miR-92a-2-5p/PRKCA/β-catenin在ETU誘導(dǎo)的肛門直腸畸形胎鼠中作用的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-08 17:33
目的:肛門直腸畸形(Anorectal malformations,ARMs)是小兒消化系統(tǒng)最常見的消化系統(tǒng)先天畸形之一,通常表現(xiàn)為肛門閉鎖、異位肛門、直腸尿道瘺等,疾病發(fā)生率約1/50001/1500。ARMs通常合并其他系統(tǒng)畸形,大多ARMs患者需要進(jìn)行手術(shù)治療,但是長期隨訪結(jié)果發(fā)現(xiàn),很多ARMs患者術(shù)后存在便秘、便失禁等并發(fā)癥,嚴(yán)重影響生活質(zhì)量和心理健康。所以,深入了解ARMs的發(fā)病機(jī)理并基于此提供更好的治療方法意義十分重大。在肛門直腸發(fā)育過程中,尿道直腸隔與泄殖腔膜的融合、直腸和尿道的完全分離以及直腸末端與外界貫通是肛門形成的必要條件。當(dāng)這一過程在內(nèi)外界因素下受阻時(shí),就可能出現(xiàn)發(fā)育異常而形成肛門直腸畸形。在研究ARMs時(shí),因臨床標(biāo)本難以獲取,一般采用實(shí)驗(yàn)動物模型進(jìn)行研究,其中,ETU(Ethylenethiourea,乙烯硫脲)誘導(dǎo)的肛門直腸畸形大鼠胚胎是研究ARMs最常用的動物模型。形態(tài)學(xué)研究發(fā)現(xiàn),ARMs畸形胚胎的主要表型包括:(1)尿道直腸隔和泄殖腔膜未融合;(2)尾腸退化延遲;(3)泄殖腔壁異常細(xì)胞凋亡;(4)背側(cè)泄殖腔及背側(cè)泄殖腔膜發(fā)育缺陷。而在...
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:105 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
GD14-16中正常組和ARMs胎鼠后腸組織中761個(gè)大鼠miRNA的聚類熱圖
中國醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文在圖 2A 中,我們將三個(gè)時(shí)間點(diǎn)中,正常組和 ARMs 組所有差異表達(dá)的 miRNA進(jìn)行了層次聚類和熱圖繪制,可見整體上 GD14-16 正常組的 miRNA 表達(dá)水平明顯低于 ARMs 組。為了解在不同時(shí)間點(diǎn)中均存在表達(dá)差異的 miRNA,我們進(jìn)行了GD14-16 三個(gè)時(shí)間點(diǎn)正常組和 ARMs 各自差異 miRNA 交集分析。如圖 2B 所示,分別有 34、41、30 個(gè) miRNA 僅僅在 GD14、GD15、GD16 某 個(gè)時(shí)間點(diǎn)差異表達(dá);4 個(gè) miRNA(miR-143-5p、miR-125b-2-3p、miR-92a-2-5p、miR-99a-5p)同時(shí)在 GD14和 GD16 差異表達(dá),8 個(gè) miRNA(miR-125b-5p、miR-125a-5p、miR-191a-5p、miR-129-2-3p、miR-204-3p、miR-702-5p、miR-187-5p、miR-3542)同時(shí)在 GD15和 GD16 差異表達(dá)。
圖 3. miRNA-靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖。綠色菱形代表 miRNA;紫色和藍(lán)色圓形分別代表數(shù)據(jù)庫預(yù)測的和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的靶基因�;疑€條表示 miRNA 與靶基因之間潛在的靶向調(diào)控關(guān)系。3.3 GO 和 KEGG 富集分析,以及 miRNA-靶基因-信號通路互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建預(yù)測的和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的 18 個(gè) miRNA 的靶基因被用于后續(xù)生物信息學(xué)分析。首先我們對 18 個(gè) miRNA 的靶基因進(jìn)行了 GO 功能富集分析,該分析分為生物過程(Biological process,BP)、細(xì)胞成分(Cellular component,CC)和分子功能(Molecularfunction,MF)三個(gè)方面。結(jié)果顯示:這些靶基因在 DNA 結(jié)合和基因調(diào)控、生物分子代謝和合成、神經(jīng)元分化和投射、轉(zhuǎn)錄調(diào)控等方面被顯著富集。圖 4 所示為GO 分析中 BP、CC 和 MF 中排名前 15 位的條目。
本文編號:3483927
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:105 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
GD14-16中正常組和ARMs胎鼠后腸組織中761個(gè)大鼠miRNA的聚類熱圖
中國醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文在圖 2A 中,我們將三個(gè)時(shí)間點(diǎn)中,正常組和 ARMs 組所有差異表達(dá)的 miRNA進(jìn)行了層次聚類和熱圖繪制,可見整體上 GD14-16 正常組的 miRNA 表達(dá)水平明顯低于 ARMs 組。為了解在不同時(shí)間點(diǎn)中均存在表達(dá)差異的 miRNA,我們進(jìn)行了GD14-16 三個(gè)時(shí)間點(diǎn)正常組和 ARMs 各自差異 miRNA 交集分析。如圖 2B 所示,分別有 34、41、30 個(gè) miRNA 僅僅在 GD14、GD15、GD16 某 個(gè)時(shí)間點(diǎn)差異表達(dá);4 個(gè) miRNA(miR-143-5p、miR-125b-2-3p、miR-92a-2-5p、miR-99a-5p)同時(shí)在 GD14和 GD16 差異表達(dá),8 個(gè) miRNA(miR-125b-5p、miR-125a-5p、miR-191a-5p、miR-129-2-3p、miR-204-3p、miR-702-5p、miR-187-5p、miR-3542)同時(shí)在 GD15和 GD16 差異表達(dá)。
圖 3. miRNA-靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖。綠色菱形代表 miRNA;紫色和藍(lán)色圓形分別代表數(shù)據(jù)庫預(yù)測的和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的靶基因�;疑€條表示 miRNA 與靶基因之間潛在的靶向調(diào)控關(guān)系。3.3 GO 和 KEGG 富集分析,以及 miRNA-靶基因-信號通路互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建預(yù)測的和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的 18 個(gè) miRNA 的靶基因被用于后續(xù)生物信息學(xué)分析。首先我們對 18 個(gè) miRNA 的靶基因進(jìn)行了 GO 功能富集分析,該分析分為生物過程(Biological process,BP)、細(xì)胞成分(Cellular component,CC)和分子功能(Molecularfunction,MF)三個(gè)方面。結(jié)果顯示:這些靶基因在 DNA 結(jié)合和基因調(diào)控、生物分子代謝和合成、神經(jīng)元分化和投射、轉(zhuǎn)錄調(diào)控等方面被顯著富集。圖 4 所示為GO 分析中 BP、CC 和 MF 中排名前 15 位的條目。
本文編號:3483927
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