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miR-92a-2-5p/PRKCA/β-catenin在ETU誘導的肛門直腸畸形胎鼠中作用的研究

發(fā)布時間:2021-11-08 17:33
  目的:肛門直腸畸形(Anorectal malformations,ARMs)是小兒消化系統(tǒng)最常見的消化系統(tǒng)先天畸形之一,通常表現(xiàn)為肛門閉鎖、異位肛門、直腸尿道瘺等,疾病發(fā)生率約1/50001/1500。ARMs通常合并其他系統(tǒng)畸形,大多ARMs患者需要進行手術治療,但是長期隨訪結果發(fā)現(xiàn),很多ARMs患者術后存在便秘、便失禁等并發(fā)癥,嚴重影響生活質量和心理健康。所以,深入了解ARMs的發(fā)病機理并基于此提供更好的治療方法意義十分重大。在肛門直腸發(fā)育過程中,尿道直腸隔與泄殖腔膜的融合、直腸和尿道的完全分離以及直腸末端與外界貫通是肛門形成的必要條件。當這一過程在內外界因素下受阻時,就可能出現(xiàn)發(fā)育異常而形成肛門直腸畸形。在研究ARMs時,因臨床標本難以獲取,一般采用實驗動物模型進行研究,其中,ETU(Ethylenethiourea,乙烯硫脲)誘導的肛門直腸畸形大鼠胚胎是研究ARMs最常用的動物模型。形態(tài)學研究發(fā)現(xiàn),ARMs畸形胚胎的主要表型包括:(1)尿道直腸隔和泄殖腔膜未融合;(2)尾腸退化延遲;(3)泄殖腔壁異常細胞凋亡;(4)背側泄殖腔及背側泄殖腔膜發(fā)育缺陷。而在... 

【文章來源】:中國醫(yī)科大學遼寧省

【文章頁數】:105 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

miR-92a-2-5p/PRKCA/β-catenin在ETU誘導的肛門直腸畸形胎鼠中作用的研究


GD14-16中正常組和ARMs胎鼠后腸組織中761個大鼠miRNA的聚類熱圖

差異表達,時間點,層次聚類,博士學位論文


中國醫(yī)科大學博士學位論文在圖 2A 中,我們將三個時間點中,正常組和 ARMs 組所有差異表達的 miRNA進行了層次聚類和熱圖繪制,可見整體上 GD14-16 正常組的 miRNA 表達水平明顯低于 ARMs 組。為了解在不同時間點中均存在表達差異的 miRNA,我們進行了GD14-16 三個時間點正常組和 ARMs 各自差異 miRNA 交集分析。如圖 2B 所示,分別有 34、41、30 個 miRNA 僅僅在 GD14、GD15、GD16 某 個時間點差異表達;4 個 miRNA(miR-143-5p、miR-125b-2-3p、miR-92a-2-5p、miR-99a-5p)同時在 GD14和 GD16 差異表達,8 個 miRNA(miR-125b-5p、miR-125a-5p、miR-191a-5p、miR-129-2-3p、miR-204-3p、miR-702-5p、miR-187-5p、miR-3542)同時在 GD15和 GD16 差異表達。

分析結果圖,靶基因


圖 3. miRNA-靶基因調控網絡圖。綠色菱形代表 miRNA;紫色和藍色圓形分別代表數據庫預測的和實驗驗證的靶基因;疑條表示 miRNA 與靶基因之間潛在的靶向調控關系。3.3 GO 和 KEGG 富集分析,以及 miRNA-靶基因-信號通路互作網絡的構建預測的和實驗驗證的 18 個 miRNA 的靶基因被用于后續(xù)生物信息學分析。首先我們對 18 個 miRNA 的靶基因進行了 GO 功能富集分析,該分析分為生物過程(Biological process,BP)、細胞成分(Cellular component,CC)和分子功能(Molecularfunction,MF)三個方面。結果顯示:這些靶基因在 DNA 結合和基因調控、生物分子代謝和合成、神經元分化和投射、轉錄調控等方面被顯著富集。圖 4 所示為GO 分析中 BP、CC 和 MF 中排名前 15 位的條目。


本文編號:3483927

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