長鏈非編碼RNA Tug1與新生大鼠肺發(fā)育的關(guān)系及其潛在作用機(jī)制的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-21 15:08
目的:支氣管肺發(fā)育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)是一種早產(chǎn)兒中非常常見的并發(fā)癥。伴隨著圍產(chǎn)醫(yī)學(xué)的迅速發(fā)展,呼吸支持策略的不斷優(yōu)化,肺表面活性物質(zhì)的及時(shí)應(yīng)用,極低和超低出生體重兒的存活率逐漸升高,而BPD的發(fā)病率也逐年上升。其遺留的短期或長期不良結(jié)局不僅會(huì)給患兒的生命和生活質(zhì)量帶來影響,還會(huì)給患兒的家庭乃至整個(gè)社會(huì)帶來沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。新型BPD的發(fā)生與肺發(fā)育不成熟有著密切的關(guān)系,胎齡小,出生體重低的早產(chǎn)兒更易患BPD。胚胎肺發(fā)育分為五個(gè)時(shí)期,其中肺泡期為肺泡發(fā)育成熟的關(guān)鍵時(shí)期,大多數(shù)早產(chǎn)兒出生時(shí)肺發(fā)育處于囊泡期,肺部解剖結(jié)構(gòu)及生理功能尚不成熟,極易受高氧、機(jī)械通氣壓力等因素的影響,使肺泡發(fā)育進(jìn)程受阻,表現(xiàn)為肺發(fā)育停滯、肺泡簡單化和肺小血管發(fā)育不良。近年,有研究證實(shí)lncRNA可以與轉(zhuǎn)錄因子相互作用參與肺發(fā)育的調(diào)控及BPD的發(fā)生發(fā)展。LncRNA Tug1是一個(gè)與發(fā)育相關(guān)的指標(biāo),已被證實(shí)在大腦皮層、神經(jīng)元及視網(wǎng)膜發(fā)育中扮演重要角色。但是Tug1與肺發(fā)育的關(guān)系尚未有相關(guān)報(bào)道。本研究通過生物信息學(xué)分析、PCR、WB、相關(guān)性分析與Chirp-MS等方法,旨在...
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
基因差異表達(dá)火山圖
GO與KEGG分析
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文143.3肺組織與肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞發(fā)育相關(guān)基因分析GEO數(shù)據(jù)庫中選取肺組織和肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)集(GSE20954、GSE49346)(表3),以成年期為對照組,胚胎18天為實(shí)驗(yàn)組,利用GEO2R以P<0.05且|logFC|≥0.9為標(biāo)準(zhǔn)計(jì)算差異表達(dá)基因(圖5)。兩個(gè)數(shù)據(jù)集所得結(jié)果與32個(gè)基因取交集得到14個(gè)與包括肺組織及肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞在內(nèi)的7種不同組織細(xì)胞共同存在的差異表達(dá)基因(圖6),其中有五個(gè)基因:Tug1、Fubp1、Smarca1、Meg3及Igf2bp3在新生兒期的表達(dá)均高于成年期(圖7)。Tug1在胚胎18天的肺組織和肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞的表達(dá)均高于成年期表達(dá)的1.5倍(表4)。圖5.差異表達(dá)基因火山圖A:GSE20954小鼠肺組織成年期VS胚胎18天B:GSE49346小鼠肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞成年期VS胚胎18天表4.Tug1在兩個(gè)數(shù)據(jù)集中的logFC值DatasetsP.ValuelogFCGSE493463.13E-020.992GSE209545.37E-050.8455
本文編號:3355834
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
基因差異表達(dá)火山圖
GO與KEGG分析
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文143.3肺組織與肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞發(fā)育相關(guān)基因分析GEO數(shù)據(jù)庫中選取肺組織和肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)集(GSE20954、GSE49346)(表3),以成年期為對照組,胚胎18天為實(shí)驗(yàn)組,利用GEO2R以P<0.05且|logFC|≥0.9為標(biāo)準(zhǔn)計(jì)算差異表達(dá)基因(圖5)。兩個(gè)數(shù)據(jù)集所得結(jié)果與32個(gè)基因取交集得到14個(gè)與包括肺組織及肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞在內(nèi)的7種不同組織細(xì)胞共同存在的差異表達(dá)基因(圖6),其中有五個(gè)基因:Tug1、Fubp1、Smarca1、Meg3及Igf2bp3在新生兒期的表達(dá)均高于成年期(圖7)。Tug1在胚胎18天的肺組織和肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞的表達(dá)均高于成年期表達(dá)的1.5倍(表4)。圖5.差異表達(dá)基因火山圖A:GSE20954小鼠肺組織成年期VS胚胎18天B:GSE49346小鼠肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞成年期VS胚胎18天表4.Tug1在兩個(gè)數(shù)據(jù)集中的logFC值DatasetsP.ValuelogFCGSE493463.13E-020.992GSE209545.37E-050.8455
本文編號:3355834
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