兒童IgA腎病與紫癜性腎炎尿液蛋白質(zhì)的高分辨質(zhì)譜分析及臨床研究
發(fā)布時間:2021-10-16 06:18
背景和目的:原發(fā)性IgA腎。↖gA nephropathy,IgAN)是兒童最常見的腎小球疾病之一,是兒童和青少年慢性腎臟病的常見病因。其病理以IgA腎小球沉積為主要特征,IgA腎小球沉積也具有其他腎臟疾病的特征,包括過敏性紫癜性腎炎(Henoch-Schonlein purpura nephritis,HSPN)以及其他的慢性肝病引起免疫復合物性腎小球腎炎等。近年來研究認為IgAN與HSPN具有類似的發(fā)病機制,盡管預后不完全相同。腎活檢病理檢查是診斷IgAN和HSPN的金標準,但由于有創(chuàng)性和出血風險性不宜為基層臨床一線醫(yī)務人員掌握及重復操作,臨床亟需無創(chuàng)的生物標志物檢測方法。目前,尿蛋白組學已廣泛應用于腎臟疾病及生物標志物的研究。本研究首次利用非數(shù)據(jù)依賴型(data independent acquisition,DIA)高分辨液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜技術(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)探測 IgAN 和 HSPN 患兒的尿液差異表達蛋白質(zhì)組,其結(jié)果將為兩者機制、進展、預后提供重要線索,也為兩者尋找尿液生物...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學廣東省
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1本研究的設計思路圖??
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?博士學位論文???血小板激活(platelet?activation)、膽固醇代謝(cholesterol?metabolism)等通路??在兒童IgAN機制中發(fā)揮重要的生物作用。另外,如圖1-6所示,IgAN組尿液??差異表達蛋白質(zhì)的KEGG通路富集分析結(jié)果顯示,細胞粘附分子、ECM-受體相??互作用以及膽固醇代謝是發(fā)生顯著變化的重要通路(P<〇.?05),其中P值越小,??對應KEGG通路富集度的顯著性水平越高,這些通路下包含的差異表達蛋白質(zhì)??可能對疾病提供重要的線索。因此,結(jié)合這兩方面因素,聯(lián)系IgAN的病理及發(fā)??病機制,可選擇較為感興趣的富集通路以及顯著性影響這些通路的尿液差異表??達蛋白質(zhì)進行后續(xù)生物學實驗驗證或機制探討(表卜4)。??11丨1丨丨丨丨1丨丨iinihii??#?^?>?#"?#?I?/?#?I?i?^?^?I?/11?^?11??H?h?i!?!?m?f??/?;?"?/?#??/?■??KEGG?Pathways?(Top?20)??Figure?1-5?Top?20?signalling?pathways?according?to?KEGG?functional?classification?analysis?of??urine?proteins?expressed?differentially?between?IgAN?vs.?controls??圖1-5?IgAN?vs.對照組尿液差異表達蛋白質(zhì)KEGG通路注釋的前20條信號通路??注:圖中縱坐標表示每個KEGG通路中包含的差異表達蛋白質(zhì)的數(shù)量。橫飧丨?為排名前20??的KEGG信號通路。??25??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2004—2017年單中心9925例兒童腎活檢病理分析[J]. 高春林,章丹,夏正坤,樊忠民,高遠賦,張沛. 中華腎臟病雜志. 2019(03)
[2]Current application of proteomics in biomarker discovery for inflammatory bowel disease[J]. Patrick PY Chan,Valerie C Wasinger,Rupert W Leong. World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology. 2016(01)
[3]The PI3K/AKT Pathway and Renal Cell Carcinoma[J]. Huifang Guo,Peter German,Shanshan Bai,Sean Barnes,Wei Guo,Xiangjie Qi,Hongxiang Lou,Jiyong Liang,Eric Jonasch,Gordon B.Mills,Zhiyong Ding. Journal of Genetics and Genomics. 2015(07)
[4]Urinary proteomics as a novel tool for biomarker discovery in kidney diseases[J]. Jing WU1,Yi-ding CHEN2,Wei GU1 (1Department of Endocrinology and Metabolism,the Second Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310009,China) (2Department of Oncology,the Second Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310009,China). Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2010(04)
本文編號:3439316
【文章來源】:南方醫(yī)科大學廣東省
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1本研究的設計思路圖??
in/1.73m2)?39.?1?178.9?163?30.8??系膜增生?是?是是是??新月體?11.8%(2/17)?27.8%(5/18)?否?否??節(jié)段硬化?11.8%(2/17)?11.?1%(2/18)?否?否??IgA系膜沉積?是?是是是??其他免疫沉積?C3?lgG/IgM/C3?IgM/C3?IgM??腎小管間質(zhì)病變?輕度?正常?輕度?輕度??1.?1.?3雛基本流程??本研宄非數(shù)據(jù)依賴型液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜分析的基本實驗流程如圖1-1,主??要包括圖譜構(gòu)建和D[A分析兩個部分,其中包括蛋白質(zhì)提娶肽段酶解、色譜??10??
?博士學位論文???血小板激活(platelet?activation)、膽固醇代謝(cholesterol?metabolism)等通路??在兒童IgAN機制中發(fā)揮重要的生物作用。另外,如圖1-6所示,IgAN組尿液??差異表達蛋白質(zhì)的KEGG通路富集分析結(jié)果顯示,細胞粘附分子、ECM-受體相??互作用以及膽固醇代謝是發(fā)生顯著變化的重要通路(P<〇.?05),其中P值越小,??對應KEGG通路富集度的顯著性水平越高,這些通路下包含的差異表達蛋白質(zhì)??可能對疾病提供重要的線索。因此,結(jié)合這兩方面因素,聯(lián)系IgAN的病理及發(fā)??病機制,可選擇較為感興趣的富集通路以及顯著性影響這些通路的尿液差異表??達蛋白質(zhì)進行后續(xù)生物學實驗驗證或機制探討(表卜4)。??11丨1丨丨丨丨1丨丨iinihii??#?^?>?#"?#?I?/?#?I?i?^?^?I?/11?^?11??H?h?i!?!?m?f??/?;?"?/?#??/?■??KEGG?Pathways?(Top?20)??Figure?1-5?Top?20?signalling?pathways?according?to?KEGG?functional?classification?analysis?of??urine?proteins?expressed?differentially?between?IgAN?vs.?controls??圖1-5?IgAN?vs.對照組尿液差異表達蛋白質(zhì)KEGG通路注釋的前20條信號通路??注:圖中縱坐標表示每個KEGG通路中包含的差異表達蛋白質(zhì)的數(shù)量。橫飧丨?為排名前20??的KEGG信號通路。??25??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2004—2017年單中心9925例兒童腎活檢病理分析[J]. 高春林,章丹,夏正坤,樊忠民,高遠賦,張沛. 中華腎臟病雜志. 2019(03)
[2]Current application of proteomics in biomarker discovery for inflammatory bowel disease[J]. Patrick PY Chan,Valerie C Wasinger,Rupert W Leong. World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology. 2016(01)
[3]The PI3K/AKT Pathway and Renal Cell Carcinoma[J]. Huifang Guo,Peter German,Shanshan Bai,Sean Barnes,Wei Guo,Xiangjie Qi,Hongxiang Lou,Jiyong Liang,Eric Jonasch,Gordon B.Mills,Zhiyong Ding. Journal of Genetics and Genomics. 2015(07)
[4]Urinary proteomics as a novel tool for biomarker discovery in kidney diseases[J]. Jing WU1,Yi-ding CHEN2,Wei GU1 (1Department of Endocrinology and Metabolism,the Second Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310009,China) (2Department of Oncology,the Second Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310009,China). Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2010(04)
本文編號:3439316
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