 一般資料
    1.2納入與排除標(biāo)準(zhǔn)
    1.3 試驗(yàn)方法
    1.4 生物信息學(xué)分析
        1.4.1 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
        1.4.2 物種分類和豐度分析
        1.4.3 物種多樣性分析
    1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 一般情況
    2.2 測(cè)序數(shù)據(jù)結(jié)果和OUT統(tǒng)計(jì)
    2.3 物種多樣性的分析
        2.3.1 單個(gè)樣品的菌群分類及相對(duì)豐度
        2.3.2 早產(chǎn)兒生后第7天腸道菌群對(duì)新生兒感染情況的影響
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腸桿菌科細(xì)菌的Rcs信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)——毒力、應(yīng)激[J]. 葉立娜,瞿滌.  微生物與感染. 2018(02)
[2]基于ITS2高通量測(cè)序研究強(qiáng)直性脊柱炎患者腸道真菌特征[J]. 張利龍,許堯,胡雨奇,金祺,馬紅,李霞,葛藤,袁杰力,李明.  中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志. 2018(02)
[3]運(yùn)用實(shí)時(shí)定量PCR和16SrDNA測(cè)序法分析女性陰道菌群的結(jié)果比較[J]. 張寧,韓陽(yáng),駱?lè)?朱麗紅,秦金紅,江滟.  上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(01)
[4]影響新生兒腸道細(xì)菌定植相關(guān)因素的研究進(jìn)展[J]. 鄭凱,吳軍華,邱海燕.  中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志. 2017(11)
[5]不同喂養(yǎng)方式對(duì)新生兒腸道菌群定植的影響[J]. 王秋麗,呂紅艷,李佳紅.  中國(guó)婦幼保健. 2017(11)
[6]腸道菌群失調(diào)與腸外疾病[J]. 吳小平,賀杰.  醫(yī)學(xué)新知雜志. 2014 (03)
[7]腸道菌群與早產(chǎn)兒相關(guān)性疾病和營(yíng)養(yǎng)[J]. 崔玉濤.  中國(guó)新生兒科雜志. 2010(05)
[8]腸道菌群及其生物學(xué)意義[J]. 管遠(yuǎn)志.  臨床兒科雜志. 2009(11)
[9]兒童腸道微生態(tài)系統(tǒng)的特點(diǎn)與疾病[J]. 毛萌.  臨床兒科雜志. 2005(10)

博士論文
[1]16S rDNA PCR-DGGE結(jié)合測(cè)序技術(shù)在新生兒腸道微生態(tài)及敗血癥病原檢測(cè)中的應(yīng)用[D]. 劉東.重慶醫(yī)科大學(xué) 2014

碩士論文
[1]新生兒腸道菌群分布特征及其影響因素[D]. 胡潤(rùn)芳.上海交通大學(xué) 2015



本文編號(hào):3657446

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