目的:本研究旨在通過高通量測序技術(shù)對先天性馬蹄內(nèi)翻足（congenital talipes equinovarus,CTEV）患兒血漿行全轉(zhuǎn)錄組測序,比較CTEV患兒血漿與正常兒童血漿的mRNA、lncRNA、circRNA以及miRNA的表達(dá)譜,以確定差異表達(dá)基因和轉(zhuǎn)錄本,揭示先天性馬蹄內(nèi)翻足發(fā)展過程中可能存在的信號通路,為后續(xù)研究提供分子生物學(xué)基礎(chǔ)。研究方法:1 RNA測序選取3例CTEV患兒（實(shí)驗(yàn)組）及3例正常兒童（對照組）血漿樣品提取總RNA進(jìn)行RNA測序。應(yīng)用RNA測序全面分析3對血漿樣品的轉(zhuǎn)錄組,篩選出CTEV患兒與正常兒童的差異表達(dá)基因與轉(zhuǎn)錄本�；诨虮磉_(dá)水平對差異表達(dá)基因進(jìn)行 GO（gene ontology）功能顯著性富集分析、KEGGPathway（kyoto encyclopedia of genes and genomes）顯著性富集分析。2 qRT-PCR 驗(yàn)證應(yīng)用qRT-PCR方法檢測20例CTEV患兒和13例正常兒童樣品中目標(biāo)差異基因的表達(dá)情況,以期驗(yàn)證測序結(jié)果。3統(tǒng)計分析應(yīng)用Prism 8.2.0統(tǒng)計學(xué)軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,采用t檢驗(yàn)方法分析目的基因的相... 

【文章來源】：中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．顯著差異表達(dá)基因聚類熱圖??

?中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文???ｔｅｓｔ?ｖｓ?ＣＫ??ｐｅａｒｓｏｎ?ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ：?０．３６３??２〇．?？?ｕｐ＿ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?（１９４４）??？?ｎｏｔ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?（３１４７）?，＇?／??？?ｄｏｗｎ＿ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?（７５００）?／?／??１５－?，’?／??１，０．??？?＊??．．．．?ＶＶ－．?？？??ＩＰ：??０?５?１０?１５?２０??ＣＫ??＿?２．箬異．基猶散點(diǎn)圖??Ｘ軸和Ｙ軸表示各組樣本基因乎均值ＦＰＫＭ值（ｌｏｇ２轉(zhuǎn)化），紅點(diǎn)代表上調(diào)差異表達(dá)基??國，綠點(diǎn)代表下調(diào)差異表達(dá)基因，灰點(diǎn)代表無差異基因，兩條斜虛線劃出上、下調(diào)基固（１．５??ｆ差異）和未變基因的界限??ｔｅｓｔ?ｖｓ?ＣＫ??？?ｕｐ一ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?（５８）??？?ｎｏｔ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?（１２４１０）??？?ｄｏｗｎ＿ｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?（１２３）??纖??－５?０?５??ｌｏｇ２（Ｆｏｌｄ?Ｃｈａｎｇｅ）??圖３．差異表達(dá)基通火山圖??Ｘ軸表示ｌ〇ｇ２ＦＣ值，Ｙ軸表示縱向２條綠線分別為上調(diào)（右側(cè)）和下調(diào)（：左??側(cè)），綠色平行線對應(yīng)戶值５録點(diǎn)代表差異顯著的下調(diào)基因，紅點(diǎn)代表差異顯．著的上調(diào)基??＇因，灰點(diǎn)代表非顯著差異基囡。??１２??

?中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文???Ｉ?＇?ｒ—ｎ?Ｉ?＇?ｒ＾ｎ??＝１?Ｇｒｏｕｐ??ｇ?§?ｇ?Ｍ?＾?Ｗ??圖４．顯著差異表達(dá)ｍｉＲＮＡ聚類熱圖??每行代表一個ｍｉＲＮＡ，每列代表一個樣本，紅色代表上調(diào)顯著差異表達(dá)ｍｉＲＮＡ，綠色??代表下調(diào)顯著差異表達(dá)ｍｉＲＮＡ。??１４??


本文編號：3367762