自閉癥與腦發(fā)育及基因組印跡的相關(guān)性分析
發(fā)布時(shí)間:2021-02-02 19:26
自閉癥譜系障礙(Autism Spectrum Disorder,ASD)簡(jiǎn)稱自閉癥,與孤獨(dú)癥同義,是一組以社交和言語(yǔ)交流缺陷、興趣狹窄及重復(fù)刻板的行為模式為特征的神經(jīng)發(fā)育障礙性疾病。流行病學(xué)估計(jì)ASD的患病率高達(dá)1%。近年來(lái),基因組學(xué)技術(shù)的進(jìn)步和大規(guī)模的人群研究促進(jìn)了ASD易感基因的發(fā)現(xiàn),目前基因數(shù)目已超過(guò)1000個(gè)。然而單個(gè)基因至多解釋1%-2%的患者,揭示ASD的高度遺傳異質(zhì)性;蚪M印跡是基因根據(jù)親本來(lái)源的不同而呈現(xiàn)單等位基因表達(dá)的一種表觀遺傳現(xiàn)象。許多印跡基因在維持胎盤(pán)發(fā)育、調(diào)節(jié)胎兒生長(zhǎng)、代謝、神經(jīng)功能及社交行為等方面充當(dāng)至關(guān)重要的作用。研究發(fā)現(xiàn)印跡基因的異常表達(dá)會(huì)引發(fā)一些認(rèn)知相關(guān)的疾病,包括自閉癥。神經(jīng)病理學(xué)研究表明自閉癥患者的腦呈現(xiàn)多種類型的畸形,包括皮質(zhì)發(fā)育不良、異位和神經(jīng)形態(tài)異常。腦成像研究發(fā)現(xiàn)腦容量過(guò)度增長(zhǎng)與自閉癥的發(fā)生及社交缺陷嚴(yán)重程度有關(guān)。本課題旨在從腦發(fā)育和基因組印跡的角度探索自閉癥。首先我們系統(tǒng)地收集文獻(xiàn)已報(bào)道的所有自閉癥相關(guān)的基因及印跡基因,將獲得的1905個(gè)自閉癥相關(guān)基因和229個(gè)印跡基因定位到染色體上,實(shí)現(xiàn)可視化;瑒(dòng)窗口及統(tǒng)計(jì)分析表明印跡基因與自閉癥...
【文章來(lái)源】:東南大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
主要縮略詞表
前言
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 自閉癥
1.1.1 自閉癥的定義及診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.1.2 自閉癥的流行病學(xué)
1.1.3 自閉癥的診斷量表
1.1.4 自閉癥的影響因素
1.2 基因組印跡與自閉癥
1.2.1 基因組印跡的定義
1.2.2 印跡的建立、維持與消除
1.2.3 印跡基因的表達(dá)特征
1.2.4 印跡基因與發(fā)育相關(guān)疾病
1.3 腦發(fā)育與自閉癥
1.3.1 人腦的發(fā)育過(guò)程
1.3.2 人腦的成熟過(guò)程
1.3.3 腦發(fā)育與自閉癥
第二章 材料與方法
2.1 數(shù)據(jù)收集
2.1.1 自閉癥相關(guān)基因的收集與整理
2.1.2 印跡基因的收集與整理
2.1.3 正常人腦芯片數(shù)據(jù)的收集
2.2 自閉癥相關(guān)基因的富集分析
2.3 自閉癥相關(guān)基因和印跡基因的相關(guān)性分析
2.3.1 自閉癥相關(guān)基因和印跡基因可視化
2.3.2 滑動(dòng)窗口的實(shí)現(xiàn)
2.4 正常人腦的基因表達(dá)譜分析
2.4.1 芯片數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.4.2 芯片差異表達(dá)值的篩選
2.5 正常人腦差異基因、印跡基因和自閉癥相關(guān)基因的功能分析
2.5.1 基因的表達(dá)軌跡分析
2.5.2 基因間相互作用的預(yù)測(cè)
2.6 數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建
第三章 結(jié)果與討論
3.1 自閉癥相關(guān)基因的富集分析
3.1.1 自閉癥相關(guān)基因的GO分析
3.1.2 自閉癥相關(guān)基因的KEGG分析
3.1.3 自閉癥相關(guān)基因的染色體富集分析
3.1.4 自閉癥相關(guān)基因的人類疾病富集分析
3.2 自閉癥相關(guān)基因與印跡基因的關(guān)聯(lián)分析
3.3 正常人腦的基因表達(dá)譜分析
3.4 自閉癥相關(guān)基因、印跡基因與腦差異表達(dá)基因的分析
3.4.1 自閉癥、印跡與腦差異共同基因的表達(dá)軌跡分析
3.4.2 自閉癥、印跡與腦差異共同基因的相互作用預(yù)測(cè)
3.5 數(shù)據(jù)庫(kù)
3.6 討論
3.7 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3015246
【文章來(lái)源】:東南大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
主要縮略詞表
前言
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 自閉癥
1.1.1 自閉癥的定義及診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.1.2 自閉癥的流行病學(xué)
1.1.3 自閉癥的診斷量表
1.1.4 自閉癥的影響因素
1.2 基因組印跡與自閉癥
1.2.1 基因組印跡的定義
1.2.2 印跡的建立、維持與消除
1.2.3 印跡基因的表達(dá)特征
1.2.4 印跡基因與發(fā)育相關(guān)疾病
1.3 腦發(fā)育與自閉癥
1.3.1 人腦的發(fā)育過(guò)程
1.3.2 人腦的成熟過(guò)程
1.3.3 腦發(fā)育與自閉癥
第二章 材料與方法
2.1 數(shù)據(jù)收集
2.1.1 自閉癥相關(guān)基因的收集與整理
2.1.2 印跡基因的收集與整理
2.1.3 正常人腦芯片數(shù)據(jù)的收集
2.2 自閉癥相關(guān)基因的富集分析
2.3 自閉癥相關(guān)基因和印跡基因的相關(guān)性分析
2.3.1 自閉癥相關(guān)基因和印跡基因可視化
2.3.2 滑動(dòng)窗口的實(shí)現(xiàn)
2.4 正常人腦的基因表達(dá)譜分析
2.4.1 芯片數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.4.2 芯片差異表達(dá)值的篩選
2.5 正常人腦差異基因、印跡基因和自閉癥相關(guān)基因的功能分析
2.5.1 基因的表達(dá)軌跡分析
2.5.2 基因間相互作用的預(yù)測(cè)
2.6 數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建
第三章 結(jié)果與討論
3.1 自閉癥相關(guān)基因的富集分析
3.1.1 自閉癥相關(guān)基因的GO分析
3.1.2 自閉癥相關(guān)基因的KEGG分析
3.1.3 自閉癥相關(guān)基因的染色體富集分析
3.1.4 自閉癥相關(guān)基因的人類疾病富集分析
3.2 自閉癥相關(guān)基因與印跡基因的關(guān)聯(lián)分析
3.3 正常人腦的基因表達(dá)譜分析
3.4 自閉癥相關(guān)基因、印跡基因與腦差異表達(dá)基因的分析
3.4.1 自閉癥、印跡與腦差異共同基因的表達(dá)軌跡分析
3.4.2 自閉癥、印跡與腦差異共同基因的相互作用預(yù)測(cè)
3.5 數(shù)據(jù)庫(kù)
3.6 討論
3.7 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3015246
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