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Fzd6在兒童急性T淋巴細胞白血病中的異常表達及對預后的影響

發(fā)布時間:2020-06-21 01:41
【摘要】:目的:急性淋巴細胞白血病(ALL)是兒童最常見的惡性腫瘤疾病,根據(jù)受累的淋巴細胞類型不同可分為急性B淋巴細胞白血病(B-ALL)和急性T淋巴細胞白血病(T-ALL)。其中,T-ALL僅占約10%~15%的兒童ALL,但其5年生存率僅60%~75%。因此,闡釋新的T-ALL發(fā)病機制及增加有效評估患兒預后的指標將有助于改進治療方案,提高患兒生存率。方法:本研究通過提取13例T-ALL病人骨髓樣本及4例對照樣本單個核細胞RNA,進行全轉錄組測序,分析測序數(shù)據(jù),繪制熱圖、采用GO分析、KEGG信號通路,篩選出病人樣本中表達增高的Wnt信號通路相關Fzd6基因;分析GEO數(shù)據(jù)庫全球多中心數(shù)據(jù)中T-ALL的Fzd6基因表達;采用實時熒光定量PCR、Western-blot和免疫熒光檢測T-ALL病人標本和T-ALL細胞株(Jurkat、CCRF-CEM、Molt4以及Cutll1)的Fzd6蛋白表達水平;收集40例T-ALL患兒從確診到2019年3月病歷資料,統(tǒng)計患兒復發(fā)率及總生存率,繪制生存曲線分析Fzd6對T-ALL患兒預后的影響。結果:通過分析全轉錄組測序數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)與對照組相比,T-ALL病人骨髓細胞中Wnt通路相關基因Fzd1、Fzd2、Fzd6表達分別增高7倍、16倍和13倍,Fzd3表達下降5倍;全球多中心數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)顯示T-ALL中Fzd6表達增高;采用實時熒光定量PCR檢測14例T-ALL病人樣本及T-ALL細胞株(Jurkat、CCRF-CEM、Molt4、Cutll1)的基因表達水平,發(fā)現(xiàn)僅Fzd6變化趨勢與測序結果一致,采用Western-blot和免疫熒光檢測T-ALL細胞株中Fzd6蛋白表達水平,發(fā)現(xiàn)其表達水平較正常T細胞增高;統(tǒng)計分析40例T-ALL患兒從確診到2019年3月病歷資料,發(fā)現(xiàn)在MRD陽性的24例患兒中,Fzd6表達增高的患兒預后較差。結論:Fzd6在兒童T-ALL中表達增高,高表達Fzd6的T-ALL患兒預后差。
【學位授予單位】:重慶醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R733.71
【圖文】:

信號通路,差異表達,對照組,數(shù)據(jù)顯示


15圖 1-1 T-ALL 與對照組中差異表達 GPCR 及 關信號通路Figure 1-1 Differential expression of GPCR and related signal pathways in T-ALLa): The heatmap of differential expression GPCRs; b): GO analysis of differential expressionGPCRs ; c): KEGG pathway analysis of differential expression GPCRs. *, p<0.05 vs Ctrl; ** ,p<0.01 vs Ctrl.2.4 GEO 數(shù)據(jù)顯示 Wnt 信號通路相關基因在 T-ALL 中表達增加

數(shù)據(jù)庫,對照組,無差異,樣本


重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文在 70 個差異表達的 GPCR 基因中,參與 Wnt 信號通路的 GPCR 有 4 個,分別為 Fzd1、Fzd2、Fzd3 和 Fzd6。其中,F(xiàn)zd1、Fzd2 和 Fzd6 在 T-ALL 中均較對照組表達增加,而 Fzd3 較對照組表達降低(圖 1-1 a)。為進一步驗證上述 4 個 GPCR基因在 T-ALL 中的表達情況,本研究通過檢索 GEO 數(shù)據(jù)庫全球多中心數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)在 GSE26713 數(shù)據(jù)庫中與 7 例正常樣本相比,117 例 T-ALL 樣本中 Fzd1、Fzd2 及Fzd3 表達無差異,而 Fzd6 表達增加,差異有統(tǒng)計學意義(p<0.0001,圖 1-2);在 GSE66638 數(shù)據(jù)庫中與 2 例正常樣本相比,8 例 T-ALL 樣本中 Fzd1 和 Fzd2 表達無差異,F(xiàn)zd3 表達下降 (p=0.0089,圖 1.3 c),F(xiàn)zd6 表達增加 (p=0.0115,圖 1-3d)。

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本文編號:2723294

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