本文關(guān)鍵詞：重癥急性呼吸道感染兒童中人博卡病毒和人腺病毒的分型檢測與分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的：了解重癥急性呼吸道感染(SARI)兒童中人博卡病毒(HBoV)和人腺病毒(HAdV)的感染狀況,流行病學(xué)特征、臨床特征及其進(jìn)化、重組特征。明確其流行株及其分子生物學(xué)特征,為相關(guān)疾病的防控及人博卡病毒與人腺病毒的分子流行病學(xué)研究提供參考。方法：2007年9月至2008年4月,從浙江省溫嶺醫(yī)院收集293份重癥社區(qū)獲得性肺炎(CAP)患兒的痰吸液(IS)；2008年5月至2010年3月,從北京兒童醫(yī)院收集259份重癥急性呼吸道感染(SARI)患兒鼻咽抽吸物(NPAs)；以及2013年6月至2014年3月從上海復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院收集441份SARI患兒NPAs。采用巢式聚合酶鏈反應(yīng)(Nested-PCR)的方法,對所收集的樣品進(jìn)行人博卡病毒和人腺病毒的分型檢測。并隨機(jī)選取兩株人博卡病毒陽性樣品,采用PCR的方法,覆蓋全長包含重疊區(qū)域的分段擴(kuò)增,進(jìn)行人博卡病毒全基因序列的擴(kuò)增,從全基因水平進(jìn)行人博卡病毒進(jìn)化與突變情況的分析。對人腺病毒進(jìn)行特殊型別病毒分離、純化及鑒定,結(jié)構(gòu)基因編碼區(qū)序列使用PCR的方法擴(kuò)增,全基因序列通過二代測序的方法獲得,從而對其進(jìn)行相關(guān)分子流行病學(xué)、進(jìn)化、重組特征的分析。結(jié)果：第一部分人博卡病毒的分型檢測與基因進(jìn)化、突變分析分型檢測結(jié)果。從993份呼吸道樣品中,共檢出HBoV陽性200份,陽性率為20.1%(95%CI：17.3%-22.9%),北京、上海與溫嶺HBoV陽性率分別為21.6%(56/259,95%CI：16.0%-27.3%)、17.7%(78/441,95%CI：13.8%～21.6%)及22.5%(66/293,95%CI：17.1%-28.0%),不同地區(qū)間HBoV陽性率差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。HBoV陽性樣品中,98.5%(197/200)為HBoV1, HBoV2檢出1例、HBoV3檢出2例。且HBoV與其他呼吸道常見病毒存在較高的合并感染率(63.6%～94.6%)。流行病學(xué)特征與臨床表現(xiàn)。HBoV感染情況在性別分布上差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,年齡分布上以6個(gè)月至2歲之間兒童易感(P0.05),季節(jié)分布上以秋冬及冬春季高發(fā)。臨床表現(xiàn)上患兒均表現(xiàn)為呼吸道感染的常見癥狀,且不同臨床癥狀在人博卡病毒感染者與非感染者中差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義�；蚪M分析。全基因序列與編碼區(qū)序列的進(jìn)化與突變分析發(fā)現(xiàn),該病毒基因序列較為保守,且VP1/VP2區(qū)與全基因水平的進(jìn)化分析結(jié)果一致。第二部分 人腺病毒的分型檢測與進(jìn)化重組分析分型檢測結(jié)果。993份呼吸道樣品中檢出HAdV陽性共127份,陽性率為12.8%(95%CI：10.6%～15.0%),北京、上海與溫嶺HAdV陽性率分別為20.1%(52/259,95%CI:14.6%～25.5%)、11.6%(51/441,95%CI：8.4%～14.7%)及8.2%(24/293,95%CI：4.9%～11.5%),北京地區(qū)HAdV的陽性率明顯高于溫嶺與上海(P0.0001)。HAdV陽性樣品中,北京兒童醫(yī)院HAdV-B占65.4%(34/52,95%CI：43.4%～87.4%),HAdV-C占32.7%(17/52,95%CI：17.2%～48.2%),HAdV-D 1份,并首次從呼吸道樣品中檢出HAdV-37與HAdV-57型；上海復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院HAdV-B組共33例(64.7%,95%CI：42.6%～82.8%),HAdV-C組共14例(27.5%,95%CI：13.1%～41.8%),HAdV-D(HAdV-8)與HAdV-E(HAdV-4)各1例；HAdV-F (HAdV-41)檢出2例。而溫嶺醫(yī)院C組占83.3%(20/24,95%CI：46.8%～100%),B組占12.5%(3/24,95%CI：0～26.6%),E組1份。且HAdV與其他呼吸道常見病毒存在較高的合并感染率(64.7%～90.4%),與呼吸道合胞病毒(RSV)、鼻病毒(HRV)及HBoV混合感染最為常見。流行病學(xué)特征與臨床表現(xiàn)。HAdV感染在性別分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,年齡分布上以6個(gè)月到2歲兒童易感(P0.05),季節(jié)分布上以冬春季高發(fā)。另外,不同的臨床癥狀在HAdV感染者與非感染者中差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義�；蜻M(jìn)化與重組分析。對該病毒分型檢測發(fā)現(xiàn)的特殊型別(HAdV-2/6)進(jìn)行病毒純化與鑒定后,進(jìn)行結(jié)構(gòu)基因及全基因的擴(kuò)增,對獲得的序列進(jìn)行進(jìn)化與重組分析后發(fā)現(xiàn),該病毒分離株存在重組現(xiàn)象,是HAdV-C所有型別(HAdV-1、HAdV-2、HAdV-5、HAdV-6)的重組株。結(jié)論：本研究獲得了SARI兒童中HBoV與HAdV基本的流行病學(xué)特征,及不同地區(qū)的流行株,為相關(guān)疾病的防控與治療提供參考與指導(dǎo)。另外,人博卡病毒序列較為保守,VP1/VP2區(qū)與全基因進(jìn)化一致可作為基因分型區(qū)進(jìn)行HBoV的分型檢測。另外,本研究首次從呼吸道樣品中檢測到HAdV-37與HAdV-57,且分離出一株HAdV-C(HAdV-1、-2、-5及HAdV-6)的重組株。
【關(guān)鍵詞】：重癥急性呼吸道感染 人博卡病毒 人腺病毒 流行病學(xué)、進(jìn)化、重組分析
【學(xué)位授予單位】：中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R725.1;R440
【目錄】：

• 英文縮略詞表7-8
• 中文摘要8-10
• 英文摘要10-13
• 第一章 前言13-23
• 1.1 人博卡病毒13-16
• 1.1.1 人博卡病毒的發(fā)現(xiàn)13
• 1.1.2 人博卡病毒分子生物學(xué)特征13-14
• 1.1.3 人博卡病毒實(shí)驗(yàn)室檢測方法14
• 1.1.4 呼吸道感染人博卡病毒研究現(xiàn)狀14-16
• 1.2 人腺病毒16-21
• 1.2.1 人腺病毒的發(fā)現(xiàn)16
• 1.2.2 人腺病毒的分子生物學(xué)特點(diǎn)16-19
• 1.2.3 HAdV感染與疾病的關(guān)系19-20
• 1.2.4 呼吸道感染人腺病毒研究現(xiàn)狀20-21
• 1.3 本研究的目的和意義21-23
• 第二章 材料與方法23-44
• 2.1 實(shí)驗(yàn)材料23-25
• 2.1.1 檢測樣品23-24
• 2.1.2 陽性對照標(biāo)本及引物24
• 2.1.3 主要試劑24-25
• 2.1.4 主要儀器與耗材25
• 2.1.5 相關(guān)軟件25
• 2.2 實(shí)驗(yàn)方法25-44
• 2.2.1 病毒核酸提取25-26
• 2.2.2 陽性對照的制備26-29
• 2.2.3 分型檢測29-31
• 2.2.4 其他呼吸道病毒的檢測31
• 2.2.5 HBoV全基因序列的獲得31-33
• 2.2.6 HAdV細(xì)胞分離、純化及鑒定33-38
• 2.2.7 HAdV分離株主要結(jié)構(gòu)基因與全長基因的擴(kuò)增38-39
• 2.2.8 分型分析39-42
• 2.2.9 HBoV的系統(tǒng)進(jìn)化與突變分析42
• 2.2.10 HAdV的系統(tǒng)進(jìn)化與重組分析42-43
• 2.2.11 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析43-44
• 第三章 結(jié)果與討論44-76
• 第一部分 HBoV分型檢測與分析44-55
• 3.1.1 HBoV分型檢測結(jié)果44-48
• 3.1.2 HboV感染的流行病學(xué)特征與臨床表現(xiàn)48-50
• 3.1.3 HBoV系統(tǒng)進(jìn)化與突變分析50-53
• 3.1.4 討論53-55
• 第二部分 人腺病毒的分型檢測、分離及基因多態(tài)性分析55-76
• 3.2.1 HAdV的分型檢測結(jié)果55-62
• 3.2.2 HAdV感染的流行病學(xué)與臨床特征62-64
• 3.2.3 HAdV病毒分離結(jié)果64-66
• 3.2.4 HAdV進(jìn)化與重組特征66-73
• 3.2.5 討論73-76
• 第四章 全文總結(jié)76-77
• 參考文獻(xiàn)77-85
• 附錄85-94
• 發(fā)表綜述94-106
• 參考文獻(xiàn)103-106
• 致謝106-107
• 個(gè)人簡歷107
• 攻讀碩士期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文107

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中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 羅迪賢;劉巧突;林應(yīng)標(biāo);戴國知;夏承來;何志雄;張治明;許燦新;廖端芳;;人類博卡病毒基因組序列與進(jìn)化分析[J];實(shí)用預(yù)防醫(yī)學(xué);2006年06期

2 林峰;;人博卡病毒感染的研究進(jìn)展[J];病毒學(xué)報(bào);2007年02期

3 傅希;伍嚴(yán)安;;博卡病毒的研究進(jìn)展[J];醫(yī)學(xué)綜述;2007年15期

4 嚴(yán)華杰;盛軍;董蔚;管麗華;王蔚;王凱;任培君;邵潔;;上海嘉定地區(qū)連續(xù)3年兒童人博卡病毒感染的研究[J];臨床兒科雜志;2010年06期

5 陳倩;胡正;;人博卡病毒的研究進(jìn)展[J];中國當(dāng)代兒科雜志;2010年08期

6 李建寧;姚青;孫玉寧;;博卡病毒屬基因組特征與致病的分子機(jī)制[J];微生物學(xué)報(bào);2013年05期

7 何濤君;王瓊;何英;黃烈;張銀輝;林廣裕;陸學(xué)東;;采用半巢式PCR技術(shù)從臨床標(biāo)本中克隆人類博卡病毒的全基因[J];國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志;2014年01期

8 林峰;曾愛平;楊寧敏;林海燕;鄭昌華;李樺;陳弘;李旭陽;郁明素;楊寶順;金大智;;小兒人博卡病毒感染臨床與實(shí)驗(yàn)研究[J];醫(yī)學(xué)研究雜志;2006年09期

9 黃頭華;;我國醫(yī)學(xué)界首次發(fā)現(xiàn)人類博卡病毒[J];中國醫(yī)藥指南;2006年09期

10 鄭敏巧;林峰;鄭美云;陳弘;曾愛平;吳峰;;人博卡病毒母嬰感染的臨床前瞻性研究[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;2007年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 曹虹;彭亮;;新型微小病毒——人類博卡病毒[A];新發(fā)和再發(fā)傳染病防治熱點(diǎn)研討會論文集[C];2009年

2 林峰;曾愛平;楊寧敏;林海燕;鄭昌華;李樺;陳弘;李旭陽;郁明素;金大智;王升啟;;小兒博卡病毒感染的臨床與實(shí)驗(yàn)研究[A];2006（第三屆）江浙滬兒科學(xué)術(shù)會議暨浙江省兒科學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2006年

3 林峰;曾愛平;林海燕;鄭昌華;李樺;陳弘;李旭陽;郁明素;楊寧敏;金大智;王升啟;;小兒博卡病毒感染的臨床與實(shí)驗(yàn)研究[A];中華醫(yī)學(xué)會第十四次全國兒科學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2006年

4 陸學(xué)東;林廣裕;周仁彬;王瓊;林創(chuàng)興;楊來智;陸長東;;廣東地區(qū)首例人博卡病毒的檢出及鑒定[A];中華醫(yī)學(xué)會第七次全國檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會議資料匯編[C];2008年

5 王婷;李昌崇;陳小芳;聶穎;崇蕾;;溫州地區(qū)人博卡病毒在急性喘息患兒中的檢測及其病毒載量與疾病嚴(yán)重程度的相關(guān)分析[A];2012年江浙滬兒科學(xué)術(shù)年會暨浙江省醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會學(xué)術(shù)年會、兒內(nèi)科疾病診治新進(jìn)展國家級學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2012年

6 林峰;;人博卡病毒感染支氣管上皮細(xì)胞的生物學(xué)特征研究[A];2008年浙江省兒科學(xué)學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2008年

7 王婷;李昌崇;陳小芳;聶穎;崇蕾;;溫州地區(qū)人博卡病毒在急性喘息患兒中的檢出及其病毒載量與疾病嚴(yán)重程度的相關(guān)分析[A];中華醫(yī)學(xué)會第十三屆全國兒科呼吸學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2012年

8 李芳;孫玉寧;張茜;蘆曉紅;;博卡病毒MVC在不同種屬細(xì)胞系病毒基因組復(fù)制及感染特性分析[A];中國的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進(jìn)步推動中國西部經(jīng)濟(jì)與社會發(fā)展——2011年中國遺傳學(xué)會大會論文摘要匯編[C];2011年

9 何彪;楊凡力;涂長春;;中國蝙蝠病毒宏基因組學(xué)研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會獸醫(yī)公共衛(wèi)生學(xué)分會第三次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2012年

10 王維;林書祥;黃敬孚;徐曉華;;天津地區(qū)嬰幼兒腹瀉博卡病毒的檢出及鑒定[A];中華醫(yī)學(xué)會第十七次全國兒科學(xué)術(shù)大會論文匯編（上冊）[C];2012年

中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前7條

1 記者　 鄧明 通訊員　 白培生 劉巧突;郴州在國內(nèi)首次發(fā)現(xiàn)人類博卡病毒[N];湖南日報(bào);2006年

2 記者 吳德群;口岸連查4宗 人感染博卡病毒[N];深圳特區(qū)報(bào);2012年

3 陳茂j 趙斌;溫嶺市一院在我國首次發(fā)現(xiàn)人博卡病毒[N];中國醫(yī)藥報(bào);2006年

4 記者 王理略 通訊員 任麗瓊;首次克隆出人博卡病毒全基因組[N];湖北日報(bào);2014年

5 貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院 郝飛 湯德元;豬博卡病毒研究進(jìn)展[N];河北科技報(bào);2012年

6 記者　 龍軍;我國首次發(fā)現(xiàn)人類博卡病毒HBoV[N];光明日報(bào);2006年

7 洪衛(wèi) 張敏;迎接照耀醫(yī)學(xué)高峰的新曙光[N];浙江日報(bào);2006年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 李雪萌;博卡病毒感染的檢測和原始抗原效應(yīng)的相關(guān)研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 程衛(wèi)霞;博卡病毒流行病學(xué)、致病性及基因進(jìn)化研究[D];蘭州大學(xué);2011年

3 趙慧;兒童腹瀉相關(guān)的人博卡病毒2型的初步研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2013年

4 鄧雪鋒;人類博卡病毒感染性克隆的構(gòu)建及體外感染模型的研究[D];華中師范大學(xué);2013年

5 李京京;人類博卡病毒HBoV1基因組克隆及轉(zhuǎn)錄、翻譯分子機(jī)制研究[D];華中師范大學(xué);2012年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 黃寶慧;豬博卡病毒NP08株的基因組序列分析及其對豬腸上皮細(xì)胞的影響[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 鄭英帥;豬博卡病毒間接ELISA診斷方法的建立[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

3 劉萌萌;屠宰豬博卡病毒全基因序列測定及檢測技術(shù)研究[D];天津大學(xué);2014年

4 李亞敏;重癥急性呼吸道感染兒童中人博卡病毒和人腺病毒的分型檢測與分析[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2015年

5 馬均;兒童急性呼吸道感染人博卡病毒檢測及分析[D];吉林大學(xué);2009年

6 梁丹丹;小兒呼吸道人類博卡病毒感染免疫致病機(jī)制的初步研究[D];汕頭大學(xué);2011年

7 楊晚竹;豬博卡病毒分子生物學(xué)特征及感染性克隆構(gòu)建的初步探索[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2012年

8 漆正宇;我國人博卡病毒的分子流行病學(xué)及衣殼蛋白獨(dú)有區(qū)表達(dá)純化的研究[D];貴州大學(xué);2007年

9 韓虎;人博卡病毒結(jié)構(gòu)蛋白與非結(jié)構(gòu)蛋白功能的初步研究[D];華中師范大學(xué);2012年

10 李紅學(xué);人博卡病毒在健康獻(xiàn)漿人群中的基因組和血清學(xué)抗體流行情況研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

  本文關(guān)鍵詞：重癥急性呼吸道感染兒童中人博卡病毒和人腺病毒的分型檢測與分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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