目的:本研究旨在探索甘南夏河地區(qū)藏、回、漢學(xué)齡兒童腸道及口腔微生物群落結(jié)構(gòu),并比較不同民族學(xué)齡兒童腸道及口腔微生物組成及多樣性差異;在此基礎(chǔ)上分析腸道微生物菌群與口腔微生物菌群的相關(guān)性;同時(shí)分析腸道及口腔微生物與膳食攝入的關(guān)系。以期為預(yù)防治療與微生物有關(guān)的腸道及口腔疾病提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)及參考依據(jù)。方法:基于Illumina Miseq高通量測(cè)序方法,以143名藏、回、漢族學(xué)齡兒童為研究對(duì)象,收集糞便樣本（藏族44名、回族49名、漢族50名）和口腔樣本（藏族20名、回族20名、漢族20名）并提取基因組DNA,進(jìn)行高通量測(cè)序（16S rDNA測(cè)序）。利用mothur、R語言等軟件進(jìn)行微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性的差異分析。采用問卷（基本情況調(diào)查表、膳食頻率調(diào)查表、72H膳食記錄表）對(duì)研究對(duì)象進(jìn)行基本情況及膳食攝入的現(xiàn)狀調(diào)查。結(jié)果:（1）藏、回、漢族學(xué)齡兒童糞便樣本共143個(gè),共獲得9876756條平均長(zhǎng)度約為414bp的高質(zhì)量序列,平均每個(gè)樣本含69068條高質(zhì)量序列,可分類到25個(gè)門、47個(gè)綱、57個(gè)目、99個(gè)科、253個(gè)屬。（2）藏、回、漢族學(xué)齡兒童腸道微生物的優(yōu)勢(shì)菌門分別為厚壁菌門（Firmi... 

【文章來源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

腸道菌群屬水平上物種的相對(duì)豐度

蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文基于甘南夏河地區(qū)藏族、回族、漢族學(xué)齡兒童腸道及口腔微生物多樣性研究202.4.4三個(gè)民族學(xué)齡兒童腸道微生物在科和屬水平上差異性比較通過ANOVA分析，如表2-4所示兒童腸道微生物共有8個(gè)科和7個(gè)屬的平均相對(duì)豐度在三個(gè)民族間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。在科水平上，紫單胞菌科、蛭弧菌科、厭氧原體科、克里斯滕森菌科、Catabacteriaceae、消化球菌科1的平均相對(duì)豐度在藏族組高于漢族組（P<0.05），而甲烷桿菌科在漢族組高于藏族組（P<0.05）。韋榮氏菌科的平均相對(duì)豐度在藏族組高于回族組（P<0.05）。在屬水平上，丁酸單胞菌屬、顫桿菌屬、巴恩斯氏菌、Catabacter、鏈球菌屬的平均相對(duì)豐度在藏族組高于漢族組（P<0.05）。螺絲氏菌在回族組高于藏族組（P<0.05）而丁酸單胞菌屬和帕拉普雷沃菌屬在藏族組高于回族組（P<0.05）。圖2-2腸道菌群屬水平上物種的相對(duì)豐度圖2-1腸道菌群門水平上物種的相對(duì)豐度

蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文基于甘南夏河地區(qū)藏族、回族、漢族學(xué)齡兒童腸道及口腔微生物多樣性研究22童（3.11±0.55）。藏族兒童和回族兒童的Shannon指數(shù)無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（P>0.05），但均高于漢族兒童（P<0.05）（圖2-3b）。為了進(jìn)一步全面了解不同民族腸道微生物的差異性，我們對(duì)143個(gè)樣本進(jìn)行了聚類分析。基于UniFrac的加權(quán)和非加權(quán)的PCoA，其第一主成分和第二主成分的貢獻(xiàn)率分別為34.57%和18.05%，16.18%和9.26%。由圖2-4可知，三個(gè)民族學(xué)齡兒童樣品的分布是重疊的。PERMANOVA也進(jìn)一步表明三個(gè)民族學(xué)齡兒童腸道微生物分布的組間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（P>0.05）。根據(jù)LEfSe分析（圖2-5），甲烷桿菌科、甲烷桿菌目（Methanobacteriales）、甲烷桿菌綱（Methanobacteria）、韋榮氏菌科、γ-變形菌綱（Gammaproteobacteria）對(duì)漢族兒童腸道菌群結(jié)構(gòu)組成起到重要作用。未分類的擬桿菌目（Bacteroidales_incertae_sedis）對(duì)回族兒童腸道菌群結(jié)構(gòu)組成起到重要的作用。紫單胞菌科、Catabacteriaceae、克里斯滕森菌科、蛭弧菌科、蛭弧菌目（Bdellovibrionales）、厭氧原體科、厭氧原體目（Anaeroplasmatales）、柔膜菌綱（Mollicutes）對(duì)藏族兒童腸道菌群結(jié)構(gòu)組成起到重要的作用。圖2-3（a）稀釋曲線圖（b）Alpha多樣性指數(shù)箱體圖（注：每?jī)山M柱狀圖對(duì)應(yīng)的字母相abSamplesRarefactionCurvesabcabcabb

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]應(yīng)用焦磷酸測(cè)序技術(shù)對(duì)不同人群腸道微生物群落結(jié)構(gòu)的研究[D]. 郭壯.江南大學(xué) 2013

碩士論文
[1]健康人腸道微生物菌種TF01-11T的分類學(xué)研究[D]. 鄒遠(yuǎn)強(qiáng).華南理工大學(xué) 2016



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